198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_21490 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  43.85 
 
 
809 aa  684    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  43.47 
 
 
812 aa  662    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  43.85 
 
 
809 aa  684    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  43.66 
 
 
782 aa  682    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21490  penicilin amidase  100 
 
 
841 aa  1702    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3478  peptidase S45 penicillin amidase  42.63 
 
 
847 aa  642    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0898  peptidase S45 penicillin amidase  43.66 
 
 
785 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4754  peptidase S45 penicillin amidase  43.27 
 
 
792 aa  560  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11589  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4245  peptidase S45 penicillin amidase  41.21 
 
 
784 aa  546  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423428  normal  0.359084 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1726  penicillin acylase  37.17 
 
 
837 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0887  putative penicillin amidase  37.28 
 
 
837 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1174  putative penicillin amidase  37.28 
 
 
837 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2152  putative penicillin amidase  37.28 
 
 
837 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0371  putative penicillin amidase  37.17 
 
 
837 aa  506  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0278  putative penicillin amidase  37.07 
 
 
837 aa  505  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1877  putative penicillin amidase  37.54 
 
 
823 aa  502  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  35.92 
 
 
807 aa  491  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  31.09 
 
 
827 aa  330  6e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  29.54 
 
 
817 aa  330  8e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  30.34 
 
 
827 aa  324  4e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  27.56 
 
 
796 aa  299  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  27.33 
 
 
796 aa  299  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  27.56 
 
 
796 aa  299  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  27.84 
 
 
796 aa  298  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  29.94 
 
 
804 aa  298  4e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  27.21 
 
 
796 aa  296  8e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  27.36 
 
 
796 aa  296  9e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  27.09 
 
 
796 aa  296  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  27.24 
 
 
796 aa  296  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  30.07 
 
 
787 aa  293  7e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  27.24 
 
 
796 aa  291  4e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  27.24 
 
 
796 aa  291  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  28.16 
 
 
810 aa  281  3e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  28.8 
 
 
779 aa  280  7e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  30.7 
 
 
803 aa  278  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  28.68 
 
 
783 aa  276  2.0000000000000002e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  29.84 
 
 
789 aa  274  6e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  28.35 
 
 
819 aa  269  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  29.04 
 
 
769 aa  268  2.9999999999999995e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  28.09 
 
 
818 aa  263  6.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  32.62 
 
 
770 aa  261  6e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  29.38 
 
 
829 aa  257  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  28.96 
 
 
821 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  28.47 
 
 
822 aa  250  7e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  27.99 
 
 
808 aa  250  7e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  26.23 
 
 
819 aa  246  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  28.55 
 
 
813 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  29.48 
 
 
854 aa  237  8e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  28.42 
 
 
809 aa  230  7e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  25.86 
 
 
811 aa  229  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  26.8 
 
 
858 aa  229  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  25.59 
 
 
823 aa  228  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  24.59 
 
 
780 aa  226  1e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  26.38 
 
 
903 aa  226  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  28.19 
 
 
809 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  28.42 
 
 
821 aa  224  4.9999999999999996e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  27.65 
 
 
857 aa  224  8e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  28.77 
 
 
855 aa  222  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0772  hypothetical protein  25.86 
 
 
810 aa  221  3e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  27.43 
 
 
870 aa  217  5.9999999999999996e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  27 
 
 
843 aa  216  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1089  penicillin amidase family protein  25.93 
 
 
761 aa  214  3.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1397  penicillin amidase  26.57 
 
 
762 aa  214  4.9999999999999996e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3360  peptidase S45 penicillin amidase  28.42 
 
 
833 aa  213  9e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545108  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  26.29 
 
 
823 aa  212  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  26.46 
 
 
823 aa  211  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  26.12 
 
 
807 aa  209  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  29.51 
 
 
818 aa  209  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0835  peptidase S45 penicillin amidase  28.11 
 
 
856 aa  208  4e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0497714  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  28.08 
 
 
864 aa  208  4e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  26.55 
 
 
844 aa  207  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  26.92 
 
 
821 aa  207  6e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  27.29 
 
 
854 aa  206  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2327  penicillin amidase  27.24 
 
 
826 aa  204  4e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00682213  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  26.84 
 
 
795 aa  198  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  27.93 
 
 
792 aa  194  8e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  27.18 
 
 
872 aa  193  9e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  28.12 
 
 
836 aa  192  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  26.69 
 
 
795 aa  191  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  26.7 
 
 
795 aa  191  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  25.97 
 
 
889 aa  190  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0831  penicillin amidase  27.49 
 
 
829 aa  189  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0438978 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4884  peptidase S45 penicillin amidase  25.39 
 
 
906 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  27.67 
 
 
809 aa  184  7e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  26.55 
 
 
774 aa  184  8.000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  26.73 
 
 
786 aa  181  4.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  25.93 
 
 
795 aa  181  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4813  penicillin amidase  25.15 
 
 
790 aa  179  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.911238  normal  0.40468 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  25.26 
 
 
847 aa  178  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  23.62 
 
 
848 aa  178  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0920  peptidase S45, penicillin amidase  25.42 
 
 
825 aa  177  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513538  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  25.28 
 
 
847 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1414  penicillin amidase  25.11 
 
 
837 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290325  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  25.99 
 
 
827 aa  175  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4305  penicillin amidase  26.99 
 
 
641 aa  170  9e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104752  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  24.8 
 
 
803 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1213  peptidase S45, penicillin amidase  24.76 
 
 
816 aa  168  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.951411 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1354  penicillin amidase  25.88 
 
 
829 aa  167  9e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342409  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1767  Penicillin amidase  26.86 
 
 
963 aa  167  9e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.439064  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  24.97 
 
 
839 aa  166  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>