More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3188 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2235  thiosulfate reductase  53.33 
 
 		 758 aa  822    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209797  normal  0.286987 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  58.68 
 
 		 760 aa  938    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2288  thiosulfate reductase  53.46 
 
 		 758 aa  823    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00880607  normal  0.0980362 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  58.08 
 
 		 758 aa  931    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  58.55 
 
 		 764 aa  939    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  58.55 
 
 		 764 aa  939    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  58.89 
 
 		 760 aa  947    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  57.89 
 
 		 760 aa  941    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3188  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 756 aa  1571    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  58.55 
 
 		 764 aa  938    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  57.52 
 
 		 760 aa  918    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0265  molybdopterin oxidoreductase  43.71 
 
 		 764 aa  645    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.227459  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  58.23 
 
 		 764 aa  939    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  53.54 
 
 		 758 aa  823    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  58.23 
 
 		 760 aa  952    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2401  thiosulfate reductase  53.33 
 
 		 758 aa  822    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  0.834836 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  59.16 
 
 		 760 aa  964    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  53.59 
 
 		 758 aa  823    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  58.1 
 
 		 764 aa  939    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1914  thiosulfate reductase  39.5 
 
 		 761 aa  583  1.0000000000000001e-165  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.527644  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0269  Nitrate reductase  37.84 
 
 		 754 aa  553  1e-156  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0389  response regulator receiver domain-containing protein  37.76 
 
 		 757 aa  545  1e-154  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.257769  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  34.81 
 
 		 695 aa  407  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  34.77 
 
 		 759 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  34.11 
 
 		 722 aa  378  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  33.14 
 
 		 731 aa  367  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2813  molybdopterin oxidoreductase  32.25 
 
 		 738 aa  356  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  32.96 
 
 		 750 aa  348  2e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  31.72 
 
 		 731 aa  346  1e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2718  molybdopterin oxidoreductase  32.38 
 
 		 737 aa  342  2e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  30.73 
 
 		 730 aa  337  5e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2632  molybdopterin oxidoreductase  32.48 
 
 		 739 aa  337  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.348569  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2794  molybdopterin oxidoreductase  30.63 
 
 		 698 aa  325  2e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  31.2 
 
 		 744 aa  320  5e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2860  molybdopterin oxidoreductase  31.05 
 
 		 695 aa  319  1e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1318  molybdopterin oxidoreductase  30.36 
 
 		 695 aa  317  6e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.952277  hitchhiker  0.000256409 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0320  Formate dehydrogenase  30.91 
 
 		 700 aa  313  6.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2276  molybdopterin oxidoreductase  28.42 
 
 		 807 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1667  Formate dehydrogenase  30.76 
 
 		 704 aa  303  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.982617  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0442  molybdopterin oxidoreductase  31.05 
 
 		 731 aa  297  4e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1076  thiosulfate reductase, putative  29.89 
 
 		 708 aa  296  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2338  molybdopterin oxidoreductase  30.05 
 
 		 729 aa  295  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  30.92 
 
 		 739 aa  294  5e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0345  nitrate reductase  29.88 
 
 		 731 aa  292  1e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213856  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0447  molybdopterin oxidoreductase  29.06 
 
 		 731 aa  290  7e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2919  molybdopterin oxidoreductase  30.58 
 
 		 733 aa  286  1.0000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2386  molybdopterin oxidoreductase  30.42 
 
 		 747 aa  285  3.0000000000000004e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0620  twin-arginine translocation pathway signal  30.61 
 
 		 741 aa  277  7e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.390565  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2562  formate dehydrogenase  31.73 
 
 		 720 aa  276  7e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0912  molybdopterin oxidoreductase  31.61 
 
 		 739 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2400  molybdopterin oxidoreductase  31.03 
 
 		 738 aa  273  8.000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0425196  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02090  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  28.21 
 
 		 734 aa  259  1e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  27.77 
 
 		 1139 aa  253  8.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  28.05 
 
 		 812 aa  248  3e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  27.52 
 
 		 747 aa  247  4.9999999999999997e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  26.66 
 
 		 1143 aa  243  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.86 
 
 		 685 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1484  Nitrate reductase  27.75 
 
 		 739 aa  241  5e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  26.61 
 
 		 685 aa  236  9e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1509  Formate dehydrogenase  27.35 
 
 		 732 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  27.94 
 
 		 711 aa  234  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  26.85 
 
 		 745 aa  233  8.000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  25.83 
 
 		 692 aa  232  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  25.93 
 
 		 698 aa  225  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  28.21 
 
 		 1135 aa  224  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2605  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 		 879 aa  224  4.9999999999999996e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0353  formate dehydrogenase  27.73 
 
 		 833 aa  224  4.9999999999999996e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000992334  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  27.43 
 
 		 891 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0387  molybdopterin oxidoreductase  25.15 
 
 		 879 aa  219  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0216  molybdopterin oxidoreductase  27.64 
 
 		 837 aa  214  5.999999999999999e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3092  molybdopterin oxidoreductase  25.25 
 
 		 791 aa  212  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  27.25 
 
 		 936 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2013  molybdopterin oxidoreductase  25.77 
 
 		 1055 aa  201  6e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  27.15 
 
 		 700 aa  200  7e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0171  molybdopterin oxidoreductase  26.3 
 
 		 709 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.662613  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1880  Formate dehydrogenase  24.17 
 
 		 744 aa  200  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0895  Nitrate reductase  27.15 
 
 		 711 aa  198  3e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.381214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.04 
 
 		 893 aa  194  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0324  formate dehydrogenase alpha subunit  26.04 
 
 		 713 aa  193  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4578  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.67 
 
 		 723 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  24.39 
 
 		 729 aa  193  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2565  molybdopterin oxidoreductase  26.6 
 
 		 747 aa  192  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0260966 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0643  formate dehydrogenase  28.6 
 
 		 764 aa  192  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2365  molybdopterin oxidoreductase  25.03 
 
 		 777 aa  190  9e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2547  molybdopterin oxidoreductase  27.27 
 
 		 711 aa  190  9e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00181061  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.62 
 
 		 900 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  24.63 
 
 		 726 aa  189  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3094  molybdopterin oxidoreductase  25.63 
 
 		 858 aa  188  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.799457  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2925  molydopterin dinucleotide-binding region  26.21 
 
 		 691 aa  187  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2753  molydopterin dinucleotide-binding region  24.37 
 
 		 749 aa  186  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.28964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1634  molybdopterin oxidoreductase  26.92 
 
 		 1087 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.29 
 
 		 879 aa  185  2.0000000000000003e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.6 
 
 		 688 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  27.13 
 
 		 666 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.82 
 
 		 674 aa  185  3e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2375  molybdopterin oxidoreductase  24.62 
 
 		 747 aa  185  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2424  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.43 
 
 		 718 aa  184  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.680227 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.68 
 
 		 674 aa  184  7e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2168  molydopterin dinucleotide-binding region  26.64 
 
 		 693 aa  183  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1753  formate dehydrogenase alpha subunit  25.79 
 
 		 716 aa  183  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0179443  hitchhiker  0.000996092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>