206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_00340 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_00340  ABC-type multidrug transport system, permease component  100 
 
 		 259 aa  501  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.15345 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  45.23 
 
 		 272 aa  199  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  41.22 
 
 		 247 aa  198  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  41.22 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  41.82 
 
 		 271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  42.26 
 
 		 274 aa  176  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4190  ABC-2 type transporter  42.28 
 
 		 257 aa  175  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  38.21 
 
 		 268 aa  161  9e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  35.29 
 
 		 249 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  34.87 
 
 		 253 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  35.29 
 
 		 249 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  35.54 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  35.29 
 
 		 249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  34.87 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  34.87 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3016  ABC-2 type transporter  36.8 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.021308 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  34.87 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3438  ABC transporter, efflux permease protein  35.71 
 
 		 249 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3446  ABC transporter, efflux permease protein  34.45 
 
 		 249 aa  152  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00692281  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3147  ABC-2 type transporter  35.71 
 
 		 249 aa  152  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145802  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3212  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  34.87 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4383  ABC-2 type transporter  36.97 
 
 		 253 aa  149  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8859  ABC transporter permease  33.47 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  34.6 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4874  ABC-2 type transporter  35.2 
 
 		 253 aa  145  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0959  ABC-2 type transporter  32.22 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00197586  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6375  ABC-2 type transporter  33.75 
 
 		 247 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8873  ABC-2 type transporter  31.17 
 
 		 270 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1684  ABC-2 type transporter  35.08 
 
 		 251 aa  135  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2065  ABC-2 type transporter  31.71 
 
 		 254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5588  ABC-2 type transporter  33.6 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  34.16 
 
 		 269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  33.74 
 
 		 270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  35.6 
 
 		 254 aa  125  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2363  ABC-2 type transporter  37.84 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153945  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0213  ABC transporter permease  32.38 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1189  ABC-2 type transporter  32.84 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000916915 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  30.66 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  31.08 
 
 		 285 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  30.95 
 
 		 273 aa  102  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  34.75 
 
 		 273 aa  102  6e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  32.73 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  32.2 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.08 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  30.49 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  30.31 
 
 		 267 aa  99.8  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  30.27 
 
 		 267 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  30.27 
 
 		 267 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  28.96 
 
 		 277 aa  96.7  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  29.2 
 
 		 285 aa  95.9  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  28.4 
 
 		 266 aa  95.1  9e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  31.78 
 
 		 254 aa  94.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  29.33 
 
 		 269 aa  94.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  27.87 
 
 		 280 aa  94.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  28.77 
 
 		 269 aa  93.6  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  32.47 
 
 		 272 aa  93.2  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  28.77 
 
 		 266 aa  93.2  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  28.3 
 
 		 274 aa  92.8  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0598  ABC-2 type transporter  27.54 
 
 		 277 aa  92  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2086  ABC-2 type transporter  31.51 
 
 		 267 aa  92  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 		 278 aa  91.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4188  hypothetical protein  51.16 
 
 		 214 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00904545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  30.64 
 
 		 281 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  32.24 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3253  ABC transporter related  28.18 
 
 		 265 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00665342  normal  0.245763 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1504  ABC-2 type transporter  29.38 
 
 		 272 aa  89.7  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22030  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  29.9 
 
 		 281 aa  89.4  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  25.77 
 
 		 266 aa  89  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  29.78 
 
 		 285 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3387  multidrug ABC transporter inner membrane protein  30.2 
 
 		 281 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.169242 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  27.67 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  28.91 
 
 		 268 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  29.11 
 
 		 280 aa  86.7  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  26.89 
 
 		 269 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  29.22 
 
 		 289 aa  87  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0618  ABC-2 type transporter  24.81 
 
 		 267 aa  86.3  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.099686  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  29.79 
 
 		 274 aa  86.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39010  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.62 
 
 		 271 aa  85.9  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  26.1 
 
 		 271 aa  85.5  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0451  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.89 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0034336  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  27.69 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3893  ABC-2 type transporter  28.83 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0012751  normal  0.0102027 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  27.85 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3718  ABC-2 type transporter  27.46 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1966  ABC-2 type transporter  30.19 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.115517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3120  multidrug ABC transporter inner membrane protein  30.47 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.561291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  30.48 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  28.68 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  24.77 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  24.77 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  24.77 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12952  daunorubicin-dim-transport integral membrane protein ABC transporter drrC  28.02 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1123  ABC-2 type transporter  29.39 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  24.65 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2100  ABC-2 type transporter  28.77 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  29.82 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0287  ABC-2 type transporter  32.56 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  27.55 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18340  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.63 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.823039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>