255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1778 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1778  ribosomal protein L3  100 
 
 		 351 aa  706    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.890936  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0091  50S ribosomal protein L3P  64.39 
 
 		 341 aa  451  1.0000000000000001e-126  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000432349  hitchhiker  0.00000658147 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0317  50S ribosomal protein L3P  47.18 
 
 		 347 aa  292  8e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1796  50S ribosomal protein L3P  45.45 
 
 		 342 aa  288  1e-76  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.483338  normal  0.601736 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1583  50S ribosomal protein L3P  45.15 
 
 		 338 aa  287  1e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0813  50S ribosomal protein L3P  44.48 
 
 		 338 aa  281  9e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2046  50S ribosomal protein L3P  42.94 
 
 		 338 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0081  50S ribosomal protein L3P  42.36 
 
 		 333 aa  269  7e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.123311 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0230  50S ribosomal protein L3P  45.85 
 
 		 334 aa  268  1e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0532  50S ribosomal protein L3P  41.36 
 
 		 337 aa  252  6e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0001  50S ribosomal protein L3P  40.17 
 
 		 337 aa  249  5e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0115454  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2253  50S ribosomal protein L3P  41.5 
 
 		 337 aa  245  6.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.0000000000233811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1521  ribosomal protein L3  42.98 
 
 		 340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000186989  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0857  50S ribosomal protein L3P  39.66 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603922  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0442  50S ribosomal protein L3P  38.9 
 
 		 337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00631361  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0791  50S ribosomal protein L3P  38.81 
 
 		 334 aa  233  5e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.106931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1127  50S ribosomal protein L3P  38.81 
 
 		 334 aa  231  1e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0110  50S ribosomal protein L3P  40.63 
 
 		 337 aa  231  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0807  50S ribosomal protein L3P  40.06 
 
 		 333 aa  228  2e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0033  50S ribosomal protein L3P  39.38 
 
 		 334 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.555828  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2218  ribosomal protein L3  39.08 
 
 		 339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2292  50S ribosomal protein L3P  39.26 
 
 		 338 aa  217  2e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0210  ribosomal protein L3  38.11 
 
 		 340 aa  217  2.9999999999999998e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0564  50S ribosomal protein L3P  39.89 
 
 		 337 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.415651  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2449  50S ribosomal protein L3P  37.93 
 
 		 338 aa  211  1e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1728  50S ribosomal protein L3P  39.77 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1828  50S ribosomal protein L3P  36.89 
 
 		 338 aa  202  8e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.752407 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0809  50S ribosomal protein L3P  35.8 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.5331 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23838  Ribosomal protein L3, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  34.84 
 
 		 386 aa  192  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06202  60S ribosomal protein L3 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV31]  35.93 
 
 		 392 aa  180  2.9999999999999997e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.123441  normal  0.683069 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88844  60S large subunit ribosomal protein L3.e  33.33 
 
 		 389 aa  175  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000473174 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13361  predicted protein  33.99 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02240  large subunit ribosomal protein L3, putative  32.25 
 
 		 390 aa  169  8e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0226  ribosomal protein L3  24.14 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  33.79 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  32.59 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0477  ribosomal protein L3  26.67 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  30.56 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  31.25 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  31.11 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  33.09 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  33.09 
 
 		 219 aa  58.9  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  32 
 
 		 209 aa  58.5  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0696  50S ribosomal protein L3  31.62 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372092  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0291  50S ribosomal protein L3  29.32 
 
 		 226 aa  57  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0279726  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  30.15 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  25.2 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  28.99 
 
 		 219 aa  55.5  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05715  50S ribosomal protein L3  24.37 
 
 		 205 aa  55.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499117  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  26.91 
 
 		 209 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04308  50S ribosomal protein L3 (AFU_orthologue; AFUA_4G06000)  29.32 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.569761  normal  0.446877 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0842  ribosomal protein L3  35.35 
 
 		 210 aa  54.7  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0602  ribosomal protein L3  28.17 
 
 		 205 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1147  50S ribosomal protein L3  26.19 
 
 		 205 aa  55.1  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000530687  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  34.69 
 
 		 209 aa  54.7  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2065  50S ribosomal protein L3  31.06 
 
 		 209 aa  54.3  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000562685  normal  0.223373 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  35.87 
 
 		 213 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl123  50S ribosomal protein L3  30.88 
 
 		 238 aa  54.3  0.000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  9.499549999999999e-37  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0397  50S ribosomal protein L3  24.37 
 
 		 205 aa  54.7  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29740  LSU ribosomal protein L3P  36 
 
 		 219 aa  53.9  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1908  50S ribosomal protein L3  33.11 
 
 		 251 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.0000666211  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  25.91 
 
 		 209 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  30.22 
 
 		 212 aa  53.9  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477342  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3143  ribosomal protein L3  38 
 
 		 220 aa  53.9  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0896196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  30.15 
 
 		 210 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  30.15 
 
 		 210 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  30.15 
 
 		 210 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  30.15 
 
 		 210 aa  53.5  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  30.15 
 
 		 210 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  30.15 
 
 		 210 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  30.15 
 
 		 210 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  28.87 
 
 		 222 aa  53.5  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  30.15 
 
 		 210 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf444  50S ribosomal protein L3  29.77 
 
 		 272 aa  53.1  0.000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  31.85 
 
 		 210 aa  53.1  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1707  50S ribosomal protein L3  29.93 
 
 		 213 aa  52.8  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00287886  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  30.43 
 
 		 210 aa  52.8  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3184  50S ribosomal protein L3  31.08 
 
 		 241 aa  52.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0255  50S ribosomal protein L3  30.37 
 
 		 216 aa  53.1  0.000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2295  50S ribosomal protein L3  31.08 
 
 		 241 aa  52.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.208752 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0688  ribosomal protein L3  36 
 
 		 219 aa  52.8  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0353  50S ribosomal protein L3  33.11 
 
 		 246 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1354  50S ribosomal protein L3  30 
 
 		 240 aa  52.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.03305 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0484  50S ribosomal protein L3  29.2 
 
 		 212 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000199127  normal  0.0280354 
 
 
 
NC_010505  Mrad2831_2218  50S ribosomal protein L3  34.29 
 
 		 241 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5070  50S ribosomal protein L3  31.94 
 
 		 239 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.621506 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3162  50S ribosomal protein L3  31.97 
 
 		 206 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  30.15 
 
 		 219 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  28.87 
 
 		 218 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  24.75 
 
 		 214 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1555  ribosomal protein L3  32.82 
 
 		 210 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00791107  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  27.21 
 
 		 216 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  29.37 
 
 		 211 aa  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  28.68 
 
 		 208 aa  51.6  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2774  ribosomal protein L3  37.36 
 
 		 210 aa  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.039291  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3667  50S ribosomal protein L3  30.41 
 
 		 241 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3448  50S ribosomal protein L3  32.86 
 
 		 243 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.925386 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0279  50S ribosomal protein L3  24.4 
 
 		 214 aa  51.6  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000003338  unclonable  0.000000102958 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  29.41 
 
 		 210 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2064  50S ribosomal protein L3  44.74 
 
 		 209 aa  51.6  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000717701  normal  0.401636 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>