More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6259 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6259  protein of unknown function DUF152  100 
 
 
228 aa  456  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  73.01 
 
 
238 aa  330  9e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3850  protein of unknown function DUF152  72.69 
 
 
238 aa  325  5e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4306  hypothetical protein  56.33 
 
 
246 aa  243  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  56 
 
 
241 aa  227  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0901  protein of unknown function DUF152  52 
 
 
239 aa  211  9e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6103  protein of unknown function DUF152  48.48 
 
 
249 aa  206  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.088522  normal  0.080286 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  51.1 
 
 
234 aa  204  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3519  hypothetical protein  49.78 
 
 
229 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00355999  normal  0.0410879 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  48.68 
 
 
252 aa  198  6e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5759  protein of unknown function DUF152  51.1 
 
 
228 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.75056  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3258  protein of unknown function DUF152  53.54 
 
 
243 aa  193  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.373021  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2642  protein of unknown function DUF152  47.35 
 
 
253 aa  191  6e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3797  protein of unknown function DUF152  53.98 
 
 
255 aa  191  7e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.424236  normal  0.70382 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5093  hypothetical protein  48 
 
 
224 aa  191  9e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196567  hitchhiker  0.00745461 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3263  hypothetical protein  49.33 
 
 
230 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0200173  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3252  hypothetical protein  49.33 
 
 
230 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227906  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3314  hypothetical protein  49.33 
 
 
230 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1288  protein of unknown function DUF152  50 
 
 
274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1419  hypothetical protein  47.11 
 
 
227 aa  175  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0337019  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2992  hypothetical protein  47.79 
 
 
236 aa  164  8e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.611604  normal  0.033024 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12179  hypothetical protein  50 
 
 
250 aa  164  8e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.376806  normal  0.713788 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10850  conserved hypothetical protein TIGR00726  46.22 
 
 
244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00949972  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1599  protein of unknown function DUF152  49.34 
 
 
251 aa  156  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.149332  normal  0.694465 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  42.17 
 
 
255 aa  151  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1574  hypothetical protein  43.95 
 
 
235 aa  145  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.436544  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3195  protein of unknown function DUF152  48.66 
 
 
241 aa  144  8.000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0539561  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1575  protein of unknown function DUF152  43.46 
 
 
229 aa  143  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  43.18 
 
 
255 aa  139  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  42.73 
 
 
255 aa  136  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  42.27 
 
 
255 aa  136  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  41.82 
 
 
259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1013  hypothetical protein  39.82 
 
 
240 aa  133  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0176891 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  42.13 
 
 
255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2406  protein of unknown function DUF152  42.11 
 
 
261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.270462 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16530  hypothetical protein  41.59 
 
 
283 aa  132  5e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.039671  normal  0.0289656 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  37.61 
 
 
265 aa  132  6e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  37.61 
 
 
283 aa  131  6.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1083  hypothetical protein  40.95 
 
 
326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0554  hypothetical protein  34.23 
 
 
239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.13428  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3170  hypothetical protein  35.2 
 
 
262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013997  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2992  hypothetical protein  35.2 
 
 
262 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000583281  normal  0.469772 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  39.09 
 
 
265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  38.46 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  37.34 
 
 
232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1551  hypothetical protein  39.75 
 
 
268 aa  126  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126788  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3578  hypothetical protein  35.1 
 
 
257 aa  125  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1906  hypothetical protein  35.09 
 
 
233 aa  125  6e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000349044  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3073  hypothetical protein  34.4 
 
 
262 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000509857  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  38.89 
 
 
255 aa  122  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3059  hypothetical protein  45.81 
 
 
231 aa  122  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0765579  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  32.41 
 
 
263 aa  122  7e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  36.84 
 
 
243 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  36.84 
 
 
243 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  36.84 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  36.84 
 
 
243 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  36.4 
 
 
243 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  36.84 
 
 
243 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  36.4 
 
 
243 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  38.14 
 
 
276 aa  119  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  36.4 
 
 
243 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  36.4 
 
 
243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  36.4 
 
 
243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  36.4 
 
 
243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  36.4 
 
 
243 aa  118  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  36.4 
 
 
243 aa  118  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  39.91 
 
 
255 aa  118  6e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  39.13 
 
 
259 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1903  protein of unknown function DUF152  38.17 
 
 
274 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1444  hypothetical protein  29.73 
 
 
229 aa  116  3e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3073  hypothetical protein  35.96 
 
 
243 aa  115  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0206514  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  39.13 
 
 
223 aa  115  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2879  hypothetical protein  35.96 
 
 
243 aa  115  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  38.36 
 
 
250 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  37.85 
 
 
264 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  38.7 
 
 
244 aa  115  7.999999999999999e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  37.04 
 
 
264 aa  115  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  37.67 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2101  hypothetical protein  40.61 
 
 
263 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.477366  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2550  hypothetical protein  41.18 
 
 
255 aa  113  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.810005  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  38.14 
 
 
260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1345  hypothetical protein  37.7 
 
 
265 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  36.93 
 
 
264 aa  112  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  36.93 
 
 
264 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1354  hypothetical protein  37.6 
 
 
263 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.487707  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  35.15 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1010  protein of unknown function DUF152  38.1 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0885  hypothetical protein  36.68 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0768127 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  31.91 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1578  hypothetical protein  42.47 
 
 
250 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3524  protein of unknown function DUF152  39.74 
 
 
252 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0215  uncharacterized protein, YfiH family  31.37 
 
 
321 aa  109  3e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3158  protein of unknown function DUF152  37.45 
 
 
256 aa  108  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  35 
 
 
266 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  37.21 
 
 
257 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  34.62 
 
 
246 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  36.86 
 
 
254 aa  107  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1824  protein of unknown function DUF152  32.6 
 
 
224 aa  107  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  36.74 
 
 
255 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0015  hypothetical protein  31.95 
 
 
270 aa  107  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0430923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>