More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0934 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0934  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 365 aa  744    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0079  transcriptional regulator, AraC family  31.33 
 
 		 384 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1122  AraC family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 399 aa  119  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1107  AraC family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 398 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0681  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 357 aa  97.8  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4205  AraC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 382 aa  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.382392 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1106  AraC family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 388 aa  86.3  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54870  hypothetical protein  27.59 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000873444  unclonable  5.92488e-22 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4823  helix-turn-helix domain-containing protein  36.45 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802517  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1123  AraC family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 361 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408169  normal  0.947213 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5347  transcriptional regulator, AraC family  28.98 
 
 		 332 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.93449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0862  AraC family transcription regulator  32.06 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812854  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1585  AraC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2439  helix-turn-helix domain-containing protein  36.3 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.856689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2438  transcriptional regulator, AraC family  31.01 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000013643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7195  transcriptional regulator, AraC family  28.22 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3316  helix-turn-helix domain-containing protein  25.85 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606896  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0430  transcriptional regulator, AraC family  26.17 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1734  transcriptional regulator, AraC family  33.08 
 
 		 326 aa  79.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2126  transcriptional regulator, AraC family  29.19 
 
 		 325 aa  79  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000362922  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1207  transcriptional regulatory protein  22.86 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.654972  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2099  yersiniabactin transcriptional regulator YbtA  32.61 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0674  transcriptional regulator, AraC family  37.96 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6199  transcriptional regulator, AraC family  31.54 
 
 		 333 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224199  normal  0.145897 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1829  AraC family transcription regulator  32.5 
 
 		 323 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1575  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.03 
 
 		 325 aa  75.9  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000250184  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2581  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 319 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0247972  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5692  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0876  regulatory protein PchR  30.83 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2149  AraC family transcription regulator  30.83 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0183353  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1439  transcriptional regulator, AraC family  37.38 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.257773  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0786  regulatory protein PchR  30.83 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0862  AraC family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185798  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2680  transcriptional regulator, AraC family  35.14 
 
 		 329 aa  72.8  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0941  helix-turn-helix domain-containing protein  21.94 
 
 		 291 aa  72.4  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2338  AraC family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.438045  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2517  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.29 
 
 		 158 aa  71.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0308  transcriptional regulator, AraC family  42.17 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1428  helix-turn-helix domain-containing protein  27.1 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1813  transcription regulator protein  34.91 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.881353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3282  two component AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 535 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0423  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5929  two component AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0589  AraC family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.564804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6198  two component AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2358  AraC family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.738853  normal  0.890173 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3739  helix-turn-helix domain-containing protein  25.93 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.975676  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2225  AraC family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120601  normal  0.705003 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4321  helix-turn-helix domain-containing protein  26.22 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0895  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2411  transcriptional regulator, AraC family  23.62 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4364  transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196876  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5288  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 313 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0305089  normal  0.89359 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3954  helix-turn-helix domain-containing protein  35.09 
 
 		 354 aa  69.3  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0671  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3368  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 313 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4999  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 313 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0916348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5377  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.579005  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1473  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.35 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.844163  normal  0.308396 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  38.38 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1805  AraC family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1197  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00505676  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  31.63 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7377  two component AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0377301  normal  0.284562 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0873  transcriptional regulator PchR  30.84 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2415  transcriptional regulator, AraC family  29.25 
 
 		 368 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125553 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4250  transcriptional regulator, AraC family  29.91 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4154  AraC family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4270  helix-turn-helix domain-containing protein  31.19 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2694  AraC family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 310 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1456  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 320 aa  65.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6477  two component AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 277 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0923467 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 150 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3754  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 329 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5986  two component AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 277 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0117191 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 150 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  33.66 
 
 		 144 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 150 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  32.98 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6071  two component AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1611  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0879  AraC family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  36.9 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5621  two component AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 277 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289619  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09260  transcriptional regulator PchR  29.91 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.372084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0328  transcriptional regulator, AraC family  38.55 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0803  AraC family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2545  transcriptional regulator, AraC family  28.15 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  33.64 
 
 		 904 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6528  two component AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485144  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0072  transcriptional regulator, AraC family  26.63 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1001  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  38.1 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0991  transcriptional regulator, AraC family  29.63 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0397421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6350  two component AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787195  normal  0.900493 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6762  two component AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3483  transcriptional regulator, AraC family  36.54 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1619  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.73 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0667714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2655  transcriptional regulator, AraC family  27.21 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.5275  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>