More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_07790 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_07790  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  100 
 
 		 278 aa  560  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6801  extracellular solute-binding protein family 3  50.18 
 
 		 275 aa  273  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1470  extracellular solute-binding protein family 3  49.25 
 
 		 274 aa  258  7e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1590  extracellular solute-binding protein family 3  47.65 
 
 		 282 aa  237  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000563013  normal  0.528565 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1124  extracellular solute-binding protein family 3  41.67 
 
 		 289 aa  227  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3988  extracellular solute-binding protein family 3  48.77 
 
 		 321 aa  222  6e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0021  amino acid ABC transporter periplasmic protein  42.05 
 
 		 279 aa  208  8e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0787  extracellular solute-binding protein  39.11 
 
 		 277 aa  208  9e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2427  extracellular solute-binding protein  41.45 
 
 		 279 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.45539  normal  0.110976 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15430  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  46.55 
 
 		 297 aa  206  5e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0169266  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3969  extracellular solute-binding protein  41.03 
 
 		 279 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2142  extracellular solute-binding protein  41.84 
 
 		 275 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.332487  hitchhiker  0.00274771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2155  extracellular solute-binding protein  41.84 
 
 		 275 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2201  extracellular solute-binding protein  41.84 
 
 		 275 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51731  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22730  amino acid-binding protein  44.21 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.718318  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1497  extracellular solute-binding protein family 3  43.04 
 
 		 305 aa  196  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2444  extracellular solute-binding protein family 3  43.15 
 
 		 294 aa  192  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.474573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3287  extracellular solute-binding protein family 3  40.08 
 
 		 290 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2222  glutamine ABC transporter (glutamine-binding protein)  35.89 
 
 		 269 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1246  extracellular solute-binding protein family 3  41.06 
 
 		 282 aa  186  5e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1430  extracellular solute-binding protein  35.89 
 
 		 294 aa  185  6e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1593  extracellular solute-binding protein family 3  42.86 
 
 		 278 aa  185  8e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36870  amino acid-binding protein  37.34 
 
 		 290 aa  179  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1449  extracellular solute-binding protein family 3  38.86 
 
 		 295 aa  179  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2802  extracellular solute-binding protein  37.83 
 
 		 294 aa  179  5.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2522  extracellular solute-binding protein family 3  36.52 
 
 		 295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000888885 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1394  extracellular solute-binding protein  36.69 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.041771 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0809  extracellular solute-binding protein  37.15 
 
 		 285 aa  167  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3913  extracellular solute-binding protein family 3  34.69 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0186  extracellular solute-binding protein family 3  40.87 
 
 		 279 aa  166  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3520  extracellular solute-binding protein  35.1 
 
 		 296 aa  165  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1790  extracellular solute-binding protein family 3  34.95 
 
 		 323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0671  extracellular solute-binding protein family 3  39.82 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159271  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1550  extracellular solute-binding protein family 3  36.14 
 
 		 294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.82369  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4400  extracellular solute-binding protein family 3  38.59 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27710  amino acid-binding protein  35.68 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.620875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1224  extracellular solute-binding protein  34.01 
 
 		 323 aa  159  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4887  extracellular solute-binding protein family 3  38.33 
 
 		 315 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2206  extracellular solute-binding protein family 3  33.68 
 
 		 355 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3984  extracellular solute-binding protein family 3  31.1 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  36.17 
 
 		 751 aa  125  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  34.96 
 
 		 319 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  30.11 
 
 		 281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4395  extracellular solute-binding protein family 3  33.47 
 
 		 340 aa  118  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  27.47 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3754  extracellular solute-binding protein family 3  31.87 
 
 		 326 aa  114  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6294  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 		 305 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102459  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.1 
 
 		 273 aa  112  6e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.15 
 
 		 276 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.52 
 
 		 276 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  29.52 
 
 		 276 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 		 276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  29.15 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  29.15 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  29.15 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.15 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.78 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.78 
 
 		 276 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3062  extracellular solute-binding protein family 3  32.65 
 
 		 318 aa  108  7.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3538  extracellular solute-binding protein family 3  35.47 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.139561  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0327  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  29.57 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.503562  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10416  glutamine-binding lipoprotein glnH  32.37 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000397853  normal  0.816893 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0541  extracellular solute-binding protein  30.96 
 
 		 331 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0553  extracellular solute-binding protein  30.96 
 
 		 331 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0531  extracellular solute-binding protein  30.96 
 
 		 331 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2813  extracellular solute-binding protein  33.73 
 
 		 319 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.243067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1043  extracellular solute-binding protein family 3  29.43 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37210  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  33.6 
 
 		 324 aa  103  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.734714  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.48 
 
 		 277 aa  103  4e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1121  extracellular solute-binding protein family 3  31.47 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.591856  normal  0.275359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7045  Serine/threonine protein kinase-like protein  32.2 
 
 		 600 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  27.86 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  28.64 
 
 		 246 aa  99.8  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  30.04 
 
 		 247 aa  99.4  6e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5539  extracellular solute-binding protein  28.91 
 
 		 268 aa  99.4  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0885  extracellular solute-binding protein family 3  26.3 
 
 		 284 aa  99  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000379801  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  29.25 
 
 		 246 aa  98.2  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  24.34 
 
 		 286 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  27.98 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0201  extracellular solute-binding protein  28.75 
 
 		 324 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 		 276 aa  97.1  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0704  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 		 332 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1010  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 		 267 aa  97.1  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3756  extracellular solute-binding protein  31.98 
 
 		 302 aa  97.1  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2764  extracellular solute-binding protein  29.21 
 
 		 275 aa  95.5  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  23.6 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4387  extracellular solute-binding protein  31.98 
 
 		 318 aa  94.7  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  27.57 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3014  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 		 265 aa  93.2  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  28.4 
 
 		 273 aa  92.8  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30080  amino acid-binding protein  29.76 
 
 		 324 aa  92  9e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3517  extracellular solute-binding protein family 3  31.22 
 
 		 273 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2029  extracellular solute-binding protein family 3  27.04 
 
 		 275 aa  90.5  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00497658  hitchhiker  0.00148627 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1324  amino acid ABC transporter (binding protein)  27.62 
 
 		 262 aa  90.5  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216539  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0800  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.08 
 
 		 256 aa  89.7  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38805  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  28.5 
 
 		 275 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1635  extracellular solute-binding protein family 3  25.28 
 
 		 290 aa  89.4  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0711  extracellular solute-binding protein family 3  26.95 
 
 		 266 aa  89  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>