107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3949 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3949  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 362 aa  733    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3145  hypothetical protein  82.04 
 
 		 362 aa  623  1e-177  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1375  extracellular solute-binding protein  81.77 
 
 		 362 aa  622  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0267839  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1258  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  83.05 
 
 		 354 aa  618  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2937  putative periplasmic IRON-binding signal peptide protein  64.33 
 
 		 365 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3214  extracellular solute-binding protein family 1  65.29 
 
 		 368 aa  464  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.207758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2867  extracellular solute-binding protein family 1  65 
 
 		 368 aa  463  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1044  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  56.82 
 
 		 362 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.331703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5676  extracellular solute-binding protein family 1  56.3 
 
 		 362 aa  396  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.529859  normal  0.553498 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4140  extracellular solute-binding protein  56.86 
 
 		 366 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0884015  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4122  extracellular solute-binding protein  56.29 
 
 		 366 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3666  extracellular solute-binding protein  56.29 
 
 		 366 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.818754 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4244  extracellular solute-binding protein  56.29 
 
 		 366 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611623  normal  0.0395193 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4360  extracellular solute-binding protein  56.34 
 
 		 366 aa  388  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3273  extracellular solute-binding protein  56.29 
 
 		 366 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281784  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1767  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  56.29 
 
 		 366 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  0.0378604 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0113  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  53.52 
 
 		 362 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1502  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  53.52 
 
 		 362 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1306  extracellular solute-binding protein  52.78 
 
 		 369 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.701273  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1128  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  53.8 
 
 		 362 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2276  putative periplasmic solute-binding protein  53.8 
 
 		 362 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.72431  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1725  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  54.37 
 
 		 362 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106673  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1036  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  53.8 
 
 		 362 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0951  ABC transporter, periplasmic-binding protein  53.8 
 
 		 362 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2934  hypothetical protein  44.87 
 
 		 403 aa  329  4e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3211  extracellular solute-binding protein family 1  44.93 
 
 		 380 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2864  extracellular solute-binding protein family 1  44.64 
 
 		 380 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3586  hypothetical protein  39.24 
 
 		 371 aa  299  6e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0161  extracellular solute-binding protein family 1  44.38 
 
 		 368 aa  292  5e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3438  hypothetical protein  39.13 
 
 		 401 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2402  hypothetical protein  38.34 
 
 		 365 aa  267  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.859613  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6139  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.160536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2764  extracellular solute-binding protein family 1  40.66 
 
 		 362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.247835  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6109  ABC transporter substrate binding protein (iron)  35.14 
 
 		 374 aa  234  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4258  putative iron ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  36.1 
 
 		 366 aa  232  6e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3637  extracellular solute-binding protein family 1  35.78 
 
 		 348 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.276394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3338  putative iron ABC transporter, substrate-binding protein  35.46 
 
 		 354 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125195 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0309  periplasmic iron-binding protein  32.81 
 
 		 365 aa  213  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02405  periplasmic iron-binding protein  33.43 
 
 		 344 aa  204  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4430  periplasmic iron-binding protein  32.32 
 
 		 350 aa  200  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3357  extracellular solute-binding protein family 1  32.02 
 
 		 351 aa  200  3.9999999999999996e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.825817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1449  extracellular solute-binding protein  32.69 
 
 		 364 aa  197  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.381136  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2272  hypothetical protein  33.44 
 
 		 381 aa  197  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.508192 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0729  extracellular solute-binding protein  31.31 
 
 		 363 aa  195  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.706674  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0259  extracellular solute-binding protein  30.63 
 
 		 346 aa  190  4e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0059  extracellular solute-binding protein family 1  33.81 
 
 		 370 aa  190  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0288  periplasmic iron-binding protein  29.94 
 
 		 346 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1804  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  32.7 
 
 		 354 aa  169  9e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0059  extracellular solute-binding protein  31.66 
 
 		 377 aa  166  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4161  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  29.91 
 
 		 369 aa  165  9e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3493  extracellular solute-binding protein  29.3 
 
 		 358 aa  140  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.685703  normal  0.0583739 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2735  putative iron(III) transport system substrate-binding protein  27.13 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0641317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2265  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3159  hypothetical protein  29.1 
 
 		 364 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4536  extracellular solute-binding protein  26.85 
 
 		 374 aa  115  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.15899  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3126  putative periplasmic iron-binding protein  27.93 
 
 		 333 aa  115  8.999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4733  putative periplasmic solute-binding protein  35.46 
 
 		 155 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3199  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680045  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1842  extracellular solute-binding protein family 1  26.47 
 
 		 332 aa  62.4  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0219325  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4354  putative ABC transport system, substrate-binding exported protein  25.45 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.356253  normal  0.710836 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3891  extracellular solute-binding protein  22.64 
 
 		 327 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2070  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1318  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 		 352 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.801159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1606  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.57 
 
 		 355 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.273588 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4317  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 		 343 aa  55.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.362014 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2476  ABC-type iron(III)-binding periplasmic protein precursor  25.09 
 
 		 364 aa  54.3  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000339151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21960  hypothetical protein  27.5 
 
 		 352 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000202681 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1586  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 		 333 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3878  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.67 
 
 		 355 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1275  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 354 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.828972  normal  0.567692 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1726  ABC transporter, periplasmic binding protein  25.73 
 
 		 354 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477367  normal  0.0250834 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3231  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 		 325 aa  51.6  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416701  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3993  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  25.73 
 
 		 354 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.249752  normal  0.268451 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 381 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1948  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 		 326 aa  50.8  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113804  normal  0.383853 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1221  extracellular solute-binding protein family 1  24.91 
 
 		 326 aa  50.8  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.141693  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1686  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.05 
 
 		 354 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.224605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1875  hypothetical protein  27.19 
 
 		 352 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 382 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2481  extracellular solute-binding protein family 1  24.82 
 
 		 330 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.37214  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1332  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  26.56 
 
 		 352 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0623244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21350  ABC-type Fe3+ transport system, substrate binding component  24.22 
 
 		 349 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180664  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3480  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  39.19 
 
 		 391 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1078  extracellular solute-binding protein  21.74 
 
 		 322 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2968  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 		 445 aa  48.5  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.812096 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1471  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 		 359 aa  48.5  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3418  extracellular solute-binding protein family 1  23.83 
 
 		 354 aa  47.8  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1201  extracellular solute-binding protein family 1  21.11 
 
 		 320 aa  47.8  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.941139  normal  0.523727 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0827  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.47 
 
 		 348 aa  47  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333267  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.42 
 
 		 356 aa  46.6  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0354  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.42 
 
 		 356 aa  46.6  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2082  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.42 
 
 		 356 aa  46.6  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0041  extracellular solute-binding protein family 1  25.84 
 
 		 336 aa  46.2  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.42 
 
 		 362 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.34313  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1786  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.42 
 
 		 362 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0818  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.42 
 
 		 362 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0448  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.42 
 
 		 362 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0120  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 340 aa  46.6  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0750  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.67 
 
 		 348 aa  45.4  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.860784  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2736  extracellular solute-binding protein family 1  23.93 
 
 		 325 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288744  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>