More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3960 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3960  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 272 aa  549  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  41.29 
 
 		 296 aa  192  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  41.73 
 
 		 296 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1498  alpha/beta fold family hydrolase  42.74 
 
 		 301 aa  185  6e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0139  alpha/beta hydrolase  47.39 
 
 		 284 aa  179  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4100  alpha/beta hydrolase fold  41.7 
 
 		 303 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4565  alpha/beta hydrolase fold  41.7 
 
 		 303 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0422308  hitchhiker  0.000747551 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1108  Alpha/beta hydrolase  41.33 
 
 		 298 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024849  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4236  alpha/beta hydrolase fold protein  36.86 
 
 		 301 aa  169  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1237  alpha/beta fold family hydrolase  39.93 
 
 		 301 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0592  alpha/beta fold family hydrolase  39.93 
 
 		 301 aa  169  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438744  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0975  alpha/beta fold family hydrolase  39.93 
 
 		 301 aa  169  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1333  alpha/beta fold family hydrolase  39.93 
 
 		 301 aa  169  7e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0316  alpha/beta fold family hydrolase  39.93 
 
 		 301 aa  169  7e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271899  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2497  alpha/beta fold family hydrolase  39.55 
 
 		 301 aa  168  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4639  alpha/beta hydrolase fold protein  45.1 
 
 		 300 aa  168  8e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.123647 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4507  alpha/beta hydrolase fold  45.1 
 
 		 300 aa  168  8e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.412971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1310  alpha/beta fold family hydrolase  39.63 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0918705  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3987  alpha/beta hydrolase fold  40.23 
 
 		 298 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136743  normal  0.0524037 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5594  alpha/beta hydrolase fold  41.2 
 
 		 305 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106478 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3661  alpha/beta hydrolase fold  41.2 
 
 		 305 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4706  alpha/beta hydrolase fold  41.2 
 
 		 305 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.456588  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3568  Alpha/beta hydrolase fold  40.37 
 
 		 296 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0257229  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3690  alpha/beta hydrolase fold  39.37 
 
 		 298 aa  142  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.557915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3170  alpha/beta hydrolase fold protein  38.55 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.702233  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0950  alpha/beta hydrolase fold  36.12 
 
 		 284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0820  alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 		 282 aa  112  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.274011  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 271 aa  97.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 320 aa  96.3  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  31.48 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 		 277 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 		 277 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 		 278 aa  88.6  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  28.68 
 
 		 292 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  29.59 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 282 aa  87  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  31.44 
 
 		 259 aa  86.3  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  24.81 
 
 		 277 aa  86.3  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  27.07 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.63 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  29.35 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  28.21 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2938  alpha/beta hydrolase  28.04 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0489547  hitchhiker  0.0000722758 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  29.26 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  29 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  26.91 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  29.07 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  28.88 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  28.24 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  28.89 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  28.24 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  26.49 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  26.43 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  28.03 
 
 		 262 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  28.52 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  28.52 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  28.52 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  26.61 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  28.52 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  28.52 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2240  alpha/beta hydrolase fold protein  27.65 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000309374  hitchhiker  0.000000000781643 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  28.08 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  28.03 
 
 		 270 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 		 325 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2334  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000909068  hitchhiker  0.0000846948 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  28.4 
 
 		 239 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  25.68 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2194  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000635452  unclonable  0.000004336 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4513  hypothetical protein  27.65 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1989  alpha/beta hydrolase fold  30.7 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.512291  normal  0.434462 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  23.02 
 
 		 571 aa  70.9  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2227  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000690683  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3216  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  27.41 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2136  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000406984  decreased coverage  0.00000741326 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  27.86 
 
 		 328 aa  69.3  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  28.97 
 
 		 318 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1942  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000178977  hitchhiker  0.00172948 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  30.92 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  24.26 
 
 		 297 aa  68.9  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  22.71 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2144  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412012  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.84 
 
 		 370 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0492  alpha/beta hydrolase fold  27.09 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>