249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1725 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1725  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 		 442 aa  905    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.847315  normal  0.600174 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3185  monooxygenase FAD-binding  94.34 
 
 		 442 aa  868    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304651  hitchhiker  0.000303065 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3109  monooxygenase FAD-binding  66.29 
 
 		 444 aa  580  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2934  monooxygenase, FAD-binding  40 
 
 		 402 aa  250  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2294  monooxygenase, FAD-binding  38.78 
 
 		 407 aa  242  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.539275  hitchhiker  0.00707471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3959  monooxygenase FAD-binding  38.14 
 
 		 411 aa  240  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1150  monooxygenase FAD-binding protein  37.73 
 
 		 397 aa  210  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862466  normal  0.995827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4487  monooxygenase FAD-binding  39.73 
 
 		 385 aa  188  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4239  monooxygenase FAD-binding  37.43 
 
 		 407 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2577  monooxygenase FAD-binding  31.97 
 
 		 397 aa  142  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.205259 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2256  FAD-binding monooxygenase  35.41 
 
 		 399 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2944  monooxygenase, FAD-binding protein  28.95 
 
 		 436 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  28.8 
 
 		 413 aa  96.7  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  25.79 
 
 		 461 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  30.48 
 
 		 441 aa  82.4  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  30.37 
 
 		 419 aa  79.7  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  30.37 
 
 		 419 aa  79.7  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  26.28 
 
 		 495 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  33.68 
 
 		 434 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4211  monooxygenase FAD-binding  26.3 
 
 		 429 aa  77.8  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747744  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  27.71 
 
 		 416 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  23 
 
 		 444 aa  77.4  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.29 
 
 		 449 aa  76.6  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  29.31 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  31.71 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  23.97 
 
 		 398 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  30.73 
 
 		 435 aa  71.2  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  33.5 
 
 		 431 aa  70.9  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09700  putative monooxygenase  30.11 
 
 		 401 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000279069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  28.5 
 
 		 398 aa  70.1  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1178  monooxygenase FAD-binding protein  26.81 
 
 		 436 aa  69.7  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.0113639 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  26.34 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0083  putative oxidoreductase FixC  30.16 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0904  putative monooxygenase  30.11 
 
 		 401 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  35.05 
 
 		 418 aa  68.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0083  putative oxidoreductase FixC  29.79 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.715205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  27.89 
 
 		 430 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0086  putative oxidoreductase FixC  30.16 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0084  putative oxidoreductase FixC  30.16 
 
 		 428 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0087  putative oxidoreductase FixC  30.16 
 
 		 428 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  26.21 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  28.11 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00047  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  27.96 
 
 		 428 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3556  FAD dependent oxidoreductase  27.96 
 
 		 428 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00046  hypothetical protein  27.96 
 
 		 428 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3612  putative oxidoreductase FixC  27.96 
 
 		 428 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0047  putative oxidoreductase FixC  27.96 
 
 		 428 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0049  putative oxidoreductase FixC  27.96 
 
 		 428 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0047  putative oxidoreductase FixC  27.96 
 
 		 428 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  33.65 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  30.9 
 
 		 423 aa  66.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3046  tryptophan halogenase  27.3 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354433  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  32.63 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  25.07 
 
 		 455 aa  65.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  25.29 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  25.07 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  24.33 
 
 		 455 aa  63.9  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  26.46 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0045  putative oxidoreductase FixC  27.42 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820288  normal  0.96055 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  24.16 
 
 		 449 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0945  putative oxidoreductase  27.3 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.443912 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4276  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  31.44 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0075  hypothetical protein  24 
 
 		 404 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  30.2 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  25 
 
 		 429 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  25 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  29.35 
 
 		 445 aa  62  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4041  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 		 429 aa  62  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  30.37 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5129  monooxygenase FAD-binding  27.63 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  24.29 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  25.63 
 
 		 455 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2679  FAD dependent oxidoreductase  26.88 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  26.15 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  24.28 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4604  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  27.17 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1397  hypothetical protein  27.03 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222986  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  23.65 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  28.72 
 
 		 409 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  30.56 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3653  monooxygenase FAD-binding  27.07 
 
 		 411 aa  59.7  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  29.29 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  26.45 
 
 		 506 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1496  hypothetical protein  30.37 
 
 		 429 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.403861 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  24.79 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7737  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  28.93 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.32 
 
 		 445 aa  58.9  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  30.41 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  30.89 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  25.87 
 
 		 507 aa  58.9  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  23.53 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  24.35 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  31.12 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  26.16 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  28.5 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  28.35 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  32 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3232  FAD dependent oxidoreductase  27.96 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  31.18 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  30.99 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>