More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3264 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3264  Sigma 54 interacting domain protein  100 
 
 
231 aa  462  1e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000265903  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0377  ABC transporter related  47.39 
 
 
347 aa  202  3e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2228  ABC transporter related  47 
 
 
241 aa  199  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0571204  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2085  ABC-type transport system, putative ATPase component  40.69 
 
 
345 aa  195  6e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.218522  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0505  ABC transporter related  47.62 
 
 
345 aa  193  1e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.940496 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0256  ABC transporter-related protein  44.35 
 
 
349 aa  192  3e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1882  ABC transporter-related protein  43.54 
 
 
355 aa  192  3e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2784  ABC-type transporter, ATPase component  41.63 
 
 
383 aa  192  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000307726  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1887  ABC transporter-related protein  40.69 
 
 
351 aa  192  4e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0527  ABC transporter related  42.79 
 
 
348 aa  189  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1305  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  43.04 
 
 
353 aa  188  8e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.4508 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0922  ABC transporter related  44.23 
 
 
353 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2632  ABC transporter-related protein  39.3 
 
 
357 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.014615  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2057  ABC transporter related protein  42.92 
 
 
327 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0901178  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1759  ABC transporter related  45.67 
 
 
353 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1152  ABC transporter related  46.45 
 
 
312 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1022  ABC transporter related  45.67 
 
 
353 aa  182  6e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1331  ABC transporter related  40 
 
 
348 aa  181  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0148601 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0057  tungstate/molybdate transport system ATP-binding protein  45.02 
 
 
312 aa  180  1e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.72588  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3449  ABC transporter related  44.29 
 
 
363 aa  179  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1980  ABC transporter related  44.95 
 
 
355 aa  178  4.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0831  ABC transporter related  45.97 
 
 
314 aa  176  3e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0526  ABC transporter related protein  43.07 
 
 
314 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0396747  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1024  tungstate/molybdate transport system ATP-binding protein  42.11 
 
 
335 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0504961  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2487  ABC transporter related  40.95 
 
 
379 aa  172  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00872773  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1403  ABC transporter related protein  41.13 
 
 
351 aa  172  5.999999999999999e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.579406  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0754  ABC transporter related  36.36 
 
 
363 aa  171  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.23256 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1819  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40.87 
 
 
353 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.147813  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2551  ABC transporter related  38.91 
 
 
347 aa  171  7.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000325534 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.59 
 
 
367 aa  171  1e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2540  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  35.96 
 
 
364 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.534677 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  42.13 
 
 
355 aa  170  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3737  ABC transporter related  40.65 
 
 
349 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0766  ABC transporter related  45.02 
 
 
312 aa  170  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.812823  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3863  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.56 
 
 
359 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  41.62 
 
 
355 aa  170  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0669  ABC transporter related protein  40.67 
 
 
352 aa  170  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.324815 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3095  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.15 
 
 
376 aa  170  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.311566 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3192  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.15 
 
 
376 aa  170  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.246669 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0661  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 
368 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  38.03 
 
 
363 aa  168  5e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1719  ABC transporter related  36.49 
 
 
364 aa  168  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.430519 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3015  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.72 
 
 
376 aa  168  7e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0509545 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  41.74 
 
 
365 aa  168  7e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1002  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.15 
 
 
376 aa  168  8e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0210  ABC transporter-related protein  39.57 
 
 
363 aa  167  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  37.74 
 
 
368 aa  167  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4690  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.5 
 
 
379 aa  167  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.834348  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1063  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.72 
 
 
376 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0308  ABC transporter related  38.64 
 
 
360 aa  167  2e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3602  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  38.72 
 
 
376 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.21 
 
 
366 aa  166  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0077  ABC sugar transporter, ATPase subunit  36.82 
 
 
365 aa  166  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5470  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.71 
 
 
364 aa  166  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.867721  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1300  ABC transporter related  41.28 
 
 
356 aa  167  2e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.437284  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1582  ABC transporter related  40.26 
 
 
361 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0214  ABC transporter-related protein  41.63 
 
 
363 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4990  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.09 
 
 
363 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1511  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  40.5 
 
 
358 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280689  normal  0.146459 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1117  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.12 
 
 
367 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.417968  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1096  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.72 
 
 
376 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3853  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.53 
 
 
357 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0994  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.72 
 
 
376 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1865  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.45 
 
 
364 aa  166  4e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2913  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  37.09 
 
 
369 aa  165  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3295  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.3 
 
 
376 aa  165  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.53786 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  37.79 
 
 
358 aa  165  5e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2554  ABC transporter related  37.09 
 
 
369 aa  165  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.118826 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1702  ABC transporter related  40.37 
 
 
366 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28040  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  36.92 
 
 
350 aa  165  5.9999999999999996e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.539146  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  39.25 
 
 
356 aa  164  9e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5875  ABC transporter related protein  36.82 
 
 
351 aa  164  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0109503  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2681  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.01 
 
 
344 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.255864  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1180  ABC transporter related  42.27 
 
 
312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.584734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2402  ABC transporter related  38.46 
 
 
351 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2371  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.38 
 
 
393 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2302  ABC transporter related  40.55 
 
 
357 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.996895  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4297  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.4 
 
 
364 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4040  ABC transporter related  33.48 
 
 
365 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2153  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.03 
 
 
367 aa  164  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200708  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  36.8 
 
 
353 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3450  ABC transporter related  37.07 
 
 
384 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622564  normal  0.365938 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4505  ABC transporter  36.11 
 
 
368 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.615344 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0782  ABC transporter related  38.18 
 
 
356 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3872  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.8 
 
 
340 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1782  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.45 
 
 
364 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.132629  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  37.74 
 
 
367 aa  162  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0642  ABC transporter related protein  42.99 
 
 
342 aa  162  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0838  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  37.71 
 
 
370 aa  162  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2369  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.68 
 
 
373 aa  163  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  37.74 
 
 
367 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12425  sulfate-transport ATP-binding protein ABC transporter cysA1  38.01 
 
 
351 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00408359  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1882  ABC polyamine/opine transporter, ATPase subunit  36.92 
 
 
367 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.000264611  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0593  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.92 
 
 
360 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0530  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.92 
 
 
367 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3338  ABC transporter related  38.68 
 
 
352 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2068  ABC transporter related  37.56 
 
 
364 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1105  ABC transporter related  39.91 
 
 
319 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.788183  normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  34.63 
 
 
362 aa  162  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6149  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.5 
 
 
360 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>