243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_24640 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_24640  spermidine synthase  100 
 
 		 283 aa  583  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.845245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5656  Spermine synthase  63.6 
 
 		 281 aa  367  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02190  spermidine synthase  53.29 
 
 		 299 aa  301  1e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1395  Spermine synthase  27.66 
 
 		 285 aa  113  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1864  spermidine synthase  28.89 
 
 		 286 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  34.07 
 
 		 304 aa  97.4  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4961  Spermine synthase  32.11 
 
 		 313 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.787243 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  28.44 
 
 		 286 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2055  spermidine synthase  28.44 
 
 		 286 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2020  Spermine synthase  28.42 
 
 		 308 aa  92.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2046  Spermine synthase  28.42 
 
 		 308 aa  92.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  28.95 
 
 		 286 aa  91.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  29.74 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2546  spermidine synthase  29.82 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5377  spermidine synthase  30 
 
 		 375 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  27.56 
 
 		 286 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0886  spermidine synthase  28.93 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.176516 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  27.23 
 
 		 508 aa  87.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0383  spermine synthase  30.89 
 
 		 291 aa  86.7  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5332  spermidine synthase  28.64 
 
 		 363 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4905  spermidine synthase  29.17 
 
 		 369 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5301  spermidine synthase  28.7 
 
 		 360 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000883431 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5060  spermidine synthase  28.7 
 
 		 360 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4890  spermidine synthase  29.09 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5445  spermidine synthase  28.7 
 
 		 360 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40897  Spermidine synthase  29.49 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.862336 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1075  spermidine synthase  26.82 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000310388  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5627  spermidine synthase  28.24 
 
 		 360 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000165937 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1627  spermidine synthase  26.98 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29501  spermidine synthase  27.8 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0628  spermidine synthase  27.3 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.414724  normal  0.905176 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3054  spermidine synthase  26.49 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0855  spermidine synthase  29.61 
 
 		 567 aa  82  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00481823  normal  0.101312 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  31.69 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0722  spermidine synthase  28.65 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.441683 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2836  spermidine synthase  26.39 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  25 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  25.93 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1016  spermidine synthase  25.46 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0155  spermidine synthase  26.83 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.164944  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2253  spermine synthase / spermidine synthase  25.66 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.158612 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0529  spermidine synthase  24.26 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0126  spermidine synthase  29.48 
 
 		 519 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597506  decreased coverage  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5495  hypothetical protein  29.29 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0515  spermidine synthase  23.9 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0583  spermidine synthase  29.25 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63120  hypothetical protein  28.88 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1222  spermidine synthase  28.57 
 
 		 510 aa  77.4  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00106657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1023  spermidine synthase  25.7 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4001  spermidine synthase  26.17 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  30.43 
 
 		 522 aa  76.6  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18951  spermidine synthase  26.98 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.454611  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1778  spermidine synthase  26.37 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1326  spermidine synthase  26.98 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3482  spermidine synthase  25.7 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00378102  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3354  spermidine synthase  25.7 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000276507  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1879  Spermine synthase  31.47 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1199  spermidine synthase  23.86 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.928058  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0669  spermidine synthase  25.7 
 
 		 289 aa  75.5  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000146027  normal  0.395519 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00120  spermidine synthase  25.23 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387054  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3481  spermidine synthase  25.23 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00013489  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0198  spermidine synthase  26.17 
 
 		 286 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4120  spermidine synthase  26.41 
 
 		 525 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.139425  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18761  spermidine synthase  26.98 
 
 		 283 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.443872  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0128  spermidine synthase  25.23 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0182  spermidine synthase  24.63 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000125359  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0185  spermidine synthase  26.17 
 
 		 286 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.506874 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0131  spermidine synthase  25.23 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.316229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0181  spermidine synthase  26.17 
 
 		 286 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0182  spermidine synthase  26.17 
 
 		 286 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0125  spermidine synthase  25.23 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567912  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4232  spermidine synthase  26.41 
 
 		 525 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00119  hypothetical protein  25.23 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0906  spermidine synthase  28.86 
 
 		 570 aa  75.1  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.975863  normal  0.296256 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3538  spermidine synthase  25.23 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00580941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0123  spermidine synthase  25.23 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.705101  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0190  spermidine synthase  26.17 
 
 		 286 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.241142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  29.89 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2319  Spermine synthase  27.87 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.961165  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3170  spermidine synthase  31.87 
 
 		 529 aa  73.9  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139391  normal  0.072114 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0701  Spermine synthase  33.51 
 
 		 533 aa  73.9  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2794  spermidine synthase  24.19 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1460  Spermine synthase  26.32 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0772  spermine synthase / spermidine synthase  27.19 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0896  spermidine synthase  25.64 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  31.34 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1812  Spermine synthase  26.36 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1306  spermidine synthase  26.06 
 
 		 525 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2590  spermidine synthase  25.66 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.138188 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  27.13 
 
 		 536 aa  73.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1858  Spermine synthase  32.09 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2229  spermidine synthase  26.88 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0111  spermidine synthase  27.23 
 
 		 498 aa  72.8  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.5367  normal  0.241238 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0309  spermidine synthase  26.92 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1825  spermidine synthase  24.62 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0114  spermidine synthase  24.77 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000001847  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1337  spermidine synthase  26.06 
 
 		 510 aa  72  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  25 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  25.62 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1086  spermidine synthase  23.59 
 
 		 280 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>