87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_26340 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_26340  anti-anti-sigma factor  100 
 
 		 142 aa  281  3.0000000000000004e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12900  anti-anti-sigma factor  46.9 
 
 		 114 aa  100  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27120  anti-anti-sigma factor  41.23 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3738  anti-sigma-factor antagonist  36.27 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4407  anti-sigma-factor antagonist  36.59 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.508963  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  36.27 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11933  hypothetical protein  31.58 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2714  anti-sigma-factor antagonist  34.34 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50598  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5246  anti-sigma-factor antagonist  33.65 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5538  anti-sigma-factor antagonist  33.65 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5157  anti-sigma-factor antagonist  33.65 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  31.31 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  29.63 
 
 		 113 aa  52.8  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2758  anti-sigma-factor antagonist  35.16 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2744  anti-sigma-factor antagonist  35.16 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.146938  normal  0.0434757 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5185  anti-sigma-factor antagonist  30.1 
 
 		 120 aa  52  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5274  anti-sigma-factor antagonist  30.1 
 
 		 120 aa  52  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3834  anti-sigma-factor antagonist  33.93 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2472  anti-sigma-factor antagonist  34.72 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2606  anti-sigma-factor antagonist  36.11 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  21 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  35.29 
 
 		 118 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3003  anti-sigma-factor antagonist  29.71 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  27.27 
 
 		 116 aa  50.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0613  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  27.55 
 
 		 110 aa  50.1  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2306  anti-sigma-factor antagonist  35.24 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00064789  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13718  anti-anti-sigma factor rsfB  26.32 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.237109 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  26.36 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  33.67 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  25.23 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5566  anti-sigma-factor antagonist  30.3 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  26.73 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3434  anti-sigma-factor antagonist  35.87 
 
 		 114 aa  48.9  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.58 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1481  anti-sigma-factor antagonist  31.13 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11180  anti-anti-sigma factor  33.01 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0792336 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3284  anti-sigma-factor antagonist  34.04 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.156911  normal  0.806624 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  26.36 
 
 		 115 aa  47.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  29.91 
 
 		 116 aa  47.8  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  26.53 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  28.87 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3879  anti-sigma-factor antagonist  35.48 
 
 		 155 aa  47  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.337917 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  27.83 
 
 		 120 aa  47.4  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2286  anti-sigma-factor antagonist  20.72 
 
 		 113 aa  47  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.964684  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  30.84 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  28.26 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  24.27 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4938  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.704435 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2064  anti-sigma-factor antagonist  28.83 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0033219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3946  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  42.86 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2530  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7623  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  29.91 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2021  anti-sigma-factor antagonist  38.24 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.60085  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3195  anti-sigma-factor antagonist  32 
 
 		 132 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2116  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0561047  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  33.66 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3164  anti-sigma-factor antagonist  29.73 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.833812  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  30.69 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2424  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  31.18 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3686  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5225  anti-sigma-factor antagonist  28.97 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0769527 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1691  anti-sigma-factor antagonist  28.97 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0136319  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  31.25 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  40 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  25.26 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3105  anti-sigma-factor antagonist  29.25 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4521  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0130827  decreased coverage  0.00053204 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1941  anti-sigma-factor antagonist  34.21 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623131  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0702  anti-sigma-factor antagonist  30.14 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44246  normal  0.0163472 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  22.58 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1819  anti-sigma-factor antagonist  34.12 
 
 		 111 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4101  anti-anti-sigma factor  30.93 
 
 		 107 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1736  anti-sigma-factor antagonist  21.36 
 
 		 113 aa  41.2  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  27.36 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4702  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.886766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  25.89 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1663  anti-sigma-factor antagonist  21.36 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0905  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 106 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0599283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0996  anti-anti-sigma regulatory factor  34.52 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0916  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 106 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.239585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0899  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 106 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.562306  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  24.21 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  22.43 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2121  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  29.29 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.490398 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>