70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0865 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0865  tail fiber repeat 2-containing protein  100 
 
 		 554 aa  1124    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0127303 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0940  tail fiber domain-containing protein  48.74 
 
 		 583 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2656  tail fiber repeat 2 protein  55.96 
 
 		 660 aa  218  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  55.19 
 
 		 673 aa  202  9e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  49.75 
 
 		 570 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  44.02 
 
 		 580 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  47.13 
 
 		 401 aa  194  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2345  hypothetical protein  45.41 
 
 		 479 aa  192  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  55.75 
 
 		 498 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4536  tail fiber domain-containing protein  43.46 
 
 		 552 aa  191  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.371688 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4955  hypothetical protein  36.07 
 
 		 616 aa  189  8e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0194752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4452  tail fiber domain protein  41.08 
 
 		 581 aa  189  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4537  gp19  45.96 
 
 		 493 aa  186  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4029  Phage-related tail fibre protein-like protein  57.52 
 
 		 419 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  55.06 
 
 		 340 aa  184  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  57.52 
 
 		 646 aa  183  6e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  56.32 
 
 		 557 aa  181  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3191  Phage-related tail fibre protein-like protein  55.06 
 
 		 697 aa  180  8e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3035  phage Tail Collar domain protein  38.82 
 
 		 399 aa  179  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110884 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0764  hypothetical protein  53.75 
 
 		 399 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1384  Phage-related tail fibre protein-like protein  46.86 
 
 		 504 aa  171  5e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44271  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  52.94 
 
 		 485 aa  169  9e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00851  hypothetical protein  49.23 
 
 		 540 aa  167  5e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00845  hypothetical protein  49.23 
 
 		 540 aa  167  5e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  51.22 
 
 		 371 aa  166  9e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2761  Phage-related tail fibre protein-like protein  55.56 
 
 		 473 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4024  Phage-related tail fibre protein-like protein  42.49 
 
 		 452 aa  162  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3033  tail fiber domain-containing protein  54.9 
 
 		 561 aa  160  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000290271 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2850  tail fiber domain protein  52.94 
 
 		 588 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3398  tail fiber protein H, putative  49.37 
 
 		 689 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87622  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4042  Phage-related tail fibre protein-like protein  48.73 
 
 		 714 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.332758  hitchhiker  0.00000000000267654 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  44.91 
 
 		 554 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08050  putative tail fiber protein  38.92 
 
 		 691 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383442  hitchhiker  0.000557531 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1042  putative phage tail fiber protein  30.96 
 
 		 469 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1305  tail fiber protein, putative  34.72 
 
 		 505 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000211042 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2918  gp19  30 
 
 		 701 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217612  hitchhiker  0.00000000528807 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  34.18 
 
 		 817 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3650  Phage-related tail fibre protein-like protein  37.42 
 
 		 251 aa  95.5  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  39.34 
 
 		 483 aa  92.8  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1289  putative variable tail fibre protein  33.63 
 
 		 242 aa  91.7  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.314975 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37440  Phage P2 tail fiber gpH-like protein  35.37 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3393  tail fiber protein, putative  32.3 
 
 		 519 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0914  tail fiber repeat 2-containing protein  43.22 
 
 		 589 aa  79.7  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2214  hypothetical protein  33.8 
 
 		 382 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0231  tail fiber protein H, putative  28.85 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.218449  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1619  tail fiber-related protein  35.15 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0820088  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2783  phage tail fiber repeat-containing protein  55.26 
 
 		 670 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.572485  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3474  phage tail fiber repeat  55.26 
 
 		 670 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0858569  hitchhiker  0.000000311784 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1039  hypothetical protein  47.06 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2246  tail protein  37.04 
 
 		 514 aa  70.1  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2249  tail protein  37.96 
 
 		 520 aa  68.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0759311  normal  0.0336742 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2473  hypothetical protein  30.26 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571413 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2297  phage-related tail fibre protein-like protein  30.77 
 
 		 525 aa  57  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.364157  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0930  tail fiber repeat 2-containing protein  39.81 
 
 		 531 aa  57  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.627333  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0183  tail fiber repeat 2-containing protein  60.42 
 
 		 408 aa  56.2  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4038  tail fiber domain protein  34.58 
 
 		 475 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.134914  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2092  tail fiber domain protein  34.58 
 
 		 475 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.147761  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  53.33 
 
 		 1007 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2380  Phage-related tail fibre protein-like  30.56 
 
 		 590 aa  51.2  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335162  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  71.43 
 
 		 536 aa  48.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  71.43 
 
 		 516 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  46.67 
 
 		 1120 aa  46.6  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  50.94 
 
 		 1137 aa  46.6  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2509  hypothetical protein  33.71 
 
 		 362 aa  46.2  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10056  Tail fiber protein  60 
 
 		 401 aa  44.3  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00752  hypothetical protein  60 
 
 		 401 aa  44.3  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  66.67 
 
 		 791 aa  43.9  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0875  phage tail fiber repeat protein  65.71 
 
 		 172 aa  43.9  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872815  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  40.28 
 
 		 654 aa  43.9  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  40.28 
 
 		 654 aa  43.9  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>