More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0638 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
246 aa  499  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.368584  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2412  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  77.64 
 
 
246 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1699  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  77.64 
 
 
246 aa  396  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0105879 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  77.64 
 
 
246 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.08 
 
 
244 aa  345  5e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.372052 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.03 
 
 
247 aa  342  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.85 
 
 
247 aa  338  5e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214979  normal  0.444362 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2957  putative short-chain dehydrogenase/reductase  69.26 
 
 
247 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.39 
 
 
254 aa  321  8e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.39 
 
 
254 aa  321  8e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699646  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1604  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  63.67 
 
 
247 aa  317  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.78 
 
 
254 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.572061  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.34 
 
 
244 aa  315  5e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0620  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.2 
 
 
254 aa  315  5e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.89 
 
 
254 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.387119 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4971  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.5 
 
 
254 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.82 
 
 
246 aa  307  9e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1159  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  63.67 
 
 
247 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2375  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  63.67 
 
 
247 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.388212  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1785  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  63.27 
 
 
247 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0642  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  63.27 
 
 
247 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.48 
 
 
251 aa  301  4.0000000000000003e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000407954 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0823  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  63.27 
 
 
247 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1082  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  63.27 
 
 
247 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.175949  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.79 
 
 
246 aa  301  6.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.86578  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.07 
 
 
250 aa  300  2e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3393  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.94 
 
 
252 aa  298  4e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.69 
 
 
244 aa  295  5e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742877  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.29 
 
 
261 aa  291  6e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.2 
 
 
247 aa  291  8e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3595  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.63 
 
 
254 aa  286  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.428545  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4971  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.54 
 
 
244 aa  287  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475551  normal  0.122144 
 
 
-
 
NC_004310  BR0243  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  60.89 
 
 
244 aa  286  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.550186  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0236  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  60.89 
 
 
244 aa  286  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.117254  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.98 
 
 
242 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0353846 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03264  dehydrogenase/reductase SDR family member 6  58.47 
 
 
256 aa  280  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.41 
 
 
244 aa  279  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.525442  normal  0.830856 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7201  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.6 
 
 
244 aa  278  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.10023 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.94 
 
 
247 aa  276  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal  0.690842 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5692  oxidoreductase  59.51 
 
 
244 aa  276  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56 
 
 
250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.4 
 
 
244 aa  272  4.0000000000000004e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.248002  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.09 
 
 
248 aa  271  5.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407204  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.89 
 
 
246 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.335692 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0174  short-chain dehydrogenase  60.89 
 
 
246 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3876  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.91 
 
 
266 aa  270  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.23 
 
 
248 aa  266  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055401 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.28 
 
 
244 aa  265  7e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.88 
 
 
244 aa  263  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00509935 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3961  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.28 
 
 
243 aa  257  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.985096  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.66 
 
 
244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.36 
 
 
250 aa  253  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0497593 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3649  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.1 
 
 
244 aa  251  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.6 
 
 
253 aa  248  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.199274  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0788  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.03 
 
 
244 aa  245  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4150  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.67 
 
 
236 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.639156 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3889  Short-chain dehydrogenase/reductase  56.67 
 
 
236 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.521289  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3256  malate/L-lactate dehydrogenase  47.18 
 
 
247 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0180309  normal  0.2268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3550  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.63 
 
 
244 aa  227  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.652114  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.25 
 
 
252 aa  181  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.57 
 
 
246 aa  180  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.18 
 
 
246 aa  178  9e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2581  short chain dehydrogenase  42.69 
 
 
263 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3656  short chain dehydrogenase  42.29 
 
 
263 aa  176  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02326  short chain dehydrogenase  42.29 
 
 
263 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 
263 aa  175  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2712  short chain dehydrogenase  42.29 
 
 
263 aa  175  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2798  short chain dehydrogenase  42.29 
 
 
263 aa  175  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2562  short chain dehydrogenase  42.29 
 
 
263 aa  175  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02287  hypothetical protein  42.29 
 
 
263 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1253  short chain dehydrogenase  42.29 
 
 
263 aa  175  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  41.9 
 
 
263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  41.9 
 
 
263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  41.9 
 
 
263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  41.9 
 
 
263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  41.9 
 
 
263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1486  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.84 
 
 
241 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.727774  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
258 aa  157  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
251 aa  156  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
251 aa  156  3e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 
248 aa  155  4e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
255 aa  155  8e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.74 
 
 
244 aa  154  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
245 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
257 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2335  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.65 
 
 
252 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.734906  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 
260 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.730129 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
252 aa  152  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0313  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.76 
 
 
239 aa  152  2.9999999999999998e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00087118  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1680  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.04 
 
 
252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.509013  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
252 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
254 aa  152  7e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 
257 aa  149  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.759988  normal  0.0474831 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 
258 aa  149  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 
258 aa  149  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143319  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3073  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.37 
 
 
250 aa  149  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
263 aa  149  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.170949  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2696  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.21 
 
 
260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.83 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.524873  normal  0.240055 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>