297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4736 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  100 
 
 		 497 aa  1033    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  61.47 
 
 		 487 aa  623  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  28.93 
 
 		 472 aa  144  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  31.77 
 
 		 458 aa  143  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  26.59 
 
 		 463 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0653  peptidase M28  29.17 
 
 		 438 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.602384  normal  0.117412 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  25.72 
 
 		 456 aa  137  6.0000000000000005e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  28.33 
 
 		 495 aa  136  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  27.19 
 
 		 525 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  27.44 
 
 		 440 aa  133  6e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  31.72 
 
 		 454 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1360  peptidase M28  27.89 
 
 		 454 aa  127  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0415  peptidase M28  26.36 
 
 		 440 aa  126  7e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1664  peptidase M28  28.51 
 
 		 479 aa  126  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1103  peptidase M28  27.36 
 
 		 471 aa  125  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.608477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1093  peptidase M28  27.22 
 
 		 454 aa  121  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3241  peptidase M28  27 
 
 		 436 aa  121  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3197  peptidase M28  25.91 
 
 		 473 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  26.32 
 
 		 468 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3990  peptidase M28  26.05 
 
 		 447 aa  120  7.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.558433  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  26.1 
 
 		 468 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  28.06 
 
 		 539 aa  118  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3368  peptidase M28  26.29 
 
 		 459 aa  117  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3539  M28D family peptidase  27.76 
 
 		 414 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  24.84 
 
 		 468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  26.6 
 
 		 472 aa  114  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  25.92 
 
 		 468 aa  113  9e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  26.04 
 
 		 468 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2554  M28 family peptidase  26.35 
 
 		 469 aa  111  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  24.95 
 
 		 467 aa  111  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  25.34 
 
 		 481 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  26.01 
 
 		 468 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  24.84 
 
 		 468 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  24.72 
 
 		 469 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5666  Endoribonuclease L-PSP  27.91 
 
 		 580 aa  106  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106128  normal  0.852479 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3518  peptidase M28  27.69 
 
 		 463 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  25.79 
 
 		 481 aa  104  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0412  peptidase M28  28.57 
 
 		 460 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0420601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02736  aminopeptidase  25.63 
 
 		 471 aa  100  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465186  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  26.46 
 
 		 552 aa  100  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  24.89 
 
 		 466 aa  100  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3661  peptidase M28  25.63 
 
 		 468 aa  99  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  26.22 
 
 		 525 aa  98.6  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0237  peptidase M28  26.27 
 
 		 471 aa  97.4  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  30.28 
 
 		 391 aa  94.7  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  30.15 
 
 		 555 aa  94.4  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  24.55 
 
 		 477 aa  92.8  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  29.92 
 
 		 462 aa  92  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  26.11 
 
 		 512 aa  91.3  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  27.5 
 
 		 468 aa  90.5  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  30.36 
 
 		 547 aa  89.4  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  29.47 
 
 		 947 aa  89.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  25.74 
 
 		 678 aa  88.6  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  30.5 
 
 		 584 aa  85.9  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2350  peptidase M28  28.94 
 
 		 457 aa  83.6  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  27.3 
 
 		 526 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3913  Aminopeptidase Y  26.93 
 
 		 512 aa  82.4  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  26.56 
 
 		 466 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  27.78 
 
 		 466 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  27.07 
 
 		 466 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  27.07 
 
 		 466 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  27.07 
 
 		 466 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  27.97 
 
 		 466 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  27.07 
 
 		 466 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  27.07 
 
 		 466 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  26.92 
 
 		 503 aa  79.7  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  24.31 
 
 		 544 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  26.92 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  28.71 
 
 		 775 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  26.67 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  28.3 
 
 		 559 aa  79  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  27.53 
 
 		 556 aa  79  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  30.51 
 
 		 569 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4953  Aminopeptidase Y  28.07 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000539028  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  31.58 
 
 		 553 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1367  Glutamate carboxypeptidase II  40 
 
 		 751 aa  77  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0341097  normal  0.079347 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  24.27 
 
 		 550 aa  77  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  24.83 
 
 		 491 aa  76.6  0.0000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  27.25 
 
 		 465 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  25.39 
 
 		 944 aa  76.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  24.08 
 
 		 548 aa  75.5  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  25.06 
 
 		 575 aa  75.1  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1408  aminopeptidase Y  26.51 
 
 		 518 aa  74.3  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  41.28 
 
 		 677 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05516  aminopeptidase  32.54 
 
 		 504 aa  73.9  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  29.61 
 
 		 542 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  28.7 
 
 		 513 aa  73.2  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01630  aminopeptidase Y  26.71 
 
 		 509 aa  73.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.777606  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  29.53 
 
 		 529 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4009  Glutamate carboxypeptidase II  26.42 
 
 		 743 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  decreased coverage  0.0030346 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2343  Aminopeptidase Y  26.9 
 
 		 512 aa  72.8  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.362822  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  28.69 
 
 		 325 aa  73.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  26.04 
 
 		 512 aa  72  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  40.74 
 
 		 578 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2819  glutamate carboxypeptidase II  39.69 
 
 		 757 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.140178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2823  glutamate carboxypeptidase II  24.71 
 
 		 712 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.261678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  29.72 
 
 		 550 aa  72  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  25.79 
 
 		 519 aa  71.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  32.17 
 
 		 501 aa  71.6  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  27.19 
 
 		 552 aa  71.2  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>