214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0949 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0949  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 561 aa  1090    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.323077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1010  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.48 
 
 		 599 aa  160  8e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8590  hypothetical protein  32.62 
 
 		 425 aa  90.9  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0593683  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3967  lipopolysaccharide biosynthesis protein  38.11 
 
 		 852 aa  89.7  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1011  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.25 
 
 		 464 aa  87.4  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  26.29 
 
 		 521 aa  82.4  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  27.02 
 
 		 529 aa  81.6  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4548  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.74 
 
 		 554 aa  80.9  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  29.82 
 
 		 505 aa  80.5  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  23.48 
 
 		 790 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  28.42 
 
 		 466 aa  77.4  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  28.65 
 
 		 803 aa  74.3  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5116  exopolysaccharide transport protein family  28.22 
 
 		 755 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  23.22 
 
 		 750 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  31.58 
 
 		 443 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  32.11 
 
 		 497 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  28.12 
 
 		 745 aa  71.6  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  23.74 
 
 		 739 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0861  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.25 
 
 		 536 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  21.14 
 
 		 464 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  28.35 
 
 		 747 aa  68.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.7 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  22.5 
 
 		 741 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3733  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.31 
 
 		 780 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  25.14 
 
 		 217 aa  67  0.0000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  27.27 
 
 		 503 aa  67  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6487  hypothetical protein  23.19 
 
 		 781 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.907329 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.01 
 
 		 741 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  23.68 
 
 		 740 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  25.4 
 
 		 740 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1689  exopolysaccharide transport protein family  25.28 
 
 		 744 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  21.94 
 
 		 741 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  21.94 
 
 		 741 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  21.94 
 
 		 741 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.33 
 
 		 726 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  23.33 
 
 		 726 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1122  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.94 
 
 		 780 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.33 
 
 		 726 aa  65.5  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.22 
 
 		 741 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.33 
 
 		 726 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.33 
 
 		 726 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  27.3 
 
 		 749 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  23.33 
 
 		 726 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  20.9 
 
 		 721 aa  65.1  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.33 
 
 		 726 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.33 
 
 		 726 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  26.53 
 
 		 803 aa  64.7  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  27.32 
 
 		 746 aa  65.1  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  23.74 
 
 		 739 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  23.46 
 
 		 739 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  23.46 
 
 		 739 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  21.92 
 
 		 741 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  26.64 
 
 		 508 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4408  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.93 
 
 		 761 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.989897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  19.87 
 
 		 482 aa  62.4  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  24.1 
 
 		 778 aa  62.4  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  30.05 
 
 		 490 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  21.19 
 
 		 764 aa  61.6  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5304  capsular exopolysaccharide family  26.6 
 
 		 539 aa  62  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  25 
 
 		 711 aa  60.8  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  23.68 
 
 		 736 aa  60.1  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3119  chromosome partitioning ATPase protein-like  31.41 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3538  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.49 
 
 		 563 aa  60.5  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.274644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1354  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  26.16 
 
 		 746 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.845392  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  25.62 
 
 		 782 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4243  exopolysaccharide transport protein family  26.45 
 
 		 757 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3850  protein-tyrosine kinase  22.3 
 
 		 784 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  24.19 
 
 		 740 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  27.24 
 
 		 734 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2106  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.07 
 
 		 724 aa  59.3  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  23.92 
 
 		 745 aa  58.9  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.59 
 
 		 235 aa  58.9  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  25.69 
 
 		 736 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2687  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.92 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2744  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.92 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  20.22 
 
 		 724 aa  58.9  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  22.04 
 
 		 747 aa  57.8  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  22.88 
 
 		 746 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  25.14 
 
 		 496 aa  57.8  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3271  EpsB  27.72 
 
 		 746 aa  57  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  23.64 
 
 		 723 aa  57  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  27.67 
 
 		 738 aa  57  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  23.27 
 
 		 734 aa  57  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3220  exopolysaccharide transport family protein  27.72 
 
 		 746 aa  57  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3258  exopolysaccharide transport family protein  27.72 
 
 		 746 aa  57  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.99 
 
 		 730 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1940  exopolysaccharide transport protein family  23.88 
 
 		 755 aa  57  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  22.43 
 
 		 742 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  23.97 
 
 		 748 aa  56.2  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3404  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.49 
 
 		 220 aa  56.6  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00848041  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0541  capsular exopolysaccharide family  22.35 
 
 		 217 aa  56.2  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  25.68 
 
 		 733 aa  55.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  20.99 
 
 		 736 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  25.45 
 
 		 454 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  26.63 
 
 		 252 aa  55.8  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  26.21 
 
 		 756 aa  55.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  21.94 
 
 		 740 aa  55.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  24.75 
 
 		 232 aa  54.7  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  25.26 
 
 		 492 aa  55.1  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4703  exopolysaccharide transport protein family  24.66 
 
 		 747 aa  54.7  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>