More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1345 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1345  Ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 280 aa  551  1e-156  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.593277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00456  putrescine transport protein; permease  70.4 
 
 		 253 aa  333  2e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.033567  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.8 
 
 		 272 aa  308  4e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1566  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  59.55 
 
 		 281 aa  308  5e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1014  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  60.53 
 
 		 281 aa  308  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1033  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  60.53 
 
 		 281 aa  308  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0953  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  60.53 
 
 		 281 aa  308  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2383  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  62.03 
 
 		 281 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0985  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  60.53 
 
 		 281 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0879861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2642  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  59.18 
 
 		 281 aa  306  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0735295  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2727  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  59.18 
 
 		 281 aa  306  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1648  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  58.74 
 
 		 281 aa  305  6e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.256197 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0917  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  60.53 
 
 		 281 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1695  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  59.77 
 
 		 281 aa  301  8.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.714449  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.81 
 
 		 269 aa  301  1e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.458756  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.87 
 
 		 271 aa  301  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.87 
 
 		 271 aa  301  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.024318  normal  0.589307 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2284  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  59.55 
 
 		 281 aa  300  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.408593  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1961  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  59.4 
 
 		 281 aa  300  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3925  ornithine carbamoyltransferase  57.31 
 
 		 273 aa  300  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.13527  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2639  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.02 
 
 		 271 aa  300  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0166478  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00862  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  60.9 
 
 		 281 aa  299  3e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1609  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  57.31 
 
 		 273 aa  299  3e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0392744  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00868  hypothetical protein  60.9 
 
 		 281 aa  299  3e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3006  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.73 
 
 		 271 aa  299  3e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.49 
 
 		 271 aa  298  6e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0208351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2474  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  60.53 
 
 		 281 aa  298  7e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.539431  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0929  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  60.53 
 
 		 281 aa  298  7e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1013  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  60.53 
 
 		 281 aa  298  7e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.373208 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2785  Ornithine carbamoyltransferase  60.53 
 
 		 281 aa  298  8e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2739  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  60.53 
 
 		 281 aa  298  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.116908  normal  0.55547 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.11 
 
 		 271 aa  297  1e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0724945  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1371  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  58.65 
 
 		 281 aa  297  1e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0885  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  60.53 
 
 		 281 aa  298  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.110855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0960  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  60.53 
 
 		 281 aa  298  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1273  polyamine ABC transporter, permease protein  56.11 
 
 		 271 aa  296  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1202  ornithine carbamoyltransferase  55.89 
 
 		 271 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0144626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3189  Ornithine carbamoyltransferase  55.89 
 
 		 271 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.72371  normal  0.0258065 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1169  ornithine carbamoyltransferase  55.89 
 
 		 271 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.017225  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1111  ornithine carbamoyltransferase  55.89 
 
 		 271 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00240175  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0976  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.62 
 
 		 275 aa  291  7e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0949  ornithine carbamoyltransferase  56.39 
 
 		 271 aa  291  9e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1015  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  55.85 
 
 		 278 aa  286  4e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1261  Ornithine carbamoyltransferase  57.31 
 
 		 273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0349  ornithine carbamoyltransferase  54.55 
 
 		 295 aa  281  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0313  ornithine carbamoyltransferase  51.91 
 
 		 273 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.516071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0166  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.02 
 
 		 272 aa  279  3e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1064  ornithine carbamoyltransferase  56.75 
 
 		 275 aa  279  4e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1134  ornithine carbamoyltransferase  57.54 
 
 		 275 aa  279  5e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.08 
 
 		 272 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00439076  hitchhiker  0.00000318128 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0378  Ornithine carbamoyltransferase  52.31 
 
 		 272 aa  275  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0255644  hitchhiker  0.00261516 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5177  ornithine carbamoyltransferase  53.36 
 
 		 297 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00577642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0286  ornithine carbamoyltransferase  53.36 
 
 		 297 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470057  normal  0.688264 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5084  ornithine carbamoyltransferase  53.36 
 
 		 297 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.182213  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48730  polyamine transport protein PotI  56.06 
 
 		 289 aa  271  6e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.907578  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2118  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  54.17 
 
 		 294 aa  270  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.210176  normal  0.100236 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5401  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  53.36 
 
 		 296 aa  270  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.424261  hitchhiker  0.00155673 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0395  polyamine transport protein PotI  52.61 
 
 		 289 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0825  ABC transporter membrane spanning protein  51.91 
 
 		 271 aa  269  4e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1906  putrescine transport system permease protein  50 
 
 		 288 aa  268  7e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.386242 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.91 
 
 		 272 aa  268  8.999999999999999e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562661  normal  0.792385 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03960  polyamine transport protein PotI  52.61 
 
 		 289 aa  267  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4861  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  52.61 
 
 		 293 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5301  putrescine ABC transporter, permease protein  52.24 
 
 		 293 aa  265  7e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0937  ABC putrescine transporter, inner membrane subunit PotI  48.54 
 
 		 303 aa  265  7e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023039  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4661  Ornithine carbamoyltransferase  48.18 
 
 		 303 aa  265  8e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.535796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1364  TonB-dependent receptor  55 
 
 		 270 aa  264  1e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2993  ornithine carbamoyltransferase  48.35 
 
 		 279 aa  263  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2943  ornithine carbamoyltransferase  51.12 
 
 		 272 aa  262  4e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1276  ornithine carbamoyltransferase  51.95 
 
 		 272 aa  260  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal  0.197685 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6348  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  47.99 
 
 		 279 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2811  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  47.99 
 
 		 279 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3046  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.99 
 
 		 279 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2999  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.97 
 
 		 279 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.26863  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3018  ornithine carbamoyltransferase  47.97 
 
 		 279 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.97 
 
 		 279 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2279  putrescine ABC transporter, permease protein  49.62 
 
 		 272 aa  259  4e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.166638  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5237  ornithine carbamoyltransferase  53.36 
 
 		 297 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2120  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  50.38 
 
 		 272 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.412651  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1298  putrescine ABC transporter, permease protein  50.38 
 
 		 272 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1055  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  50.38 
 
 		 272 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.464145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2307  putrescine transport system permease protein  50.38 
 
 		 272 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1785  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  50.38 
 
 		 272 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0110  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  50.38 
 
 		 272 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2175  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  50.38 
 
 		 272 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.661225  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3520  ornithine carbamoyltransferase  52.73 
 
 		 272 aa  257  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.238195 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2908  ornithine carbamoyltransferase  47.6 
 
 		 279 aa  255  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1008  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50.58 
 
 		 273 aa  255  6e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.507644  normal  0.428884 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4637  Ornithine carbamoyltransferase  52.46 
 
 		 266 aa  254  8e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476846  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6836  putrescine ABC transporter membrane protein  53.15 
 
 		 274 aa  254  9e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.7 
 
 		 273 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.7 
 
 		 273 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949038  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1764  ornithine carbamoyltransferase  48.7 
 
 		 273 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1951  putrescine ABC transporter, permease protein  49.21 
 
 		 309 aa  252  6e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2017  putrescine transport system permease protein  49.01 
 
 		 309 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0631  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  49.01 
 
 		 309 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.366823  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0723  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  49.01 
 
 		 309 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1953  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  49.63 
 
 		 272 aa  248  9e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0210631  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2306  Ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 272 aa  246  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.237978  normal  0.193759 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1512  ornithine carbamoyltransferase  49.19 
 
 		 274 aa  246  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.568163  normal  0.487271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>