162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6632 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6632  cyclase family protein  100 
 
 		 265 aa  514  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  58.98 
 
 		 269 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18600  predicted metal-dependent hydrolase  55.69 
 
 		 273 aa  255  5e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4084  cyclase family protein  53.46 
 
 		 280 aa  238  8e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  42.91 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0352  putative cyclase  42.08 
 
 		 270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.746436  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2377  cyclase family protein  32.84 
 
 		 335 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.359406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2775  cyclase  32.23 
 
 		 329 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0591  cyclase family protein  31.37 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1165  cyclase family protein  35.32 
 
 		 342 aa  119  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2733  cyclase family protein  36.72 
 
 		 270 aa  112  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146195  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3501  putative cyclase  28.15 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2682  cyclase family protein  32.71 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8748  putative cyclase  36.94 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0905009 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4416  putative cyclase  32.19 
 
 		 351 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.225331  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4354  putative cyclase  32.19 
 
 		 351 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3020  putative cyclase  29.04 
 
 		 311 aa  95.5  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2432  putative cyclase  29.43 
 
 		 315 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  0.086653 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3668  putative polyketide cyclase  29.2 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.670549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0926  cyclase family protein  26.87 
 
 		 312 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4855  cyclase family protein  26.12 
 
 		 320 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0867808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1287  putative cyclase  29.79 
 
 		 398 aa  91.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.468573  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2102  cyclase family protein  33.94 
 
 		 309 aa  89.7  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.29081  normal  0.93943 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2952  putative cyclase SCIF3.09c  34.3 
 
 		 318 aa  86.7  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00019311 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2025  cyclase family protein  27 
 
 		 311 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.761271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4240  hypothetical protein  35.43 
 
 		 332 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1999  cyclase family protein  33.19 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5448  putative cyclase  25.87 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5414  cyclase family protein  25.87 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00312327 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0433  hypothetical protein  30.07 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1553  hypothetical protein  30.26 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4717  hypothetical protein  28.57 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2406  hypothetical protein  32.74 
 
 		 332 aa  78.6  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3781  hypothetical protein  31.05 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3854  hypothetical protein  31.05 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3785  hypothetical protein  31.05 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0079208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3546  cyclase SCIF309c  29.27 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  28.63 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  30.48 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5324  hypothetical protein  30.59 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  29.6 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1691  hypothetical protein  28.05 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  29.25 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2868  hypothetical protein  31.75 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4455  hypothetical protein  30.97 
 
 		 320 aa  68.6  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.875794  normal  0.0452854 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0661  hypothetical protein  29.15 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.474211  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0378  cyclase family protein  29.96 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  32.83 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1239  hypothetical protein  30 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  29.8 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  29.62 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0929  hypothetical protein  31.43 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5118  hypothetical protein  30.25 
 
 		 342 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  30.04 
 
 		 213 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  28.52 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  25.68 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2893  hypothetical protein  28.15 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3051  hypothetical protein  28.85 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4925  cyclase family protein  31.2 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346514  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2912  hypothetical protein  29.58 
 
 		 345 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1259  hypothetical protein  32.28 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1270  hypothetical protein  29.17 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3027  hypothetical protein  29.17 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3037  hypothetical protein  31.75 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2674  cyclase family protein  27.38 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430104  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1937  cyclase family protein  27.72 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  25.1 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11731  hypothetical protein  30.37 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000634695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  26.47 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1641  hypothetical protein  30.16 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.549123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2003  cyclase family protein  26.85 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.134376  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4678  hypothetical protein  30.3 
 
 		 344 aa  55.8  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0313  cyclase family protein  29.44 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3121  hypothetical protein  28.9 
 
 		 362 aa  55.5  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3848  hypothetical protein  28.9 
 
 		 362 aa  55.5  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3004  cyclase family protein  39.83 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0209001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  29.18 
 
 		 237 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1555  putative cyclase  26.89 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  24.71 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0347  cyclase family protein  24.61 
 
 		 205 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3764  hypothetical protein  29.9 
 
 		 350 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0102457 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1814  hypothetical protein  31.18 
 
 		 341 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00302698 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05060  conserved hypothetical protein  26.53 
 
 		 343 aa  53.9  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103413  hitchhiker  0.0000000000000229017 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4678  hypothetical protein  28.93 
 
 		 352 aa  53.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128593  normal  0.183965 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4953  hypothetical protein  25.82 
 
 		 340 aa  53.9  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.682064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3942  hypothetical protein  30.98 
 
 		 356 aa  53.9  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.05744  normal  0.099663 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2278  cyclase family protein  24.4 
 
 		 205 aa  53.1  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000843972  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  29.08 
 
 		 217 aa  53.5  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  24.32 
 
 		 226 aa  53.5  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0716  hypothetical protein  28.75 
 
 		 354 aa  52.8  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.582207 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3327  hypothetical protein  28.32 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0321448  decreased coverage  0.00361328 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0564  cyclase family protein  27.13 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1722  metal-dependent hydrolase  28.14 
 
 		 342 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1511  putative cyclase  37.01 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.3685  normal  0.674616 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2579  metal-dependent hydrolase  31.35 
 
 		 348 aa  51.6  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  24.6 
 
 		 213 aa  52  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2224  hypothetical protein  30.41 
 
 		 336 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2232  hypothetical protein  26.4 
 
 		 335 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  30.2 
 
 		 216 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2580  putative cyclase  38.89 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.450576 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>