More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3918 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3918  Amidase  100 
 
 		 519 aa  1051    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  47.74 
 
 		 501 aa  419  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  46.68 
 
 		 503 aa  414  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  46.67 
 
 		 493 aa  390  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03450  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  46.18 
 
 		 493 aa  369  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.524183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  43.51 
 
 		 495 aa  366  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2905  amidase  45.72 
 
 		 474 aa  359  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132105  normal  0.0619006 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3322  Amidase  46.09 
 
 		 476 aa  359  6e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  42.5 
 
 		 499 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2551  amidase  45.21 
 
 		 474 aa  356  5.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0761469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3043  amidase  44.62 
 
 		 475 aa  355  1e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  45.08 
 
 		 499 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3583  Amidase  45.96 
 
 		 495 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3433  amidase  46.15 
 
 		 495 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0529991  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3515  Amidase  45.9 
 
 		 500 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0228  Amidase  43.17 
 
 		 508 aa  345  8e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1781  Amidase  44.2 
 
 		 493 aa  345  2e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0646123  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  43.58 
 
 		 489 aa  342  7e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0088  Amidase  44.73 
 
 		 502 aa  337  2.9999999999999997e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1371  Amidase  41.63 
 
 		 509 aa  335  1e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  42.83 
 
 		 489 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  42.52 
 
 		 489 aa  331  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  42.52 
 
 		 489 aa  331  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  42.5 
 
 		 473 aa  328  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0431  amidase  41.11 
 
 		 497 aa  324  2e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  42.44 
 
 		 483 aa  323  5e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3602  amidase  44.84 
 
 		 501 aa  323  7e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00171301  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  39.72 
 
 		 488 aa  322  9.000000000000001e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4169  amidase  44.23 
 
 		 479 aa  320  3e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.291168  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0189  amidase  43.02 
 
 		 492 aa  316  7e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5822  amidase  41.65 
 
 		 490 aa  316  8e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0202  amidase  43 
 
 		 492 aa  315  9e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.226133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3414  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  42.77 
 
 		 494 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2839  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  42.77 
 
 		 496 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1704  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  42.77 
 
 		 494 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3137  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  42.77 
 
 		 494 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0390  Amidase  41.33 
 
 		 506 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2998  Amidase  43.66 
 
 		 492 aa  311  1e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0561708 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3916  amidase family protein  42.21 
 
 		 517 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153951  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0054  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  42.22 
 
 		 496 aa  310  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0927  amidase  41.8 
 
 		 472 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3161  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  41.6 
 
 		 496 aa  307  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386322  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6315  amidase  41.76 
 
 		 482 aa  307  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3835  amidase family protein  42.88 
 
 		 521 aa  306  7e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.254252  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3042  amidase  40.39 
 
 		 476 aa  305  1.0000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136828  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4526  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase, putative  41.24 
 
 		 481 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3378  amidase  43.92 
 
 		 492 aa  302  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  40 
 
 		 483 aa  302  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4331  amidase  42.02 
 
 		 522 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2832  amidase  44.51 
 
 		 492 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26863  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0110  amidase  41.76 
 
 		 504 aa  298  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0275  amidase  44.51 
 
 		 492 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0622  amidase  40.04 
 
 		 496 aa  296  4e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.240573  normal  0.237007 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0257  amidase  44.51 
 
 		 492 aa  296  8e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6117  amidase  39.76 
 
 		 484 aa  293  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6405  amidase  39.96 
 
 		 491 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4892  amidase  39.37 
 
 		 480 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3272  amidase  39.37 
 
 		 480 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  37.88 
 
 		 531 aa  288  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6915  amidase  39.37 
 
 		 480 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128062  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  41.3 
 
 		 474 aa  286  9e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4559  Amidase  43.16 
 
 		 496 aa  285  2.0000000000000002e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739809  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0183  amidase  41.59 
 
 		 492 aa  280  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.813319  normal  0.0139944 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0518  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.28 
 
 		 498 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1476  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  39.05 
 
 		 492 aa  270  5e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6284  Amidase  37.16 
 
 		 476 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.319568 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2598  amidase  39.77 
 
 		 474 aa  262  8.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468193  normal  0.210998 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1550  amidase  38.37 
 
 		 476 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.345213 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4842  amidase  37.01 
 
 		 476 aa  259  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00703489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1519  amidase  36.31 
 
 		 488 aa  258  2e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4710  amidase  39.3 
 
 		 481 aa  257  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3358  amidase  38.88 
 
 		 470 aa  257  4e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.727404  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0166  amidase  37.65 
 
 		 479 aa  253  6e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2735  amidase  39.61 
 
 		 489 aa  251  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395131  normal  0.14189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2705  amidase  39.61 
 
 		 489 aa  251  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0919281  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2749  amidase  39.61 
 
 		 489 aa  251  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1064  amidase  38.33 
 
 		 495 aa  249  7e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3053  amidase  41.4 
 
 		 475 aa  246  6e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.807445 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2401  putative 6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  38.33 
 
 		 485 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0726676  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1602  amidase  36.96 
 
 		 476 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4481  Amidase  36.59 
 
 		 494 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2536  amidase  37.4 
 
 		 475 aa  239  8e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1346  Amidase  39.13 
 
 		 476 aa  237  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.515427  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1228  amidase  36.65 
 
 		 466 aa  237  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3416  Amidase  39.05 
 
 		 486 aa  237  5.0000000000000005e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.859407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2154  amidase  35.04 
 
 		 503 aa  233  6e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.241394  normal  0.0235675 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7330  amidase  35.4 
 
 		 477 aa  232  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1611  amidase  35.05 
 
 		 486 aa  231  2e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.581508  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2910  hypothetical protein  33.69 
 
 		 460 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0311  amidase  34.95 
 
 		 489 aa  230  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5815  Amidase  36.06 
 
 		 476 aa  230  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.932467  decreased coverage  0.00501532 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2213  amidase  35.94 
 
 		 468 aa  228  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0370665  normal  0.373518 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3242  amidase  38.6 
 
 		 470 aa  226  8e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2764  hypothetical protein  33.9 
 
 		 460 aa  226  9e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6344  Amidase  34.91 
 
 		 502 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.918159  normal  0.55014 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1076  amidase  34.8 
 
 		 470 aa  219  6e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1403  Amidase  34.13 
 
 		 467 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0191  amidase  32.08 
 
 		 492 aa  218  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1372  Amidase  34.26 
 
 		 467 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0334  amidase  34.25 
 
 		 465 aa  215  9.999999999999999e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>