57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3973 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3973  putative secreted protein  100 
 
 		 475 aa  973    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03254  secreted protein of porin family  53.87 
 
 		 346 aa  378  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00710  hypothetical protein  37.9 
 
 		 387 aa  262  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0519  hypothetical protein  38.77 
 
 		 388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1530  porin  35.85 
 
 		 380 aa  210  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.232384  normal  0.862821 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1745  porin  35.92 
 
 		 387 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00151108  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1749  porin  35.39 
 
 		 387 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474963  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2535  porin  35.39 
 
 		 387 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00634878  hitchhiker  0.000395636 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1788  porin  35.39 
 
 		 387 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0218483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2083  hypothetical protein  35.58 
 
 		 382 aa  207  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000452376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2624  hypothetical protein  33.68 
 
 		 470 aa  206  5e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.573828  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2365  hypothetical protein  35.12 
 
 		 387 aa  206  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000963211  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2437  hypothetical protein  35.54 
 
 		 387 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2526  hypothetical protein  35.12 
 
 		 387 aa  204  4e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0440119  normal  0.0252757 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0275  porin  35.04 
 
 		 387 aa  203  7e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450177  hitchhiker  0.0000113069 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2728  porin  35.47 
 
 		 379 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0767008  hitchhiker  0.0000304831 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1465  hypothetical protein  33.42 
 
 		 383 aa  196  6e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00157925  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1860  porin  33.69 
 
 		 380 aa  195  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0469133  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2561  porin  33.77 
 
 		 386 aa  196  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.23329  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5280  hypothetical protein  31.63 
 
 		 390 aa  184  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3753  hypothetical protein  33.88 
 
 		 344 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.30057 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2501  hypothetical protein  30.93 
 
 		 408 aa  174  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2599  hypothetical protein  34.21 
 
 		 418 aa  166  6.9999999999999995e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2395  porin  28.91 
 
 		 477 aa  160  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  0.306848 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3418  hypothetical protein  34.5 
 
 		 351 aa  153  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2612  hypothetical protein  31.44 
 
 		 346 aa  149  8e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4962  hypothetical protein  30 
 
 		 352 aa  145  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.936284  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1263  hypothetical protein  30.89 
 
 		 346 aa  142  9e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1401  hypothetical protein  29.49 
 
 		 348 aa  137  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00461856  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1411  hypothetical protein  32.01 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3138  hypothetical protein  29 
 
 		 346 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.363093 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0404  hypothetical protein  29.58 
 
 		 475 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.331514  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0273  hypothetical protein  30.58 
 
 		 354 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.74892  hitchhiker  0.000266668 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0302  hypothetical protein  31.76 
 
 		 360 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0852461  normal  0.204946 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0904  hypothetical protein  28.53 
 
 		 356 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.844767  hitchhiker  0.00000607436 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1730  hypothetical protein  27.42 
 
 		 365 aa  123  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4187  hypothetical protein  29.01 
 
 		 357 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.429179 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0510  secreted porin family protein  30.64 
 
 		 400 aa  121  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.938246  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2537  hypothetical protein  28.84 
 
 		 371 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0322  hypothetical protein  29.95 
 
 		 362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03255  hypothetical protein  62.86 
 
 		 117 aa  111  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4728  hypothetical protein  25.68 
 
 		 464 aa  101  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0287  hypothetical protein  26.81 
 
 		 386 aa  90.9  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000514859  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1239  hypothetical protein  28.57 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.335743  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1424  hypothetical protein  24.88 
 
 		 560 aa  80.1  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1166  hypothetical protein  27.96 
 
 		 343 aa  80.1  0.00000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.875673 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1605  hypothetical protein  26.18 
 
 		 433 aa  79.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3321  hypothetical protein  25.83 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0104  hypothetical protein  24.92 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.901888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1630  hypothetical protein  24.65 
 
 		 450 aa  56.2  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1498  hypothetical protein  30.19 
 
 		 409 aa  50.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0114368  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3415  hypothetical protein  25.07 
 
 		 549 aa  50.1  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0604  hypothetical protein  22.96 
 
 		 468 aa  47.8  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2826  hypothetical protein  28.1 
 
 		 441 aa  45.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1428  hypothetical protein  31.11 
 
 		 441 aa  45.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134202  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3572  hypothetical protein  28.92 
 
 		 452 aa  44.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544352  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0526  hypothetical protein  25.37 
 
 		 635 aa  43.5  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.710875 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>