25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3480 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3480  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  100 
 
 		 391 aa  787    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3960  ABC transporter periplasmic solute-binding protein  31.61 
 
 		 375 aa  171  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3961  ABC transporter periplasmic solute-binding protein  33.33 
 
 		 374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.965077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0296  ABC transporter periplasmic solute-binding protein  34.47 
 
 		 367 aa  159  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.674577  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5559  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  29.97 
 
 		 389 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.881007 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1605  ABC transporter periplasmic solute-binding protein  30.77 
 
 		 372 aa  151  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.232198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0507  ABC transporter periplasmic solute-binding protein  29.79 
 
 		 399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0960039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1554  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.202841  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1913  extracellular solute-binding protein family 1  31.84 
 
 		 348 aa  56.2  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0831866  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1586  extracellular solute-binding protein family 1  22.53 
 
 		 333 aa  49.7  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3949  extracellular solute-binding protein  39.19 
 
 		 362 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3145  hypothetical protein  36.49 
 
 		 362 aa  47.4  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2934  hypothetical protein  36.26 
 
 		 403 aa  47.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1258  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.49 
 
 		 354 aa  47.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1375  extracellular solute-binding protein  36.49 
 
 		 362 aa  47.4  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0267839  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0161  extracellular solute-binding protein family 1  26.9 
 
 		 368 aa  47  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2867  extracellular solute-binding protein family 1  39.19 
 
 		 368 aa  47  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.06 
 
 		 453 aa  47  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1309  putative transporter  26.55 
 
 		 337 aa  47  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.442575  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3211  extracellular solute-binding protein family 1  34.07 
 
 		 380 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3214  extracellular solute-binding protein family 1  37.84 
 
 		 368 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.207758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2864  extracellular solute-binding protein family 1  34.07 
 
 		 380 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2937  putative periplasmic IRON-binding signal peptide protein  37.84 
 
 		 365 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2087  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  33.33 
 
 		 327 aa  43.1  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28403e-19  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>