216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0733 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0733  flagellar basal body L-ring protein  100 
 
 		 240 aa  491  9.999999999999999e-139  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0814  flagellar basal body L-ring protein  49.58 
 
 		 234 aa  254  9e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0710  flagellar basal body L-ring protein  49.79 
 
 		 232 aa  251  7e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0786  flagellar basal body L-ring protein  49.79 
 
 		 232 aa  251  9.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1427  flagellar basal body L-ring protein  48.9 
 
 		 235 aa  250  1e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00360883  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1320  flagellar basal body L-ring protein  49.79 
 
 		 232 aa  248  9e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0638  flagellar basal body L-ring protein  48.74 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.722941  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0102  flagellar basal body L-ring protein  45.15 
 
 		 235 aa  243  3e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.354617  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1042  flagellar L-ring protein  46.81 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2407  flagellar basal body L-ring protein  33.05 
 
 		 229 aa  123  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0433  flagellar L-ring protein  29.96 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2520  flagellar basal body L-ring protein  31.62 
 
 		 238 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  30.61 
 
 		 231 aa  113  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  31.76 
 
 		 232 aa  112  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0596  flagellar L-ring protein  28.57 
 
 		 229 aa  112  6e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3156  flagellar basal body L-ring protein  29.74 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3048  flagellar L-ring protein FlgH  28.02 
 
 		 221 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3451  flagellar L-ring protein  27.92 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2508  flagellar L-ring protein  30.73 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.153573  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4104  flagellar L-ring protein  28.33 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  31.28 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1349  flagellar L-ring protein  33.85 
 
 		 229 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00261084  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1376  flagellar L-ring protein  25.94 
 
 		 224 aa  105  5e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2604  flagellar L-ring protein  33.33 
 
 		 229 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.735916  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1483  flagellar basal body L-ring protein  31.31 
 
 		 236 aa  105  9e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0615716  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3279  flagellar L-ring protein  27.47 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1654  flagellar L-ring protein  27.92 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3844  flagellar L-ring protein  30.48 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044385 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3760  flagellar L-ring protein  30 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  28.63 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  28.63 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2426  flagellar basal body L-ring protein  30.04 
 
 		 238 aa  101  8e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.468869 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  27.8 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5631  flagellar basal body L-ring protein  26.16 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  28.51 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  26.61 
 
 		 219 aa  99.8  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  28.28 
 
 		 224 aa  98.6  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  27.5 
 
 		 224 aa  98.2  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0063  flagellar basal body L-ring protein  29.74 
 
 		 220 aa  98.2  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  27.39 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3645  flagellar basal body L-ring protein  29.2 
 
 		 219 aa  95.9  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  30.86 
 
 		 230 aa  95.9  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  28 
 
 		 234 aa  95.5  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0394  flagellar basal body L-ring protein  28.9 
 
 		 239 aa  95.9  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1346  flagellar basal body L-ring protein  30.17 
 
 		 217 aa  95.5  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  28.63 
 
 		 234 aa  95.5  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  26.84 
 
 		 237 aa  94.4  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0348  flagellar L-ring protein precursor  28.51 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417331  normal  0.464223 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3243  flagellar basal body L-ring protein  29.07 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  27.51 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0627  flagellar L-ring protein  27.75 
 
 		 235 aa  93.6  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1327  flagellar basal body L-ring protein  29.33 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.821167  normal  0.0823128 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  27.64 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  29.07 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1265  flagellar basal body L-ring protein  28.57 
 
 		 224 aa  92.8  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1603  flagellar basal body L-ring protein  27.98 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.153327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2591  flagellar basal body L-ring protein  29.86 
 
 		 224 aa  92.4  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0603  flagellar L-ring protein  31.28 
 
 		 236 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.754309  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0636  flagellar L-ring protein  30.73 
 
 		 235 aa  92  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1468  flagellar L-ring protein  27.31 
 
 		 250 aa  92  7e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24060  Flagellar L-ring protein  24.89 
 
 		 232 aa  92  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0625  flagellar L-ring protein  30.73 
 
 		 235 aa  92  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.317328 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  27.2 
 
 		 232 aa  91.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2918  flagellar L-ring protein  23.48 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0212055  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1422  flagellar basal body L-ring protein  28.12 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.474859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1559  flagellar basal body L-ring protein  25.63 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.602881  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3708  flagellar L-ring protein  27.4 
 
 		 247 aa  91.3  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.388309 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4785  flagellar L-ring protein  27.4 
 
 		 247 aa  91.3  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2956  flagellar basal body L-ring protein  28.57 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.656972  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2941  flagellar basal body L-ring protein  28.57 
 
 		 224 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3094  flagellar basal body L-ring protein  28.12 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0291  flagellar basal body L-ring protein  27.16 
 
 		 235 aa  90.5  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127273  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  26.99 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0825  flagellar basal body L-ring protein  29.15 
 
 		 249 aa  89  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1108  flagellar L-ring protein  24.78 
 
 		 230 aa  89  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  26.86 
 
 		 237 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3462  flagellar basal body L-ring protein  23.95 
 
 		 220 aa  88.2  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  26.12 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1145  flagellar L-ring protein  31.43 
 
 		 192 aa  87.8  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000678845  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3720  flagellar L-ring protein  33.15 
 
 		 243 aa  87.8  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1681  flagellar basal body L-ring protein  28.5 
 
 		 252 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  28.72 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2419  flagellar basal body L-ring protein  25.96 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.212802  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  25.1 
 
 		 220 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2318  flagellar basal body L-ring protein  25.96 
 
 		 243 aa  87.8  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4193  flagellar L-ring protein  26.58 
 
 		 227 aa  87.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  24.46 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  24.46 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2372  flagellar L-ring protein  24.12 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1960  flagellar L-ring protein  28.89 
 
 		 222 aa  87.4  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3680  flagellar L-ring protein  28.64 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3243  flagellar basal body L-ring protein  28.38 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.233718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2779  flagellar L-ring protein  28.72 
 
 		 228 aa  87  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1309  flagellar basal body L-ring protein  27.39 
 
 		 224 aa  86.7  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2925  flagellar L-ring protein  26.52 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  28.14 
 
 		 224 aa  86.7  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1949  flagellar L-ring protein  29.81 
 
 		 251 aa  86.7  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  25.44 
 
 		 231 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3067  flagellar basal-body L-ring protein  25.96 
 
 		 224 aa  86.7  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0731995  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0069  flagellar basal body L-ring protein  30.64 
 
 		 224 aa  86.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.320449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>