More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0974 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0974  ABC transporter related protein  100 
 
 		 205 aa  402  1e-111  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  46.63 
 
 		 368 aa  203  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  44.66 
 
 		 387 aa  201  7e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  45.19 
 
 		 366 aa  198  5e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1091  ABC transporter related  42.99 
 
 		 257 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1091  ABC transporter related  43.46 
 
 		 257 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  46.15 
 
 		 363 aa  196  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  45.59 
 
 		 357 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2095  ABC transporter related  43.81 
 
 		 257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.876637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.51 
 
 		 372 aa  194  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4316  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  43.33 
 
 		 257 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.480122  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  45.41 
 
 		 359 aa  193  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0308  ABC transporter related  44.71 
 
 		 356 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  46.08 
 
 		 347 aa  193  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1181  ABC transporter related  43.46 
 
 		 257 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0132418  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  45.41 
 
 		 359 aa  192  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.03 
 
 		 370 aa  192  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0728  ABC transporter related  42.52 
 
 		 257 aa  191  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  44.93 
 
 		 356 aa  192  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1208  ABC transporter related  42.52 
 
 		 257 aa  191  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324459  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  43.75 
 
 		 348 aa  191  8e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  45.32 
 
 		 354 aa  190  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  43.75 
 
 		 353 aa  190  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  43.69 
 
 		 349 aa  190  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  44.17 
 
 		 377 aa  189  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  43.48 
 
 		 329 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  44.71 
 
 		 363 aa  189  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.79 
 
 		 353 aa  189  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  44.39 
 
 		 366 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  44.39 
 
 		 333 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.51 
 
 		 352 aa  189  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  44.39 
 
 		 333 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  44.39 
 
 		 333 aa  188  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3882  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.48 
 
 		 329 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1215  ABC-transporter, ATP-binding protein  44.39 
 
 		 333 aa  189  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1314  ABC transporter related  43.96 
 
 		 329 aa  188  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159195  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  43.07 
 
 		 361 aa  188  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6542  ABC transporter related  43.96 
 
 		 362 aa  188  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  45.64 
 
 		 386 aa  188  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  44.71 
 
 		 342 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  43.75 
 
 		 363 aa  187  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1014  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.23 
 
 		 357 aa  187  7e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  42.03 
 
 		 339 aa  187  8e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  43.59 
 
 		 352 aa  187  8e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0758  ABC transporter related  43.27 
 
 		 365 aa  187  9e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  45.13 
 
 		 369 aa  187  9e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  43.2 
 
 		 343 aa  187  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1829  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.33 
 
 		 354 aa  187  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3997  ABC transporter related  43.48 
 
 		 329 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0225535  normal  0.167206 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2096  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.44 
 
 		 371 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0587102  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  44.39 
 
 		 333 aa  186  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1722  ABC transporter ATP-binding protein  43.48 
 
 		 329 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.109279 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2102  ABC transporter-related protein  41.75 
 
 		 356 aa  186  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  46.63 
 
 		 348 aa  186  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  43 
 
 		 331 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.79 
 
 		 362 aa  186  2e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  45.63 
 
 		 355 aa  186  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840822 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00860  putrescine transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  43.9 
 
 		 377 aa  185  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2787  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.9 
 
 		 377 aa  185  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1011  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.9 
 
 		 377 aa  186  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.512048 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5086  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.41 
 
 		 380 aa  185  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162626  normal  0.269362 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5179  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  43.41 
 
 		 380 aa  185  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00866  hypothetical protein  43.9 
 
 		 377 aa  185  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  44.83 
 
 		 353 aa  186  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4799  ABC transporter related  45.27 
 
 		 363 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0883  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.9 
 
 		 377 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.898473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  43.81 
 
 		 365 aa  186  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2741  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.9 
 
 		 377 aa  185  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.252768  normal  0.41994 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  45.1 
 
 		 338 aa  186  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1148  ABC transporter related  44.76 
 
 		 410 aa  186  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0958  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.9 
 
 		 377 aa  185  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  47.67 
 
 		 358 aa  185  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2335  ABC transporter  44.71 
 
 		 342 aa  185  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321614  normal  0.595854 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0393  polyamine transport protein PotG  43.9 
 
 		 384 aa  185  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2476  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.9 
 
 		 377 aa  185  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.615862  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0951  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.41 
 
 		 377 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0347  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.93 
 
 		 384 aa  185  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.89864 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0915  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.41 
 
 		 377 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1136  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.31 
 
 		 240 aa  185  4e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03940  polyamine transport protein PotG  43.9 
 
 		 384 aa  185  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1031  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.41 
 
 		 377 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2681  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  47.31 
 
 		 344 aa  185  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.255864  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5403  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.93 
 
 		 380 aa  185  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000274828 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3746  ABC transporter related  43.9 
 
 		 346 aa  185  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.31 
 
 		 353 aa  184  6e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1101  ABC transport system ATP-binding protein  46.63 
 
 		 333 aa  184  6e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1128  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA  43.27 
 
 		 357 aa  184  6e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  39.9 
 
 		 366 aa  184  7e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  42.51 
 
 		 328 aa  184  7e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1387  sulphate transport system permease protein 1  42.79 
 
 		 240 aa  184  7e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.748727 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1871  ABC transporter ATP-binding protein  43 
 
 		 331 aa  184  8e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1012  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.41 
 
 		 377 aa  184  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0730  ABC transporter related  42.51 
 
 		 330 aa  184  8e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.75 
 
 		 363 aa  184  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6577  ABC transporter related  43.96 
 
 		 359 aa  184  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.446279 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0927  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.41 
 
 		 377 aa  184  9e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0335  ABC transporter related  49.02 
 
 		 329 aa  184  9e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0307284  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3872  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.33 
 
 		 340 aa  184  9e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1074  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit CysA  42.79 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000278365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1739  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.23 
 
 		 355 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>