More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4641 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2880  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.57 
 
 
549 aa  642    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.824373  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7359  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.49 
 
 
554 aa  895    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.625389 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.01 
 
 
559 aa  654    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0674  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.82 
 
 
555 aa  641    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599551  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.75 
 
 
555 aa  664    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3917  putative ABC transporter ATP-binding protein  84.95 
 
 
558 aa  958    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.426446 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2552  ABC transporter-like protein  77.78 
 
 
554 aa  886    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.410797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7358  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.16 
 
 
554 aa  868    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1456  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.37 
 
 
549 aa  654    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.504666  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1002  ABC transporter related protein  61.04 
 
 
551 aa  648    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.856091  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4602  ABC transporter, ATP-binding protein  58.78 
 
 
563 aa  635    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29694  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0706  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.47 
 
 
555 aa  639    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.483075  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1127  putative ABC transporter ATP-binding protein  79.57 
 
 
558 aa  902    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4264  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.11 
 
 
554 aa  640    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11760  putative ABC transporter ATP-binding protein  79.57 
 
 
558 aa  901    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.406602 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2216  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.77 
 
 
547 aa  850    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.885012  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1816  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.28 
 
 
559 aa  865    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.461866  normal  0.0107915 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3241  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.09 
 
 
561 aa  648    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000308971  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0705  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.65 
 
 
555 aa  640    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0956761 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0834  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.45 
 
 
561 aa  644    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00294599  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22290  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.88 
 
 
559 aa  788    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.793295  normal  0.525138 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1687  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.57 
 
 
557 aa  647    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00296418  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4875  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.75 
 
 
554 aa  638    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54223  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0587  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.63 
 
 
551 aa  654    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1361  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.73 
 
 
561 aa  643    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127735  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1448  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.32 
 
 
555 aa  647    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391667  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1329  ABC transporter related protein  79.21 
 
 
554 aa  903    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.461505  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09750  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.87 
 
 
560 aa  856    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.83 
 
 
559 aa  645    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0762  putative ABC transporter ATP-binding protein  59 
 
 
555 aa  641    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1352  ABC transporter related protein  77.36 
 
 
560 aa  852    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000271939  hitchhiker  0.0000279927 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1527  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.21 
 
 
559 aa  645    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1129  ABC transporter, ATP-binding protein YjiK  71.07 
 
 
558 aa  801    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2580  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.45 
 
 
560 aa  647    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.471915  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4641  ABC transporter related protein  100 
 
 
558 aa  1143    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.310211  hitchhiker  0.00496143 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1148  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.91 
 
 
560 aa  824    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.493052  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3627  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.45 
 
 
551 aa  649    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1718  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.65 
 
 
549 aa  647    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0931  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.43 
 
 
560 aa  883    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2117  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.66 
 
 
549 aa  640    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.129596  normal  0.211481 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11480  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.98 
 
 
560 aa  842    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105111  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2152  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.89 
 
 
556 aa  635    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875259  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3426  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.45 
 
 
561 aa  645    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3426  ABC transporter related protein  78.32 
 
 
554 aa  886    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.543642 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1384  ABC transporter related protein  77.24 
 
 
557 aa  869    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2171  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.94 
 
 
560 aa  867    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000196153 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1089  ABC transporter related protein  77.54 
 
 
560 aa  870    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.545835  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.84 
 
 
550 aa  636    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3620  putative ABC transporter ATP-binding protein  79.21 
 
 
557 aa  894    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.914588  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2620  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.39 
 
 
549 aa  642    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.46 
 
 
555 aa  668    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.08 
 
 
670 aa  639    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3414  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.07 
 
 
555 aa  649    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.48 
 
 
558 aa  647    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3615  putative ABC transporter ATP-binding protein  79.21 
 
 
557 aa  894    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1855  putative ABC transporter ATP-binding protein  70.54 
 
 
559 aa  795    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2568  putative ABC transporter ATP-binding protein  80.47 
 
 
557 aa  904    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.878611  normal  0.580087 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3542  putative ABC transporter ATP-binding protein  84.77 
 
 
558 aa  959    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.610631  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2642  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.58 
 
 
560 aa  853    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.520141 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3542  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.78 
 
 
558 aa  885    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.195737  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5309  ABC transporter related protein  59.64 
 
 
559 aa  665    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5318  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.55 
 
 
560 aa  822    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134924  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2098  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.04 
 
 
555 aa  672    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.249977 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.17 
 
 
555 aa  648    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1442  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.98 
 
 
559 aa  771    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.465539  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4510  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.29 
 
 
555 aa  637    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29936  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2418  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.58 
 
 
560 aa  862    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0404573  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2026  ABC transporter related protein  77.96 
 
 
557 aa  878    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10980  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.52 
 
 
558 aa  775    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1522  ABC transporter related protein  73.08 
 
 
556 aa  824    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256666  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2197  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.45 
 
 
551 aa  650    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1614  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.26 
 
 
556 aa  835    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.682319  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0490  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.92 
 
 
551 aa  654    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191061  normal  0.167217 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2008  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.92 
 
 
551 aa  653    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1369  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.73 
 
 
560 aa  818    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.482048  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0300  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.98 
 
 
559 aa  777    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.208774 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3688  putative ABC transporter ATP-binding protein  79.21 
 
 
557 aa  894    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12501  putative ABC transporter ATP-binding protein  79.89 
 
 
558 aa  906    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0036999  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4070  putative ABC transporter ATP-binding protein  81.33 
 
 
557 aa  907    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08900  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.83 
 
 
560 aa  875    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.210485  normal  0.0113448 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24710  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  76.65 
 
 
560 aa  863    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0377191  normal  0.041371 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1411  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.3 
 
 
584 aa  651    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2240  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.63 
 
 
551 aa  654    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.497585 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2929  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.39 
 
 
549 aa  631  1e-180  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1060  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.5 
 
 
554 aa  634  1e-180  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298194  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0877  ABC transporter related protein  57.5 
 
 
555 aa  633  1e-180  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.9 
 
 
559 aa  633  1e-180  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2033  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.57 
 
 
549 aa  634  1e-180  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60800  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.39 
 
 
554 aa  634  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1864  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.79 
 
 
560 aa  634  1e-180  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.733773  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1057  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.22 
 
 
559 aa  633  1e-180  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.72 
 
 
557 aa  628  1e-179  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2485  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.07 
 
 
550 aa  630  1e-179  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.445071  normal  0.555297 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.3 
 
 
556 aa  629  1e-179  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5235  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.04 
 
 
579 aa  630  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.72 
 
 
557 aa  627  1e-178  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0959  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.48 
 
 
549 aa  625  1e-178  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.465393  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1403  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.94 
 
 
556 aa  626  1e-178  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.595923  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4129  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.1 
 
 
549 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4119  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.56 
 
 
555 aa  627  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>