33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5559 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5559  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  100 
 
 		 389 aa  802    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.881007 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0296  ABC transporter periplasmic solute-binding protein  41.43 
 
 		 367 aa  288  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.674577  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1605  ABC transporter periplasmic solute-binding protein  43.44 
 
 		 372 aa  285  8e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.232198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3961  ABC transporter periplasmic solute-binding protein  42 
 
 		 374 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.965077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0507  ABC transporter periplasmic solute-binding protein  38.99 
 
 		 399 aa  278  8e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0960039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3960  ABC transporter periplasmic solute-binding protein  37.28 
 
 		 375 aa  278  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3480  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  30.08 
 
 		 391 aa  166  9e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1309  putative transporter  28.74 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.442575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1175  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.282862  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4244  extracellular solute-binding protein  22.83 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611623  normal  0.0395193 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4122  extracellular solute-binding protein  22.83 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3273  extracellular solute-binding protein  22.83 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281784  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4140  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 		 366 aa  57  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0884015  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3666  extracellular solute-binding protein  22.83 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.818754 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6021  extracellular solute-binding protein  22.13 
 
 		 347 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1767  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  22.12 
 
 		 366 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  0.0378604 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4360  extracellular solute-binding protein  22.7 
 
 		 366 aa  54.3  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1842  extracellular solute-binding protein family 1  22.98 
 
 		 332 aa  53.5  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0219325  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0186  hypothetical protein  21.76 
 
 		 441 aa  51.6  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1044  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  22.99 
 
 		 362 aa  50.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.331703  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1913  extracellular solute-binding protein family 1  28.38 
 
 		 348 aa  47.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0831866  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0833  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 343 aa  47.4  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5676  extracellular solute-binding protein family 1  22.9 
 
 		 362 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.529859  normal  0.553498 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0435  extracellular solute-binding protein, family 1  25.57 
 
 		 343 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1502  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.9 
 
 		 362 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0113  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.9 
 
 		 362 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6136  ABC transporter substrate binding protein (iron)  23.15 
 
 		 329 aa  47.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1554  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 354 aa  46.6  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.202841  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1722  extracellular solute-binding protein  21.84 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000849376  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4453  extracellular solute-binding protein  23.59 
 
 		 356 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2471  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 390 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1725  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.28 
 
 		 362 aa  43.9  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106673  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  24.57 
 
 		 374 aa  43.1  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>