212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2650 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2650  cobalamin 5'-phosphate synthase  100 
 
 
323 aa  602  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.78 
 
 
275 aa  155  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0996  cobalamin-5'-phosphate synthase  58.95 
 
 
253 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3131  cobalamin-5'-phosphate synthase  38.54 
 
 
278 aa  147  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0389088  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1839  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  56.5 
 
 
259 aa  145  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08520  cobalamin-5-phosphate synthase  48.95 
 
 
271 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3546  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  53.41 
 
 
257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0872247  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0946  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  55.96 
 
 
252 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3314  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  50.55 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.282641  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3090  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  57.89 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000185434  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0166  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  49.43 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3068  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  43.43 
 
 
261 aa  98.6  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.332139  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0939  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.92 
 
 
278 aa  90.1  5e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102205  normal  0.527982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1357  cobalamin 5'-phosphate synthase  52.88 
 
 
237 aa  89.7  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.356265  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.36 
 
 
249 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12236  cobalamin synthase  43.36 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.144082  normal  0.239675 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1526  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  37.65 
 
 
250 aa  79.7  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.833751  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.67 
 
 
251 aa  78.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0585  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  52.48 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3572  cobalamin synthase  48.28 
 
 
243 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.0400887 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  34.91 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  38.46 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.73 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  36.81 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  36.81 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  36.99 
 
 
247 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  36.99 
 
 
247 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  38.39 
 
 
247 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  38.39 
 
 
247 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  38.39 
 
 
247 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  38.39 
 
 
247 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  38.39 
 
 
240 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  36.99 
 
 
247 aa  72  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  36.99 
 
 
247 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.11 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  41.27 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3306  cobalamin synthase  42.36 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3368  cobalamin synthase  42.36 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  37.43 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2941  cobalamin synthase  43.24 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3317  cobalamin synthase  42.36 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  47.42 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  33.14 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  36.55 
 
 
247 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  44.44 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3306  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.64 
 
 
273 aa  68.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000293858  normal  0.059508 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2697  cobalamin 5'-phosphate synthase  39 
 
 
275 aa  68.9  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.33 
 
 
248 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  36.3 
 
 
248 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  40 
 
 
247 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  46.32 
 
 
250 aa  67.4  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  44.12 
 
 
258 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2319  cobalamin synthase  38.26 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4260  cobalamin 5'-phosphate synthase  50.65 
 
 
265 aa  67  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907003  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.16 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1718  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  36.53 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.659499  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  36 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2082  cobalamin synthase  42.35 
 
 
260 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439271  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.55 
 
 
254 aa  65.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0641  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  45.12 
 
 
278 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0112023 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0678  cobalamin-5'-phosphate synthase  45 
 
 
270 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0518916  normal  0.202661 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  40.12 
 
 
250 aa  65.5  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  38.24 
 
 
248 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  35.62 
 
 
256 aa  64.3  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3379  cobalamin 5'-phosphate synthase  48 
 
 
259 aa  64.3  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.08 
 
 
267 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  45.36 
 
 
264 aa  63.5  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  41.13 
 
 
280 aa  63.5  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.1 
 
 
255 aa  63.5  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0668  cobalamin-5'-phosphate synthase  42.31 
 
 
261 aa  63.2  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.32 
 
 
249 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  42.71 
 
 
261 aa  63.2  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  43 
 
 
240 aa  62.4  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0941  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.69 
 
 
272 aa  62  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.374323 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1410  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30 
 
 
261 aa  62  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.293484  normal  0.234368 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2511  cobalamin-5'-phosphate synthase  38.98 
 
 
229 aa  62.4  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433449  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1392  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  38.14 
 
 
251 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3733  cobalamin 5'-phosphate synthase  42.55 
 
 
257 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.65083 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0507  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.27 
 
 
255 aa  61.2  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0577  cobalamin-5'-phosphate synthase  39.39 
 
 
250 aa  61.2  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000147618  unclonable  0.0000000241437 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.5 
 
 
248 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0871  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.19 
 
 
275 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  36.62 
 
 
256 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.98 
 
 
242 aa  61.2  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0272  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.59 
 
 
246 aa  60.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0910  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.85 
 
 
275 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2155  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.89 
 
 
258 aa  60.1  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  39.84 
 
 
256 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2247  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  39.57 
 
 
241 aa  59.7  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2704  cobalamin-5'-phosphate synthase  40.2 
 
 
262 aa  59.7  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  42.55 
 
 
224 aa  59.3  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1131  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.28 
 
 
253 aa  59.3  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.996937  normal  0.381 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1291  cobalamin-5-phosphate synthase  32.14 
 
 
251 aa  59.3  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.374945  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03031  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.86 
 
 
233 aa  59.3  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.241738  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  40.16 
 
 
258 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3225  cobalamin synthase  34.51 
 
 
264 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2070  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.96 
 
 
245 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0599586 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02921  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.31 
 
 
246 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0345622  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3672  cobalamin synthase  37.99 
 
 
243 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00479037  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2258  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  36 
 
 
265 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>