More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6965 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013732  Slin_6965  major intrinsic protein  100 
 
 
258 aa  513  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113023  normal  0.0476417 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1147  major intrinsic protein  36.78 
 
 
300 aa  123  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3485  major intrinsic protein  34.52 
 
 
296 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.731272 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1571  MIP family channel protein  31.54 
 
 
269 aa  107  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.20348  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0790  major intrinsic protein  34.39 
 
 
273 aa  98.6  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2523  major intrinsic protein  33.17 
 
 
279 aa  97.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218151  normal  0.0321632 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0165  MIP family channel protein  34.68 
 
 
240 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0297  MIP family channel protein  34.68 
 
 
240 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4329  MIP family channel protein  40.13 
 
 
252 aa  91.3  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0766211 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4099  aquaporin Z  34.09 
 
 
232 aa  89.7  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53482  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1895  MIP family channel protein  36.21 
 
 
238 aa  89.7  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144507  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0988  aquaporin Z  33.62 
 
 
235 aa  89  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.505214  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2886  aquaporin Z  31.44 
 
 
231 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000424459 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3064  aquaporin Z  31 
 
 
231 aa  86.3  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158799  decreased coverage  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0489  major intrinsic protein  31.68 
 
 
227 aa  85.9  5e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1211  aquaporin Z  32.88 
 
 
231 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2968  aquaporin Z  31 
 
 
231 aa  85.5  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0762473  unclonable  0.0000412314 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1167  aquaporin Z  32.88 
 
 
231 aa  85.1  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.56662  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1307  aquaporin Z  32.31 
 
 
229 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0466  MIP family channel protein  34.44 
 
 
234 aa  85.1  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00747892  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2034  MIP family channel protein  32.16 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1922  MIP family channel protein  30.57 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.748219  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1244  aquaporin Z  32.58 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.9193  normal  0.344716 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1206  aquaporin Z  31.22 
 
 
232 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3846  aquaporin Z  32.16 
 
 
232 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.452606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1100  major intrinsic protein  34.06 
 
 
278 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591706  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3036  MIP family channel protein  31.22 
 
 
230 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3671  aquaporin Z  31.28 
 
 
245 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2325  MIP family channel protein  32.47 
 
 
234 aa  80.9  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1586  aquaporin Z  32.16 
 
 
232 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4282  aquaporin Z  34.16 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0544135  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1241  MIP family channel protein  31.22 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000683492  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2320  MIP family channel protein  32.48 
 
 
229 aa  80.5  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0047  glycerol uptake facilitator related permease  30.74 
 
 
250 aa  79.7  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3823  aquaporin Z  34.24 
 
 
246 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2637  major intrinsic protein  32.13 
 
 
216 aa  79  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0941  MIP family channel protein  33.92 
 
 
243 aa  79  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263056  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0906  aquaporin Z  30.7 
 
 
247 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3605  aquaporin Z  30.84 
 
 
245 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0357  major intrinsic protein  35.11 
 
 
247 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3163  MIP family channel protein  31.6 
 
 
227 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.793787  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3745  aquaporin Z  30.84 
 
 
245 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.914772  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0111  aquaporin Z  34.8 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891213  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2982  aquaporin Z  34.88 
 
 
249 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727537  decreased coverage  0.0000000621179 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3608  aquaporin Z  32.92 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.683694  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03084  aquaporin Z  30.97 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1151  MIP family channel protein  30.67 
 
 
229 aa  75.9  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3945  aquaporin Z  34.88 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.650351  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0561  major intrinsic protein  29.75 
 
 
237 aa  75.5  0.0000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3190  aquaporin Z  35.47 
 
 
254 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2868  aquaporin Z  34.88 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0085  aquaporin Z  34.88 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3107  aquaporin Z  34.88 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.536617  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3864  aquaporin Z  34.88 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3443  aquaporin Z  34.88 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1676  aquaporin Z  34.88 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0702  MIP family channel protein  30.4 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256529  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0239  MIP family channel protein  32.92 
 
 
247 aa  74.7  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507292  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3350  aquaporin Z  35.26 
 
 
247 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5705  aquaporin  30.04 
 
 
234 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1071  aquaporin Z  30.94 
 
 
229 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1040  MIP family channel protein  36.08 
 
 
243 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1636  Na+/H+ antiporter NhaC  30.14 
 
 
236 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314424  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07120  aquaporin Z  30.14 
 
 
237 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152443  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3651  aquaporin Z  32.3 
 
 
228 aa  74.7  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0230  aquaporin Z  35.26 
 
 
247 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0126  MIP family channel protein  30.88 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.840143  normal  0.0656822 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11660  aquaporin Z  30.04 
 
 
229 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584005  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1139  MIP family channel protein  34.5 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2859  aquaporin Z  36.42 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002890  aquaporin Z  30.14 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0248  aquaporin Z  36.42 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3576  MIP family channel protein  32.89 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.617496  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0851  MIP family channel protein  32.35 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0157  aquaporin Z  32.64 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.704052 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3356  major intrinsic protein  36.81 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.47386  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4933  MIP family channel protein  31.6 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000566252  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0324  MIP family channel protein  30.04 
 
 
246 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2467  aquaporin Z  30.14 
 
 
240 aa  72.4  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12503  normal  0.220778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1426  aquaporin Z  31.06 
 
 
231 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.647235  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0786  MIP family channel protein  29.65 
 
 
239 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.307051  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2984  MIP family channel protein  30.98 
 
 
239 aa  70.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.392184  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0179  aquaporin Z  29.03 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000341158 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44871  predicted protein  29.41 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0011  MIP family channel protein  30.51 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1392  aquaporin Z  29.15 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.606912  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0174  aquaporin Z  36.54 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0161  aquaporin Z  36.54 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.418088  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15980  MIP family channel protein  32.72 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02220  MIP family channel protein  28.38 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.967608  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0400  MIP family channel protein  29.13 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0235  MIP family channel protein  30.77 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1234  aquaporin Z  31.19 
 
 
237 aa  68.6  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35715  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4797  MIP family channel protein  31.67 
 
 
281 aa  68.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000240891 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12070  permease, glycerol uptake facilitator  32.9 
 
 
231 aa  68.6  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0968593  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4402  aquaporin Z  31.06 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2149  MIP family channel protein  32.32 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4742  aquaporin Z  31.06 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0516  major intrinsic protein  30.09 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4980  MIP family channel protein  29.27 
 
 
238 aa  67.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0631888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>