More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8214 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8214  short chain dehydrogenase  100 
 
 
248 aa  483  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  77.33 
 
 
255 aa  332  3e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.843425  normal  0.851299 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.39 
 
 
256 aa  318  6e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.254174 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.73 
 
 
251 aa  302  4.0000000000000003e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.39 
 
 
253 aa  296  2e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.562893  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00620  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  65.71 
 
 
260 aa  293  1e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.297652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6298  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.29 
 
 
271 aa  278  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.1246  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2446  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.29 
 
 
246 aa  278  4e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0818672  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4194  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.29 
 
 
252 aa  277  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.870685  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.98 
 
 
256 aa  270  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.18 
 
 
251 aa  195  7e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.77 
 
 
248 aa  194  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.08 
 
 
250 aa  191  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1486  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.92 
 
 
241 aa  169  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.727774  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
258 aa  161  9e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
252 aa  157  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.74 
 
 
244 aa  155  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.248002  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
250 aa  155  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.165554 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3393  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
252 aa  154  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
246 aa  153  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
269 aa  153  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 
291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.60014  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3961  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.84 
 
 
243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.985096  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1587  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.87 
 
 
256 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
252 aa  152  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
270 aa  152  7e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2513  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.21 
 
 
250 aa  151  8e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
254 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 
257 aa  150  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.759988  normal  0.0474831 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 
246 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 
262 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351696  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1699  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  39.43 
 
 
246 aa  150  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0105879 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 
257 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19857  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2412  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  39.43 
 
 
246 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.14 
 
 
255 aa  149  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.56 
 
 
251 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
254 aa  149  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
252 aa  149  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000391653  normal  0.106705 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 
271 aa  148  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.224446 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 
250 aa  148  9e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553116  normal  0.644711 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.68 
 
 
246 aa  148  9e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.86 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214979  normal  0.444362 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4062  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171649  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal  0.103076 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0353846 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.68 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
251 aa  146  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000407954 
 
 
-
 
NC_004310  BR0243  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.74 
 
 
244 aa  146  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.550186  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0236  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.74 
 
 
244 aa  146  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.117254  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
266 aa  145  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.388787  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.49 
 
 
246 aa  146  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.09 
 
 
244 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742877  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.05 
 
 
254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2700  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.15 
 
 
268 aa  145  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.657901 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
249 aa  145  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2957  putative short-chain dehydrogenase/reductase  40.08 
 
 
247 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2060  short chain dehydrogenase  38.89 
 
 
257 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2106  short chain dehydrogenase  38.89 
 
 
257 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.077628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2043  short chain dehydrogenase  38.89 
 
 
257 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 
260 aa  144  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.730129 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 
251 aa  144  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 
252 aa  144  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.100065 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 
251 aa  144  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2377  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
249 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.496864  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4826  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.66 
 
 
244 aa  144  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.806753 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4004  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.54 
 
 
259 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.132038  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
246 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.368584  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
261 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.861263  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.47 
 
 
255 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1758  hypothetical protein  38.25 
 
 
254 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.0728091 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.5 
 
 
247 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4222  putative Levodione reductase  39.76 
 
 
257 aa  142  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3256  malate/L-lactate dehydrogenase  39.26 
 
 
247 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0180309  normal  0.2268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
257 aa  142  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
251 aa  142  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.26 
 
 
246 aa  142  6e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
258 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2281  short chain dehydrogenase  39.04 
 
 
257 aa  142  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  36.72 
 
 
255 aa  141  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
250 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 
247 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal  0.690842 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000174886  normal  0.399546 
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.44 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2468  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.5 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2499  short chain dehydrogenase  33.99 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.496805  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6964  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.65 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.175664  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.63 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.68 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.25 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2549  short chain dehydrogenase  33.99 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.47 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 
254 aa  139  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
244 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.525442  normal  0.830856 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3299  hypothetical protein  37.8 
 
 
257 aa  140  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982919  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 
254 aa  139  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.44826  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12873  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 
258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>