121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_22580 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_22580  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 252 aa  497  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.476391  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2338  transcriptional regulator, MerR family  56.67 
 
 		 244 aa  251  7e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1225  MerR family transcriptional regulator  55.51 
 
 		 245 aa  250  1e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.786651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2774  regulatory protein MerR  52.76 
 
 		 240 aa  242  3.9999999999999997e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251108  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5355  transcriptional regulator, MerR family  47.4 
 
 		 313 aa  228  9e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2712  regulatory protein, MerR  53.36 
 
 		 246 aa  221  6e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120713  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3401  MerR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 248 aa  217  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144453  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11858  hypothetical protein  48.03 
 
 		 247 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.554166 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3134  MerR family transcriptional regulator  45.82 
 
 		 244 aa  210  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0691359 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4009  transcriptional regulator, MerR family  48.96 
 
 		 246 aa  209  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.57553  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1694  MerR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 218 aa  206  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0331871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2843  MerR family transcriptional regulator  46.06 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2887  MerR family transcriptional regulator  46.06 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.654736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2874  MerR family transcriptional regulator  46.06 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2381  regulatory protein, MerR  51.67 
 
 		 249 aa  202  6e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2519  MerR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 249 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.94441  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4003  putative transcriptional regulator, MerR family  48.56 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.875778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3095  putative transcriptional regulator, MerR family  46.27 
 
 		 237 aa  191  7e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.66482  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2433  transcriptional regulator, MerR family  48.22 
 
 		 236 aa  189  5e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000601373  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2725  transcriptional regulator, MerR family  46.22 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1469  MerR family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1885  transcriptional regulator, MerR family  43.8 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1543  transcriptional regulator, MerR family  46.77 
 
 		 238 aa  178  7e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825086 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1542  MerR family transcriptional regulator  46.61 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598972  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13840  predicted transcriptional regulator  44.9 
 
 		 247 aa  177  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18270  predicted transcriptional regulator  43.4 
 
 		 258 aa  172  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1739  transcriptional regulator, MerR family  42.13 
 
 		 264 aa  171  6.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4996  MerR family transcriptional regulator  48.55 
 
 		 271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14960  predicted transcriptional regulator  41.53 
 
 		 236 aa  159  4e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0208149  normal  0.635485 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2101  transcriptional regulator, MerR family  42.62 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.878958 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3490  transcriptional regulator, MerR family  37.7 
 
 		 268 aa  146  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0478654 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15530  predicted transcriptional regulator  35.59 
 
 		 230 aa  140  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1126  transcriptional regulator, MerR family  39.24 
 
 		 262 aa  135  5e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1301  transcriptional regulator, MerR family  43.98 
 
 		 263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.814813 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1433  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 229 aa  108  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0281208  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3129  transcriptional regulator, MerR family  61.84 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0754  transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 		 287 aa  90.5  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00066154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3746  MerR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 151 aa  51.6  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 146 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 158 aa  50.1  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  54.24 
 
 		 137 aa  49.3  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 152 aa  48.9  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7395  MerR family transcriptional regulator  55.88 
 
 		 138 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1566  MerR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 229 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000201032  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2208  MerR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194329  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5067  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 351 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5793  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 351 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1311  MerR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4386  MerR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 340 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2543  MerR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 128 aa  47  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3230  transcriptional regulator, MerR family  33.1 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129557  normal  0.789887 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 292 aa  46.6  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0667  transcriptional regulator, MerR family  42.37 
 
 		 249 aa  46.2  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.201436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  46.34 
 
 		 135 aa  46.2  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3005  MerR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 144 aa  46.2  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44472  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1864  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 198 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  50 
 
 		 173 aa  46.2  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0494  zinc-responsive transcriptional regulator  45.45 
 
 		 153 aa  46.2  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1374  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 164 aa  45.8  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0033  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 164 aa  45.8  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.154988  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 138 aa  45.8  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2220  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 164 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2258  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 164 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.214399  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2386  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 255 aa  45.4  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3495  MerR family transcriptional regulator  56.41 
 
 		 133 aa  45.4  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444785 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  47.73 
 
 		 135 aa  44.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  42.55 
 
 		 159 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  48.84 
 
 		 152 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  48.84 
 
 		 152 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1572  transcriptional regulator, MerR family  45.1 
 
 		 128 aa  44.3  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0975  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 130 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  44.68 
 
 		 157 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  44.68 
 
 		 157 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  44.68 
 
 		 157 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1395  MerR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 146 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.686505  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  44.68 
 
 		 176 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4100  MerR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 127 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  44.68 
 
 		 171 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  44.68 
 
 		 176 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0178  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 142 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0926305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  44.68 
 
 		 171 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  40.28 
 
 		 142 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1339  mercuric resistance operon regulatory protein  41.27 
 
 		 135 aa  43.9  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02983  putative transcription regulator protein  46.51 
 
 		 152 aa  43.5  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179274  normal  0.643629 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  44.68 
 
 		 163 aa  43.5  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2975  MerR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 143 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.501139  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0151  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  39.73 
 
 		 143 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636208  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3291  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  39.73 
 
 		 143 aa  43.5  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3161  MerR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 155 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2165  MerR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 156 aa  43.5  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0369388  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3334  MerR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 143 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1564  MerR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 143 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3947  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  39.73 
 
 		 143 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4020  transcriptional regulator CadR  39.73 
 
 		 143 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3037  MerR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 143 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0271  MerR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 156 aa  43.5  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  44.68 
 
 		 156 aa  43.9  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  44.44 
 
 		 159 aa  43.9  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00354  putative Zn(II)-responsive transcriptional regulator, regulates Zn export (MerR family) protein  30.99 
 
 		 136 aa  43.5  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.784451  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 144 aa  43.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>