More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6362 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6362  Transketolase central region  100 
 
 		 307 aa  612  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.465513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4473  transketolase, central region  62.42 
 
 		 296 aa  328  9e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0113424 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4002  Transketolase central region  55.96 
 
 		 299 aa  312  4.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226763  normal  0.146008 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4986  transketolase central region  61.49 
 
 		 296 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.545662  hitchhiker  0.000179953 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5715  Transketolase central region  55.18 
 
 		 296 aa  291  9e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1273  transketolase central region  53.38 
 
 		 303 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.257757  hitchhiker  0.0057855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5637  transketolase subunit B  31.23 
 
 		 307 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1589  transketolase family protein  25.76 
 
 		 288 aa  112  6e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1923  transketolase domain-containing protein  31.31 
 
 		 315 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  34.87 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3397  Transketolase central region  31.06 
 
 		 298 aa  106  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3382  transketolase domain-containing protein  26.11 
 
 		 314 aa  106  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2126  Transketolase domain protein  31.44 
 
 		 320 aa  105  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3248  putative transketolase, C-terminal subunit  26.11 
 
 		 314 aa  105  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  29.3 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0407  transketolase central region  31.73 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0194561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  28.01 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0910  putative transketolase, C-terminal subunit  26.77 
 
 		 310 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  27.27 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2646  Transketolase domain protein  28.21 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0477221  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3642  Transketolase central region  27.72 
 
 		 307 aa  99.8  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  26.42 
 
 		 314 aa  99  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  26.42 
 
 		 314 aa  99  9e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  29.1 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  28.66 
 
 		 313 aa  98.2  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  28.43 
 
 		 310 aa  97.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  29.41 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  25.88 
 
 		 314 aa  96.7  4e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  29.24 
 
 		 312 aa  96.3  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  26.84 
 
 		 336 aa  95.5  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  29.46 
 
 		 592 aa  95.5  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3528  Transketolase central region  26.86 
 
 		 306 aa  94.7  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605284  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  27.63 
 
 		 322 aa  94.7  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2448  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  28.81 
 
 		 631 aa  94  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  32.34 
 
 		 318 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14551  transketolase C-terminal subunit  25.26 
 
 		 304 aa  94  3e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  25.91 
 
 		 312 aa  93.6  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  28.8 
 
 		 311 aa  93.2  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  25.64 
 
 		 313 aa  92.8  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2402  transketolase, C-terminal subunit  28.3 
 
 		 310 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.730568  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  28.57 
 
 		 314 aa  92.4  8e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  26.77 
 
 		 319 aa  91.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1058  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  27.36 
 
 		 608 aa  90.9  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00967368  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2800  Transketolase central region  27.45 
 
 		 320 aa  90.5  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  27.8 
 
 		 311 aa  90.1  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  24.75 
 
 		 312 aa  90.1  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  25.57 
 
 		 312 aa  89.7  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1054  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  28.46 
 
 		 608 aa  89.4  6e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  26.76 
 
 		 315 aa  89.4  7e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  26.82 
 
 		 306 aa  88.6  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1057  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  27.76 
 
 		 627 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5103  Transketolase central region  29.71 
 
 		 306 aa  88.2  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.47717 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1826  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  27.46 
 
 		 659 aa  87.4  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.570269 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  29.59 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  25.77 
 
 		 320 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2182  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  27.36 
 
 		 625 aa  87.8  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0455646  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  28.84 
 
 		 314 aa  87.8  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  25.16 
 
 		 320 aa  87  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  27.24 
 
 		 313 aa  86.3  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1078  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  26.21 
 
 		 635 aa  86.3  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0303047  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1747  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  28.89 
 
 		 635 aa  85.9  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1381  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  28.66 
 
 		 628 aa  85.9  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.604583  normal  0.510709 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  27.34 
 
 		 313 aa  85.5  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1571  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  29.77 
 
 		 632 aa  85.5  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  23.28 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2615  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  30.26 
 
 		 637 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0207867  normal  0.922526 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1398  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  28.12 
 
 		 629 aa  85.5  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2287  transketolase central region  26.3 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1764  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  28.3 
 
 		 626 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0479282  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  27.55 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  28.36 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0161  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  30.11 
 
 		 640 aa  84.3  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2875  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  27.39 
 
 		 632 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0471  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  28.42 
 
 		 636 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  29.19 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2073  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  25.33 
 
 		 619 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.763377  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2240  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  24.83 
 
 		 622 aa  84  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.381879 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  27.51 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0484  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  28.42 
 
 		 636 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0190528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1430  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  29.29 
 
 		 643 aa  83.2  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0817623 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0905  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  26.71 
 
 		 617 aa  83.2  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3362  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  27.62 
 
 		 635 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1146  Transketolase domain protein  25.82 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  27.11 
 
 		 314 aa  82.8  0.000000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2403  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  28.03 
 
 		 626 aa  82.8  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0342  Transketolase domain protein  28.77 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3488  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  26.62 
 
 		 631 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0451312  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1852  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  27.1 
 
 		 640 aa  82.8  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0883  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  27.3 
 
 		 635 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000207097 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004258  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate synthase  26.94 
 
 		 621 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1787  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  25.33 
 
 		 619 aa  82  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1792  transketolase subunit B  29.79 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6781  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  31.18 
 
 		 653 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.772471  hitchhiker  0.0000939262 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  25.9 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  30.04 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1774  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  28.47 
 
 		 622 aa  81.6  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0951101  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3949  Transketolase domain protein  27.66 
 
 		 338 aa  81.3  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3648  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  31.65 
 
 		 634 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  27.24 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4486  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  31.65 
 
 		 646 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>