54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0900 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1193  MobA/MobL protein  70.41 
 
 		 507 aa  669    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0900  MobA/MobL protein  100 
 
 		 504 aa  981    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010659  SbBS512_D0003  mobilization protein A  38.31 
 
 		 516 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.488217  n/a   
 
 
-
 
NC_011093  SeSA_C0004  43 kDa relaxation protein  42.05 
 
 		 511 aa  147  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2819  MobA/MobL protein  36.36 
 
 		 533 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3827  MobA/MobL protein  36.36 
 
 		 234 aa  124  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5620  MobA/MobL protein  25.76 
 
 		 726 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2074  MobA/MobL family  25.57 
 
 		 501 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.103874  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5332  MobA/MobL protein  25 
 
 		 498 aa  65.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.873373 
 
 
-
 
NC_009473  Acry_3630  MobA/MobL protein  28.31 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5602  hypothetical protein  23.79 
 
 		 730 aa  63.9  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2314  MobA/MobL family protein  25.57 
 
 		 506 aa  61.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.127773  hitchhiker  0.00000000000117095 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6240  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  29.63 
 
 		 1102 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294548  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1788  MobA/MobL protein  27.64 
 
 		 544 aa  59.7  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.96066  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3191  conjugal transfer relaxase TraA  29.33 
 
 		 974 aa  58.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  25.48 
 
 		 968 aa  58.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4520  conjugal transfer relaxase TraA  27.03 
 
 		 998 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  25 
 
 		 998 aa  57.4  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6810  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  29.93 
 
 		 1098 aa  56.6  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3571  conjugal transfer relaxase TraA  26.71 
 
 		 1025 aa  56.6  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0178  conjugal transfer relaxase TraA  26.03 
 
 		 814 aa  56.2  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0272  conjugal transfer relaxase TraA  28.97 
 
 		 976 aa  55.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618636  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2653  conjugal transfer relaxase TraA  28.97 
 
 		 976 aa  55.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  31.19 
 
 		 985 aa  55.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_004253  pDOJH10S_p2  Mob  25.45 
 
 		 492 aa  55.1  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  28.04 
 
 		 1039 aa  54.7  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0994  conjugal transfer relaxase TraA  28.3 
 
 		 1034 aa  54.3  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112891  decreased coverage  0.0000169955 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4977  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  30.37 
 
 		 1098 aa  53.9  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4226  conjugal transfer relaxase TraA  29.25 
 
 		 1000 aa  53.9  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0036143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1543  conjugal transfer relaxase TraA  29.25 
 
 		 1000 aa  53.9  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.41653  normal  0.458262 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2276  conjugal transfer relaxase TraA  28.3 
 
 		 1006 aa  53.9  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179337 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6557  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  30.37 
 
 		 1095 aa  53.9  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D28  hypothetical protein  26.67 
 
 		 673 aa  53.5  0.000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00718795  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1747  MobA/MobL protein  23.14 
 
 		 465 aa  53.5  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0149  conjugal transfer relaxase TraA  28.7 
 
 		 1034 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5348  mobilization protein  26.5 
 
 		 407 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8131  Dtr system oriT relaxase  31.03 
 
 		 1100 aa  52.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9189  Dtr system oriT relaxase  31.03 
 
 		 1123 aa  52.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136231  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0682  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  25.12 
 
 		 1105 aa  51.2  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  24.66 
 
 		 952 aa  50.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0002  MobA/MobL family protein  22.73 
 
 		 719 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29222  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6372  conjugal transfer relaxase TraA  28.97 
 
 		 982 aa  50.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7064  Dtr system oriT relaxase  30.34 
 
 		 1100 aa  49.3  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590726  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  23.81 
 
 		 952 aa  49.3  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_004252  pDOJH10L_p03  hypothetical protein  22.55 
 
 		 370 aa  49.3  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3228  MobA/MobL protein  28.97 
 
 		 447 aa  48.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004252  pDOJH10L_p07  hypothetical protein  23.85 
 
 		 160 aa  47  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4540  Dtr system oriT relaxase  28.32 
 
 		 1107 aa  46.6  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0169  hypothetical protein  25.58 
 
 		 881 aa  46.2  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0183  hypothetical protein  25.58 
 
 		 879 aa  46.2  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9595  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  27.07 
 
 		 1356 aa  45.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.973742  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3575  Dtr system oriT relaxase  27.36 
 
 		 1102 aa  45.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4998  MobA/MobL protein  25.26 
 
 		 766 aa  43.9  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0989  MobA/MobL protein  29.32 
 
 		 430 aa  43.5  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>