113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2749 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2749  NmrA family protein  100 
 
 		 298 aa  619  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000742781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1973  NmrA family protein  49.66 
 
 		 302 aa  265  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0361204 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0748  NmrA family protein  47.08 
 
 		 300 aa  258  6e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.461727  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5373  NmrA family protein  45.15 
 
 		 304 aa  247  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5415  NmrA family protein  42.66 
 
 		 301 aa  200  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.958636  normal  0.0224555 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2857  NmrA family protein  38.8 
 
 		 325 aa  185  9e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1731  NmrA family protein  35.02 
 
 		 341 aa  169  5e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0269725 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3603  hypothetical protein  32.83 
 
 		 308 aa  89.7  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0184  NmrA family protein  25.61 
 
 		 317 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  43.27 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  42.31 
 
 		 290 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08968  isoflavone reductase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G12510)  22.68 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.547288  normal  0.861048 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  38.89 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  39.42 
 
 		 290 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  37.08 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1791  NmrA family protein  27.93 
 
 		 302 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0884  hopanoid-associated sugar epimerase  34.29 
 
 		 329 aa  50.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000222195 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.64 
 
 		 328 aa  50.4  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0479  NmrA family protein  29.63 
 
 		 289 aa  50.4  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2728  hypothetical protein  31.62 
 
 		 213 aa  49.7  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.763149  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  36.7 
 
 		 284 aa  50.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.91 
 
 		 339 aa  49.7  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  46.97 
 
 		 287 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  46.97 
 
 		 287 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  46.97 
 
 		 287 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54690  hypothetical protein  36.45 
 
 		 213 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347798  hitchhiker  0.00000151278 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  35.71 
 
 		 349 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1077  isoflavone reductase  25.67 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08354  NmrA-like family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00230)  29.3 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.62 
 
 		 342 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6810  NmrA family protein  23.9 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  41.43 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3361  hopanoid-associated sugar epimerase  35.19 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2727  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.96 
 
 		 340 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430894  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08970  oxidoreductase CipA-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12460)  30.48 
 
 		 297 aa  47.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000000202383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2562  NmrA-like protein  26.91 
 
 		 310 aa  47.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4574  NmrA family protein  25.26 
 
 		 317 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0136155 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4834  NmrA family protein  24.91 
 
 		 317 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.596306 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.29 
 
 		 328 aa  47  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  24.75 
 
 		 304 aa  47  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.49 
 
 		 270 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5287  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 350 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  38.03 
 
 		 303 aa  46.6  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.012562 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.27 
 
 		 338 aa  46.6  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4779  hypothetical protein  35.51 
 
 		 213 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421738  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03993  NmrA-like family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11770)  29.85 
 
 		 198 aa  46.2  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04608  NmrA family transcriptional regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06920)  21.79 
 
 		 309 aa  46.2  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.113865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 		 328 aa  46.2  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0273473  normal  0.296393 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.3 
 
 		 352 aa  46.2  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000297127  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0801  putative isoflavone oxidoreductase  28.44 
 
 		 315 aa  45.8  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35 
 
 		 203 aa  45.8  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1679  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  37.82 
 
 		 294 aa  45.8  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.165214  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2828  NmrA family protein  36.49 
 
 		 305 aa  45.8  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1217  NmrA family protein  33.9 
 
 		 343 aa  45.8  0.0009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000104302  decreased coverage  0.000138071 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  40.91 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.43 
 
 		 325 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2375  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.65 
 
 		 338 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.14 
 
 		 200 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.4 
 
 		 219 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.74 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06668  conserved hypothetical protein  23.71 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000106113  normal  0.0892727 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.09 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  34.95 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0242  saccharopine dehydrogenase related protein  27.78 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32445  predicted protein  25.54 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.176138 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60459  predicted protein  25.97 
 
 		 296 aa  45.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.185541 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2013  NmrA family protein  40.3 
 
 		 285 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  37.18 
 
 		 321 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  31.82 
 
 		 340 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1458  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.56 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000901734  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  34 
 
 		 283 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.85 
 
 		 223 aa  44.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207414  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  31.82 
 
 		 328 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.37 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.73 
 
 		 355 aa  44.3  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.51 
 
 		 336 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_47864  predicted protein  24.39 
 
 		 314 aa  43.9  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 		 348 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  26.62 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1529  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  50 
 
 		 500 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23800  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  32.99 
 
 		 937 aa  43.9  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6315  NmrA family protein  39.34 
 
 		 312 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2429  oxidoreductase protein  30 
 
 		 298 aa  43.9  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.37 
 
 		 320 aa  43.5  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0325  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.86 
 
 		 288 aa  43.9  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00224359  hitchhiker  9.32819e-17 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.41 
 
 		 213 aa  43.5  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  39.74 
 
 		 293 aa  43.5  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.51 
 
 		 209 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  33.62 
 
 		 342 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  44.83 
 
 		 276 aa  43.9  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2988  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.69 
 
 		 340 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.865432  normal  0.0888549 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  31.9 
 
 		 294 aa  43.5  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2604  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.16 
 
 		 324 aa  43.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  24.49 
 
 		 327 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.24 
 
 		 241 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.550134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4232  hypothetical protein  36.99 
 
 		 203 aa  43.5  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  25.64 
 
 		 332 aa  43.1  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1328  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.86 
 
 		 329 aa  43.1  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0300237  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1033  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.9 
 
 		 332 aa  43.1  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.19855 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>