102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1784 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_1784  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 240 aa  480  1e-135  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0137  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.27 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.948879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0388  cyclic nucleotide-binding protein  25.46 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.84 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3784  cAMP-regulatory protein  20 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0916512  hitchhiker  0.00483948 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3737  cAMP-regulatory protein  19.5 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0176942 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3771  cAMP-regulatory protein  19.5 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  0.523362 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3663  cAMP-regulatory protein  19.5 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3663  cAMP-regulatory protein  19.5 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185514  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3834  cAMP-regulatory protein  19.5 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0369  cAMP-regulatory protein  19.5 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0293  cAMP-regulatory protein  19.5 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03208  DNA-binding transcriptional dual regulator  19.5 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0355  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.5 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000236327  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3554  cAMP-regulatory protein  19.5 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0355  cAMP-regulatory protein  19.5 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0526852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3639  cAMP-regulatory protein  19.5 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000269957 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3733  cAMP-regulatory protein  19.5 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4667  cAMP-regulatory protein  19.5 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00224827  normal  0.233908 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03160  hypothetical protein  19.5 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0202429  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3853  cAMP-regulatory protein  19.5 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4032  cAMP-regulatory protein  19.5 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.203601  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3945  cAMP-regulatory protein  19.5 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3702  cAMP-regulatory protein  19.5 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0248  cAMP-regulatory protein  19.5 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4580  cAMP-regulatory protein  19.5 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0550419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3827  cAMP-regulatory protein  19 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2737  cAMP-regulatory protein  19.5 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2191  cAMP-regulatory protein  19.5 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00075  cAMP-regulatory protein  19.5 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002279  cyclic AMP receptor protein  19.5 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0662  cAMP-regulatory protein  19 
 
 		 211 aa  57  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000339306  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0548  cAMP-regulatory protein  20 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.549862  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3509  cAMP-regulatory protein  19 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000247338  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0139  cAMP-regulatory protein  19 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  19.8 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3190  cAMP-regulatory protein  20 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000213612  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3873  cAMP-regulatory protein  18.5 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000105148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3292  cAMP-regulatory protein  18.5 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0112541  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0585  cAMP-regulatory protein  18.5 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000009188  normal  0.481967 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0624  cAMP-regulatory protein  18.5 
 
 		 211 aa  53.1  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1498  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.92 
 
 		 239 aa  53.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0618  cAMP-regulatory protein  18.5 
 
 		 211 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000475791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3412  cAMP-regulatory protein  18.5 
 
 		 211 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000398691  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0617  cAMP-regulatory protein  18.5 
 
 		 211 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000135204  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0578  cAMP-regulatory protein  18.5 
 
 		 211 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.001638  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0652  cAMP-regulatory protein  18.5 
 
 		 211 aa  53.1  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000433673  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3747  cAMP-regulatory protein  18.5 
 
 		 211 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0179283  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3873  cAMP-regulatory protein  18.5 
 
 		 211 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000159716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3690  cAMP-regulatory protein  18.5 
 
 		 211 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0119951  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1894  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.42 
 
 		 214 aa  52.8  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000758315  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3004  cAMP-regulatory protein  18.5 
 
 		 211 aa  52.4  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000032723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0390  cyclic nucleotide-binding protein  25.12 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1643  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.2 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0060  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.67 
 
 		 234 aa  49.7  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4136  cyclic nucleotide-binding domain protein  21.23 
 
 		 233 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.32 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.77 
 
 		 229 aa  49.3  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0755  cAMP-regulatory protein  17.35 
 
 		 211 aa  49.3  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4121  cyclic nucleotide-binding domain protein  21.23 
 
 		 263 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  18.52 
 
 		 224 aa  48.9  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  20.44 
 
 		 243 aa  48.5  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.19 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0206  transcriptional regulator  23.04 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000707778  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  20.21 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  15.71 
 
 		 223 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46100  cAMP-regulatory protein  17.91 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0394  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.63 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  18.55 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2419  catabolite gene activator  20.6 
 
 		 231 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3735  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.24 
 
 		 227 aa  46.6  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0336  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.07 
 
 		 223 aa  46.2  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0158598  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3275  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.91 
 
 		 195 aa  45.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  hitchhiker  0.00943034 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6249  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 281 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.999867 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3786  transcriptional regulator  23.28 
 
 		 229 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0919672  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.99 
 
 		 232 aa  45.4  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1659  cyclic nucleotide-binding  15.71 
 
 		 223 aa  45.8  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.834954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2212  cyclic nucleotide-binding protein  22.45 
 
 		 230 aa  45.4  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0733  cyclic nucleotide-binding protein  22.42 
 
 		 232 aa  45.4  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0079  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.16 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.849443  normal  0.162256 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1234  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.53 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1592  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.67 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3858  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.92 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1258  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2547  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.19 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.389339  normal  0.365128 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  19.89 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1092  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.5 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  14.43 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1423  cyclic nucleotide-binding protein  22.46 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0243241  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2246  Crp/FNR family transcriptional regulator  19.07 
 
 		 233 aa  42.7  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  16.59 
 
 		 217 aa  42.7  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0968  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 233 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0349  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.53 
 
 		 222 aa  42.7  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000192919 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3943  cAMP-regulatory protein  17.09 
 
 		 214 aa  42.7  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0457  cAMP-regulatory protein  16.49 
 
 		 223 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89409  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3546  cyclic nucleotide-binding  30.09 
 
 		 124 aa  42  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.194157 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0954  cAMP-regulatory protein  20.21 
 
 		 216 aa  42  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.575012  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 260 aa  42  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3212  CRP/FNR family transcriptional regulator  19.89 
 
 		 229 aa  42  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0543887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2606  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  18.13 
 
 		 253 aa  42  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.193309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>