More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2575 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2575  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 427 aa  891    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.688884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4983  oxidoreductase domain-containing protein  53.43 
 
 		 414 aa  428  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.0480566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4990  oxidoreductase domain-containing protein  51.57 
 
 		 414 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0959358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0370  oxidoreductase domain protein  43.03 
 
 		 416 aa  344  2e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1637  oxidoreductase, streptomycin biosynthesis protein (strI-related protein)  41.2 
 
 		 421 aa  328  9e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.894895  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1902  oxidoreductase family protein  40.96 
 
 		 421 aa  327  3e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.171603  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01870  streptomycin biosynthesis protein StrI, putative  41.23 
 
 		 478 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00810  oxidoreductase domain protein  40.29 
 
 		 420 aa  317  2e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.133238  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0302  oxidoreductase domain protein  37.97 
 
 		 464 aa  304  2.0000000000000002e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.451062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0398  oxidoreductase domain-containing protein  37.26 
 
 		 421 aa  294  2e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0431  oxidoreductase domain protein  36.71 
 
 		 416 aa  272  9e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1110  oxidoreductase-like protein  37.92 
 
 		 400 aa  250  3e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00265336  hitchhiker  0.0048453 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02866  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11840)  30.5 
 
 		 559 aa  206  8e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.591804 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2166  oxidoreductase domain protein  29.05 
 
 		 440 aa  182  1e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.81218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  23.84 
 
 		 442 aa  97.4  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  26.49 
 
 		 390 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  22.92 
 
 		 421 aa  89.7  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6634  oxidoreductase domain protein  23.58 
 
 		 385 aa  89.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4690  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 		 699 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614925  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5690  oxidoreductase domain protein  22.88 
 
 		 385 aa  87  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  26.44 
 
 		 444 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4641  oxidoreductase domain-containing protein  23.39 
 
 		 386 aa  84.7  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.266729  normal  0.0830411 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  23.75 
 
 		 425 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  22.73 
 
 		 425 aa  80.1  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  23.47 
 
 		 429 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  24.71 
 
 		 495 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  26.05 
 
 		 467 aa  77.4  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6237  oxidoreductase  22.46 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0507772  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  25.82 
 
 		 399 aa  76.6  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  24.43 
 
 		 470 aa  76.6  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  29.06 
 
 		 360 aa  75.1  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  29 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_006686  CND06170  oxidoreductase, putative  22.95 
 
 		 455 aa  74.3  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  22.29 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  26.82 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  28.44 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 462 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  22.83 
 
 		 474 aa  72.8  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  29.81 
 
 		 310 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  29 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  28.7 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  24.09 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1658  oxidoreductase domain protein  28.75 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.526609  normal  0.191538 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  29.95 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  30.93 
 
 		 332 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  25.69 
 
 		 313 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4211  oxidoreductase domain-containing protein  26.83 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  28.38 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  27.92 
 
 		 350 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04142  predicted oxidoreductase  25 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3721  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  26.17 
 
 		 450 aa  67.8  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  28 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  25.91 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  27.67 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  28.22 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07156  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00560)  24.14 
 
 		 427 aa  67  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  28.93 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  30.72 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  23.83 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  30.05 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64256  probable oxidoreductase  25 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0428104 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  26.7 
 
 		 353 aa  66.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  26.15 
 
 		 345 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  24.31 
 
 		 345 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  26.8 
 
 		 311 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  25.35 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4112  oxidoreductase-like  27.67 
 
 		 345 aa  65.1  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0541  oxidoreductase domain protein  29.87 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  24.1 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  31.78 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0731  Inositol 2-dehydrogenase  28.5 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  22.99 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  27.04 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  24.51 
 
 		 435 aa  63.9  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7629  oxidoreductase domain protein  25.34 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  24.66 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3772  oxidoreductase domain protein  25.84 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  25.86 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  27 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  26.64 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01139  Putative uncharacterized proteinQutH protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q00781]  22.5 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.707735 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  27 
 
 		 337 aa  62.8  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  27 
 
 		 337 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  27.64 
 
 		 357 aa  62  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  29.29 
 
 		 350 aa  62  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  22.61 
 
 		 326 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  21.84 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  29.41 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78306  oxidoreductase  25.35 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2163  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.54 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  22.86 
 
 		 340 aa  59.7  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1254  oxidoreductase domain protein  30.57 
 
 		 341 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  27.41 
 
 		 347 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  24.4 
 
 		 334 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5485  oxidoreductase domain protein  27.83 
 
 		 358 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.863826  normal  0.176545 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  28.38 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0615  oxidoreductase domain-containing protein  23.5 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.652806  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>