65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8545 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8545  membrane protein/domain-like protein  100 
 
 		 175 aa  350  4e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  36.49 
 
 		 211 aa  80.9  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0371  RDD domain containing protein  35.29 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  30.38 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1247  RDD domain containing protein  32.12 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  26.14 
 
 		 185 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  36.36 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  29.41 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1509  hypothetical protein  37.04 
 
 		 375 aa  54.3  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9150  membrane protein/domain-like protein  29.52 
 
 		 447 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  27.78 
 
 		 170 aa  52.4  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2897  hypothetical protein  30.77 
 
 		 191 aa  51.2  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.607229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0948  RDD domain-containing protein  24.31 
 
 		 276 aa  50.8  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000870285  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  29.19 
 
 		 214 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2381  RDD domain-containing protein  37.04 
 
 		 414 aa  50.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1683  RDD domain-containing protein  37.04 
 
 		 424 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4477  RDD domain containing protein  32.19 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3457  RDD domain containing protein  25.76 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.052067 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  26.88 
 
 		 310 aa  49.3  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1562  RDD domain-containing protein  34.57 
 
 		 449 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0211691 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1568  RDD domain-containing protein  34.57 
 
 		 448 aa  48.5  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.957894  normal  0.02442 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  31.01 
 
 		 169 aa  48.5  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1501  RDD domain-containing protein  34.57 
 
 		 444 aa  48.5  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.561992  hitchhiker  0.000145013 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2763  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 		 412 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.136751  hitchhiker  0.000413792 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1700  RDD domain containing protein  33.33 
 
 		 415 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6304  hitchhiker  0.00000345448 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2684  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 		 415 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0059123  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2662  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 		 412 aa  48.1  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1722  RDD domain-containing protein  37.04 
 
 		 403 aa  48.1  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000166004 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0288  RDD domain-containing protein  27.74 
 
 		 276 aa  47.8  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2902  hypothetical protein  34.57 
 
 		 376 aa  47.8  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2369  RDD domain-containing protein  28 
 
 		 398 aa  46.2  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  34.04 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2856  RDD domain-containing protein  35.8 
 
 		 375 aa  46.6  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762039 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  32.56 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0445  hypothetical protein  35.56 
 
 		 152 aa  45.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2514  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 		 453 aa  45.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  28.36 
 
 		 175 aa  45.1  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  30.3 
 
 		 270 aa  44.7  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04050  RDD family protein  29.94 
 
 		 424 aa  44.7  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0643  RDD family protein  30.25 
 
 		 195 aa  44.3  0.0009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1701  RDD domain containing protein  31.65 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000482282  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  44.29 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1918  RDD protein  36.78 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.002418  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3129  RDD domain containing protein  33.88 
 
 		 304 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0704  RDD domain-containing protein  40 
 
 		 327 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3673  RDD domain containing protein  27.22 
 
 		 323 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  26.53 
 
 		 145 aa  42.4  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0093  RDD domain containing protein  34.44 
 
 		 211 aa  42  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  27.14 
 
 		 257 aa  42.4  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1489  RDD domain containing protein  31.33 
 
 		 155 aa  41.6  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126204  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4558  RDD domain-containing protein  31.11 
 
 		 272 aa  41.6  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0451  RDD domain-containing protein  27.59 
 
 		 153 aa  41.6  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0008  hypothetical protein  25 
 
 		 171 aa  41.6  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.018988  normal  0.471387 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0726  RDD domain containing protein  35.14 
 
 		 156 aa  41.6  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  27.7 
 
 		 166 aa  41.2  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2609  serine/threonine protein kinase  27.91 
 
 		 415 aa  41.6  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1348  RDD domain containing protein  32.35 
 
 		 161 aa  41.2  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0476544  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5164  RDD domain containing protein  37.68 
 
 		 142 aa  41.2  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638889 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3769  RDD domain containing protein  29.61 
 
 		 258 aa  40.8  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  30 
 
 		 590 aa  40.8  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2608  RDD domain-containing protein  27.97 
 
 		 456 aa  40.8  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.107491 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5849  RDD domain-containing protein  27.97 
 
 		 316 aa  40.8  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.273522 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  25.17 
 
 		 295 aa  40.8  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2675  RDD domain-containing protein  29.11 
 
 		 306 aa  40.8  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0232  RDD domain containing protein  32.94 
 
 		 247 aa  40.8  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>