More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2774 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
351 aa  703    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11480  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  61.19 
 
 
354 aa  424  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0814  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.63 
 
 
365 aa  399  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3502  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.78 
 
 
347 aa  381  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143523  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.18 
 
 
349 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.43 
 
 
350 aa  317  2e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00305624  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17160  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  43.02 
 
 
349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.764456  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0820  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.66 
 
 
349 aa  241  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20130  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  39.55 
 
 
357 aa  224  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.74 
 
 
466 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.566087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0422  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.74 
 
 
466 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.74 
 
 
466 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.657654  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2605  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.71 
 
 
338 aa  205  8e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.78 
 
 
347 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.23 
 
 
344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16640  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  38.82 
 
 
343 aa  200  3e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.9 
 
 
358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.239778  normal  0.124525 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4123  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.62 
 
 
358 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.970471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.62 
 
 
358 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0160562  normal  0.607841 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.05 
 
 
358 aa  180  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.671749  normal  0.0420203 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.05 
 
 
372 aa  177  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1362  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.32 
 
 
374 aa  150  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5808  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.86 
 
 
330 aa  137  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0733  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.2 
 
 
318 aa  126  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3468  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.49 
 
 
332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0135706  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4886  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.5 
 
 
328 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352468  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2322  hypothetical protein  31.51 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1961  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.51 
 
 
320 aa  114  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.08 
 
 
328 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.08 
 
 
328 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.366744 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1028  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.89 
 
 
331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1557  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.53 
 
 
340 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.623146  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.99 
 
 
360 aa  94  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.506058  normal  0.0549316 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.15 
 
 
305 aa  89.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.250439 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.9 
 
 
314 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0195709  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.89 
 
 
589 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.61 
 
 
354 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1672  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 
349 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.81 
 
 
328 aa  77  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4146  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.6 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0468277  hitchhiker  0.00205504 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.27 
 
 
308 aa  75.1  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  37.11 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.93 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.924748 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.02 
 
 
323 aa  73.2  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  36.42 
 
 
340 aa  72.8  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  25.81 
 
 
349 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.6 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0081  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.07 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0072  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.24 
 
 
366 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553166  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.89 
 
 
359 aa  68.9  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116075  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.26 
 
 
342 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0274  dihydroflavonol 4-reductase family protein  30.84 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.522156 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3856  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.38 
 
 
325 aa  67  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0537  hypothetical protein  26.48 
 
 
373 aa  66.2  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.571422  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02770  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.06 
 
 
331 aa  65.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.06 
 
 
321 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0539  hypothetical protein  24.71 
 
 
328 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0634  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
346 aa  65.1  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133207  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.37 
 
 
306 aa  64.3  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.21 
 
 
297 aa  64.7  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.199169 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2723  putative epimerase  26.42 
 
 
335 aa  63.9  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.4223  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.07 
 
 
315 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610304  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.52 
 
 
352 aa  63.5  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000297127  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.69 
 
 
315 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366779  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.24 
 
 
304 aa  63.5  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14431  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  31.4 
 
 
315 aa  63.5  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.98 
 
 
330 aa  63.2  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  24.01 
 
 
328 aa  62.8  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
368 aa  62.8  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1848  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.46 
 
 
305 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.58 
 
 
341 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.09 
 
 
318 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0684  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  39.66 
 
 
312 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.49 
 
 
402 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.47 
 
 
335 aa  60.8  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 
368 aa  60.8  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.75546  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.84 
 
 
331 aa  61.2  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3183  UDP-glucose 4-epimerase  25.79 
 
 
339 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.670308 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  29.18 
 
 
318 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1104  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.28 
 
 
310 aa  60.1  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.949606  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.1 
 
 
355 aa  60.1  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0840  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.44 
 
 
368 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.626315 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.64 
 
 
290 aa  60.1  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117314  hitchhiker  0.00259288 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0612  UDP-glucose 4-epimerase  31.61 
 
 
324 aa  60.1  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.520934  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1234  UDP-glucose 4-epimerase  27.7 
 
 
350 aa  60.1  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0382166  normal  0.453706 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0670  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.34 
 
 
310 aa  59.7  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.125394  normal  0.553916 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 
306 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.77 
 
 
351 aa  59.3  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.3 
 
 
355 aa  59.3  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0477666 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0012  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
312 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000378494  hitchhiker  0.0000148939 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 
309 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.08 
 
 
298 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 
349 aa  59.3  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12084  hypothetical protein  25.99 
 
 
854 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.620055  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.62 
 
 
320 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.73 
 
 
362 aa  58.9  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0997728  normal  0.116407 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.26 
 
 
329 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0252  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.73 
 
 
337 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.078071  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.45 
 
 
313 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794715  normal  0.286988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>