70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1668 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0974  conserved protein nucleotide triphosphate hydrolase domain  64.8 
 
 		 552 aa  706    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.120281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1393  ATP-dependent OLD family endonuclease  66.43 
 
 		 552 aa  723    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.175069 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2614  hypothetical protein  75.63 
 
 		 555 aa  858    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0980  hypothetical protein  65.52 
 
 		 552 aa  716    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0950  hypothetical protein  65.7 
 
 		 552 aa  717    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.714273  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1668  hypothetical protein  100 
 
 		 554 aa  1137    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413918  normal  0.886793 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1594  hypothetical protein  75.63 
 
 		 555 aa  858    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2699  hypothetical protein  75.63 
 
 		 555 aa  858    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2720  ATP-dependent OLD family endonuclease  65.52 
 
 		 552 aa  716    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.560965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2283  hypothetical protein  65.7 
 
 		 552 aa  717    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0243665  normal  0.014671 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2452  hypothetical protein  65.52 
 
 		 552 aa  716    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.234891  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2766  conserved hypothetical protein  65.52 
 
 		 552 aa  716    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.72525  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1037  hypothetical protein  64.8 
 
 		 552 aa  706    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1057  conserved protein, nucleotide triphosphate hydrolase domain protein  64.8 
 
 		 552 aa  708    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0940  hypothetical protein  64.8 
 
 		 552 aa  706    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1006  hypothetical protein  64.8 
 
 		 552 aa  706    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1038  hypothetical protein  65.7 
 
 		 552 aa  717    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2270  hypothetical protein  67.09 
 
 		 553 aa  743    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00887  hypothetical protein  65.52 
 
 		 552 aa  716    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2370  hypothetical protein  66.79 
 
 		 553 aa  754    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1709  hypothetical protein  68.05 
 
 		 554 aa  766    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.137419  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1975  hypothetical protein  67.69 
 
 		 554 aa  768    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.650483  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00881  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  65.52 
 
 		 552 aa  716    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000190  ATP-dependent endonuclease  43.5 
 
 		 544 aa  456  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0284428  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0477  hypothetical protein  43.92 
 
 		 543 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000481423  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05915  hypothetical protein  44.75 
 
 		 544 aa  443  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0449  hypothetical protein  42.6 
 
 		 554 aa  438  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.380291  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0201  ATP-dependent endonuclease of the OLD family protein  39.01 
 
 		 558 aa  411  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.27 
 
 		 566 aa  254  4.0000000000000004e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  23.36 
 
 		 607 aa  80.5  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  35.71 
 
 		 647 aa  70.1  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.31 
 
 		 640 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3680  hypothetical protein  24.35 
 
 		 667 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228767  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.85 
 
 		 594 aa  63.9  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  22.95 
 
 		 645 aa  63.9  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.21 
 
 		 639 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  24.15 
 
 		 623 aa  60.1  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  21.8 
 
 		 645 aa  59.7  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  24.58 
 
 		 564 aa  58.9  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  28.74 
 
 		 598 aa  57.8  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  22.06 
 
 		 712 aa  57.8  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  23.56 
 
 		 574 aa  57  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  19.5 
 
 		 688 aa  56.2  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  22.73 
 
 		 594 aa  55.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  25.3 
 
 		 553 aa  55.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  27.45 
 
 		 695 aa  54.7  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  19.24 
 
 		 685 aa  53.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  28.77 
 
 		 703 aa  53.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  22.16 
 
 		 634 aa  52.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  25.13 
 
 		 613 aa  52.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1241  hypothetical protein  32.18 
 
 		 610 aa  52.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.625082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  23.47 
 
 		 594 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3102  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.29 
 
 		 582 aa  51.6  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.52 
 
 		 603 aa  50.4  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  31.75 
 
 		 682 aa  50.4  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  21.14 
 
 		 596 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  40.62 
 
 		 615 aa  49.3  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  37.97 
 
 		 606 aa  49.7  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  22.02 
 
 		 650 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  27.42 
 
 		 758 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  41.67 
 
 		 586 aa  48.5  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4162  ATP-dependent endonuclease family protein  39.06 
 
 		 600 aa  47  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138387  normal  0.169092 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  42.86 
 
 		 641 aa  46.6  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2759  ATP-dependent OLD family endonuclease  38.98 
 
 		 608 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  36.47 
 
 		 603 aa  45.4  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  39.06 
 
 		 598 aa  44.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3056  ATP-dependent endonuclease family protein  39.06 
 
 		 598 aa  44.7  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  23.81 
 
 		 707 aa  45.1  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0196  ATPase  26.72 
 
 		 666 aa  43.9  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  38.98 
 
 		 619 aa  43.5  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.924756 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>