More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8710 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8710  Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity-like protein  100 
 
 
258 aa  523  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  57.59 
 
 
247 aa  232  5e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.17 
 
 
252 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0676  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.78 
 
 
254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00917144  normal  0.0792915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.39 
 
 
249 aa  179  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.81 
 
 
259 aa  172  5.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.3 
 
 
255 aa  168  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.06 
 
 
242 aa  166  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.186526  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.51 
 
 
246 aa  157  1e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.1 
 
 
249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4636  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 
254 aa  152  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.43 
 
 
248 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0635  putative short-chain dehydrogenase/reductase  44.62 
 
 
246 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.660542  normal  0.0297002 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.49 
 
 
243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.81 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  hitchhiker  0.00314525 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.93 
 
 
244 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4141  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.1 
 
 
243 aa  143  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.77 
 
 
248 aa  142  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 
244 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0125509  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
239 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1571  Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity  39.89 
 
 
243 aa  138  7.999999999999999e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  43.24 
 
 
1270 aa  137  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.05 
 
 
253 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.39 
 
 
247 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.340445  normal  0.365193 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47104  non ribosomal peptide synthase  39.69 
 
 
1367 aa  136  3.0000000000000003e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 
243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.853199  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.16 
 
 
245 aa  136  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.553727  normal  0.0273902 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4057  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.7 
 
 
239 aa  135  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05303  oxidoreductase  40.53 
 
 
239 aa  135  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.76 
 
 
246 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.267776 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
247 aa  135  8e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.269971  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4937  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.64 
 
 
239 aa  134  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.396795  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0184  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.57 
 
 
239 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.138701 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4325  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 
241 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.21 
 
 
233 aa  132  5e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.75 
 
 
252 aa  131  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.92 
 
 
255 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0691518 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.809389  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.83 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
232 aa  130  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.21 
 
 
239 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
244 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
230 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.224966  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 
261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01927  putative oxidoreductase  38.05 
 
 
252 aa  128  7.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.160278  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
246 aa  129  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000420  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  39.04 
 
 
239 aa  128  8.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.637186  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1636  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.57 
 
 
233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.42 
 
 
246 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.42 
 
 
246 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.57 
 
 
231 aa  126  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2243  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.89 
 
 
184 aa  126  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000317715  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 
240 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148916  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.57 
 
 
231 aa  126  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 
246 aa  125  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0101774  normal  0.961149 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 
252 aa  125  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.11 
 
 
230 aa  124  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 
264 aa  122  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
237 aa  122  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.756927  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.32 
 
 
255 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0112  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.26 
 
 
244 aa  122  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.57 
 
 
233 aa  122  5e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 
238 aa  122  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1309  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.06 
 
 
236 aa  122  8e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1031  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 
233 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.92 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
245 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 
248 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.172179  normal  0.840489 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.58 
 
 
247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 
253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542817  normal  0.89387 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.53 
 
 
255 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111492  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0107  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 
271 aa  119  6e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2186  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.63 
 
 
241 aa  119  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110488 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.33 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0721  2-hydroxycyclohexanecarboxyl-CoA dehydrogenase  35.89 
 
 
255 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.95 
 
 
240 aa  116  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3894  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 
248 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 
256 aa  116  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 
257 aa  116  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.76225  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 
248 aa  116  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445367  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0122  oxidoreductase  33.99 
 
 
253 aa  115  5e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.49595  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.95 
 
 
250 aa  115  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241835 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.05 
 
 
248 aa  115  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
280 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
244 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
244 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365065 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2737  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 
245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.18 
 
 
247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.622721  normal  0.233653 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.07 
 
 
267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848764  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.54 
 
 
248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 
252 aa  113  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.586754  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
246 aa  113  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.29 
 
 
257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0119499 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.7 
 
 
254 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0323  clavaldehyde dehydrogenase  39.04 
 
 
245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.869868 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3922  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 
250 aa  112  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>