23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0296 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0296  ABC transporter periplasmic solute-binding protein  100 
 
 		 367 aa  758    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.674577  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1605  ABC transporter periplasmic solute-binding protein  67.85 
 
 		 372 aa  538  9.999999999999999e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.232198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3961  ABC transporter periplasmic solute-binding protein  56.28 
 
 		 374 aa  420  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.965077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3960  ABC transporter periplasmic solute-binding protein  50 
 
 		 375 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5559  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  41.43 
 
 		 389 aa  287  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.881007 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0507  ABC transporter periplasmic solute-binding protein  41.69 
 
 		 399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0960039  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3480  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  34.47 
 
 		 391 aa  159  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1309  putative transporter  24.68 
 
 		 337 aa  53.5  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.442575  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1913  extracellular solute-binding protein family 1  34.15 
 
 		 348 aa  50.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0831866  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12551  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  30.83 
 
 		 342 aa  50.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.733876  hitchhiker  0.00360834 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20451  hypothetical protein  26.25 
 
 		 342 aa  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4828  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 		 347 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.024874  normal  0.037775 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2002  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  24.84 
 
 		 332 aa  46.6  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13521  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  25.32 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0774  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  24.84 
 
 		 341 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.899979  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1842  extracellular solute-binding protein family 1  22.47 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0219325  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0625  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  25.55 
 
 		 344 aa  44.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16181  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  24.22 
 
 		 341 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  24.38 
 
 		 374 aa  44.7  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0833  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 343 aa  43.1  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  24.2 
 
 		 340 aa  43.1  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1529  extracellular solute-binding protein  21.97 
 
 		 355 aa  42.7  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014925  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0435  extracellular solute-binding protein, family 1  26.42 
 
 		 343 aa  42.7  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>