More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2483 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 359 aa  715    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 		 327 aa  260  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  45.77 
 
 		 289 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  42.36 
 
 		 290 aa  252  6e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  37.63 
 
 		 285 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  37.98 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  36.81 
 
 		 289 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  35.82 
 
 		 309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1173  alpha/beta hydrolase fold  34.68 
 
 		 296 aa  126  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.95564  decreased coverage  0.000000135804 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2119  alpha/beta hydrolase fold  34.01 
 
 		 296 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5976  alpha/beta hydrolase fold  34.01 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2101  alpha/beta hydrolase fold  34.01 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  32.43 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5407  Alpha/beta hydrolase  34.24 
 
 		 296 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 289 aa  122  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2011  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219515 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2138  alpha/beta hydrolase fold  33 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  32.53 
 
 		 289 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3251  alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 		 292 aa  119  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0874027  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1900  alpha/beta fold family hydrolase  32.55 
 
 		 296 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2571  alpha/beta fold family hydrolase  32 
 
 		 349 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1098  Alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 297 aa  116  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2704  alpha/beta fold family hydrolase  31.42 
 
 		 340 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 		 305 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1459  alpha/beta fold family hydrolase  31.42 
 
 		 296 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2625  alpha/beta fold family hydrolase  31.42 
 
 		 296 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3131  alpha/beta fold family hydrolase  31.42 
 
 		 296 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1684  alpha/beta fold family hydrolase  31.42 
 
 		 300 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2186  alpha/beta fold family hydrolase  31.42 
 
 		 296 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2554  alpha/beta hydrolase fold  31.79 
 
 		 294 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000366635  normal  0.152292 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  30.19 
 
 		 305 aa  113  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  29.84 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1579  putative hydrolase  31.13 
 
 		 294 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144323  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  30.49 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1135  putative hydrolase protein  31.39 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1433  alpha/beta hydrolase fold protein  32.78 
 
 		 302 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2772  putative hydrolase protein  32.09 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1062  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00192187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1153  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2699  alpha/beta hydrolase  28.52 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3775  alpha/beta hydrolase fold protein  29.71 
 
 		 309 aa  99.8  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1074  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 		 313 aa  100  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  26.41 
 
 		 282 aa  97.4  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  25.7 
 
 		 282 aa  94.4  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  29.02 
 
 		 2762 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0907  putative hydrolase  27.88 
 
 		 289 aa  90.9  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4953  alpha/beta hydrolase fold  35.47 
 
 		 360 aa  90.9  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1767  alpha/beta hydrolase fold  31.29 
 
 		 339 aa  90.1  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963183 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 		 325 aa  89.7  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  36.64 
 
 		 273 aa  87.8  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  41.44 
 
 		 272 aa  87.4  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1991  alpha/beta hydrolase fold protein  32.17 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534257  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01136  hydrolase, alpha/beta fold family protein  27.63 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2766  non-heme peroxidase  31.44 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  28.94 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2470  alpha/beta hydrolase  29.92 
 
 		 289 aa  82.4  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 		 299 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 		 299 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  32.64 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  24.69 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  27.57 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1589  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 		 343 aa  79.7  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  28.87 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  25.17 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  34.43 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 		 361 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0035  hypothetical protein  32.2 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  26.83 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  24.43 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 		 273 aa  75.9  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  23.79 
 
 		 287 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 		 285 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1898  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 300 aa  75.9  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033526 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 		 288 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 		 288 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 288 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  29.7 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  26.05 
 
 		 341 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1832  magnesium chelatase accessory protein  33.09 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2423  alpha/beta hydrolase fold protein  31.71 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.51 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1187  putative lipase  24.07 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  34.71 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13510  peroxidase bpoA (non-haem peroxidase)  28.03 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2128  alpha/beta hydrolase fold protein  32.23 
 
 		 356 aa  72.8  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  27.99 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  22.06 
 
 		 290 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  28.72 
 
 		 271 aa  72  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 		 294 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  33.11 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>