203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_6021 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_6021  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 347 aa  700    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1309  putative transporter  29.57 
 
 		 337 aa  90.9  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.442575  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1866  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.07 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1611  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1812  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  24.07 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.98446  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1563  ABC transporter, substrate-binding protein  24.07 
 
 		 341 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3590  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.04 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1753  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.73 
 
 		 341 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1786  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.39 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1572  ABC transporter, substrate-binding protein  23.39 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3231  extracellular solute-binding protein family 1  24.18 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416701  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1611  ABC transporter substrate-binding protein  23.05 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.791321  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1735  ABC transporter substrate-binding protein  23.05 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.313912  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4453  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 		 356 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0544  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 		 322 aa  72.4  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  27.54 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1948  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113804  normal  0.383853 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1078  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 		 322 aa  69.3  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1722  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 379 aa  67  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000849376  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2070  extracellular solute-binding protein family 1  25.41 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620132  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5861  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 345 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1175  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 		 372 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.282862  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4456  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00193533  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1431  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 355 aa  65.1  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452816  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0531  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4828  extracellular solute-binding protein family 1  23.02 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.024874  normal  0.037775 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1842  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0219325  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0655  putative iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  23.21 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0120  extracellular solute-binding protein  22.76 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3199  extracellular solute-binding protein  22.78 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680045  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5340  extracellular solute-binding protein  27.37 
 
 		 358 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.927258 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1835  ABC Fe+3 transporter, periplasmic ligand binding protein  23.13 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236208  normal  0.444011 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3891  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3824  extracellular solute-binding protein  23.76 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  22.93 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1664  extracellular solute-binding protein family 1  24.74 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000133453  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06280  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  24.05 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.124476  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7421  extracellular solute-binding protein family 1  26.21 
 
 		 348 aa  59.7  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306518  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0700  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  23.26 
 
 		 338 aa  59.3  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1586  extracellular solute-binding protein family 1  23.81 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2736  extracellular solute-binding protein family 1  22.76 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  23.1 
 
 		 366 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0113  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.73 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1502  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.73 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1767  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  23.89 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  0.0378604 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62000  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  21.6 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617589  normal  0.0992069 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3093  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.383646  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4122  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4244  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611623  normal  0.0395193 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4911  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.224202  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1201  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.941139  normal  0.523727 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4360  extracellular solute-binding protein  23.63 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4447  extracellular solute-binding protein  22.11 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.181234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2917  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 		 339 aa  57  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1592  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.641275  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  24.21 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3273  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 		 366 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281784  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3764  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 362 aa  55.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1048  extracellular solute-binding protein  22.57 
 
 		 356 aa  55.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3950  ABC Fe3+ transporter, periplasmic ligand binding protein  23.96 
 
 		 344 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0258476  normal  0.044916 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1990  putative regulatory lipoprotein  25.64 
 
 		 419 aa  55.8  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.307134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1044  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  22.12 
 
 		 362 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.331703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0005  iron-binding protein  25.26 
 
 		 335 aa  54.7  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000237726  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3363  extracellular solute-binding protein  23.6 
 
 		 342 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6369  extracellular solute-binding protein family 1  23.49 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.290821  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5394  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  21.9 
 
 		 335 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3699  extracellular solute-binding protein family 1  23.43 
 
 		 354 aa  54.3  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2022  extracellular solute-binding protein  22.47 
 
 		 333 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0434097  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1108  extracellular solute-binding protein  23.84 
 
 		 336 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.048242 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0730  extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 347 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1210  extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 347 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1235  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  22.29 
 
 		 358 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1212  iron ABC transporter solute-binding protein  22.29 
 
 		 358 aa  53.5  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1214  iron ABC transporter solute-binding protein  22.29 
 
 		 358 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1337  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  22.29 
 
 		 358 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1374  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.29 
 
 		 358 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3586  hypothetical protein  23.57 
 
 		 371 aa  53.5  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2479  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.14 
 
 		 347 aa  53.5  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1411  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.29 
 
 		 358 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1237  extracellular metal-binding protein  22.59 
 
 		 358 aa  53.5  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2476  ABC-type iron(III)-binding periplasmic protein precursor  24.17 
 
 		 364 aa  53.5  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000339151  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1183  extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 347 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0923795  normal  0.478437 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3495  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 		 375 aa  53.1  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal  0.246878 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3970  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.29 
 
 		 358 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1982  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 		 342 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53663  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1093  extracellular solute-binding protein  24.36 
 
 		 347 aa  52.8  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2028  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 		 342 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1962  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 		 342 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2430  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 338 aa  52.4  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334988  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3438  hypothetical protein  22.97 
 
 		 401 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4937  extracellular solute-binding protein  21.59 
 
 		 337 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000349724 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4318  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  24 
 
 		 347 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434511  normal  0.628753 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1545  extracellular solute-binding protein family 1  24.64 
 
 		 339 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.061269  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6136  ABC transporter substrate binding protein (iron)  23.59 
 
 		 329 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1588  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 		 368 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2512  extracellular solute-binding protein family 1  21.58 
 
 		 373 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1436  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  22.43 
 
 		 346 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1093  extracellular solute-binding protein  24.36 
 
 		 347 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39155  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>