More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1078 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1078  major facilitator transporter  100 
 
 		 455 aa  847    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0968  major facilitator transporter  86.37 
 
 		 461 aa  597  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335607  hitchhiker  0.00724126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3918  major facilitator superfamily MFS_1  52.21 
 
 		 502 aa  325  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2897  major facilitator superfamily drug efflux transporter  40.1 
 
 		 525 aa  289  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430026  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2315  major facilitator superfamily MFS_1  43.61 
 
 		 523 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3371  major facilitator superfamily MFS_1  40.57 
 
 		 513 aa  265  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0122  major facilitator transporter  43.71 
 
 		 538 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3277  major facilitator transporter  41.12 
 
 		 513 aa  261  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0884911 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2923  major facilitator transporter  43.03 
 
 		 541 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0132  major facilitator transporter  43.03 
 
 		 541 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0146  major facilitator transporter  43.03 
 
 		 541 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.824461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3312  major facilitator transporter  41.4 
 
 		 537 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2454  major facilitator transporter  38.81 
 
 		 510 aa  255  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3246  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.85 
 
 		 584 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.3214  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0132  major facilitator transporter  43.37 
 
 		 535 aa  249  7e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0130  major facilitator transporter  42.57 
 
 		 530 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.589693 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4144  major facilitator superfamily MFS_1  41.73 
 
 		 516 aa  242  7.999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94916  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2110  major facilitator transporter  47.79 
 
 		 460 aa  234  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0983806  normal  0.478447 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3197  hypothetical protein  36.34 
 
 		 518 aa  231  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0388664  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1712  major facilitator superfamily MFS_1  40.45 
 
 		 503 aa  227  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4568  major facilitator superfamily MFS_1  49.53 
 
 		 461 aa  227  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3063  major facilitator transporter  38.01 
 
 		 521 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4865  major facilitator transporter  36.48 
 
 		 523 aa  223  4.9999999999999996e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809546 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0460  major facilitator superfamily MFS_1  34.77 
 
 		 509 aa  211  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  34.12 
 
 		 500 aa  207  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  33.65 
 
 		 574 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2017  major facilitator transporter  45 
 
 		 516 aa  199  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.53 
 
 		 522 aa  196  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0529  major facilitator superfamily drug efflux transporter  33.57 
 
 		 543 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.71 
 
 		 469 aa  191  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  36.32 
 
 		 582 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 553 aa  187  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4882  major facilitator superfamily MFS_1  36.52 
 
 		 522 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3555  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.53 
 
 		 527 aa  186  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.34 
 
 		 522 aa  185  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5411  major facilitator superfamily MFS_1  35.28 
 
 		 521 aa  182  7e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.423231 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  33.98 
 
 		 528 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.53 
 
 		 516 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2353  major facilitator transporter  32.06 
 
 		 529 aa  181  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  32.93 
 
 		 512 aa  180  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.52 
 
 		 587 aa  179  9e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3154  RemN protein  34.21 
 
 		 519 aa  179  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0215338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 512 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4762  major facilitator transporter  34.68 
 
 		 514 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3851  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 		 505 aa  178  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  32.93 
 
 		 512 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  32.93 
 
 		 512 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  32.69 
 
 		 512 aa  177  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  32.93 
 
 		 512 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1197  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  34.26 
 
 		 532 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.365296 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3552  major facilitator superfamily MFS_1  36.13 
 
 		 511 aa  172  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.72 
 
 		 478 aa  171  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2323  transporter transmembrane protein  32.92 
 
 		 521 aa  169  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3069  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.07 
 
 		 504 aa  169  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3663  major facilitator transporter  31.49 
 
 		 512 aa  166  9e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2959  major facilitator transporter  33.89 
 
 		 506 aa  162  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.84 
 
 		 480 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08060  arabinose efflux permease family protein  32.57 
 
 		 418 aa  159  7e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2213  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 		 515 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927283  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.7 
 
 		 486 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.28 
 
 		 461 aa  159  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.7 
 
 		 486 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.7 
 
 		 486 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.7 
 
 		 486 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3942  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 519 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.7 
 
 		 486 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.94 
 
 		 478 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.7 
 
 		 486 aa  159  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.04 
 
 		 475 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3436  major facilitator transporter  34.75 
 
 		 518 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00141924  normal  0.0811342 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.47 
 
 		 484 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.35 
 
 		 502 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.94 
 
 		 474 aa  155  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.47 
 
 		 478 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.48 
 
 		 478 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.9 
 
 		 489 aa  154  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2043  major facilitator transporter  33.92 
 
 		 523 aa  153  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0394756  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 519 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  33.01 
 
 		 507 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 468 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 468 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  34 
 
 		 494 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.45 
 
 		 488 aa  150  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0484  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.74 
 
 		 551 aa  150  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.67 
 
 		 521 aa  149  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.53 
 
 		 468 aa  149  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  31.63 
 
 		 509 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 		 503 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.09 
 
 		 452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 483 aa  147  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3582  major facilitator transporter  31.86 
 
 		 510 aa  147  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.41 
 
 		 458 aa  147  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0761  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.95 
 
 		 534 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.698382  normal  0.0379028 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.74 
 
 		 488 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.59 
 
 		 458 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2632  multidrug resistance protein B  27.78 
 
 		 511 aa  144  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000173688  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2916  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.61 
 
 		 511 aa  144  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905383  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  28.81 
 
 		 470 aa  144  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.63 
 
 		 483 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  28.64 
 
 		 467 aa  143  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>