119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2420 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.01 
 
 		 722 aa  680    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  100 
 
 		 764 aa  1596    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  57.5 
 
 		 797 aa  852    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  60.29 
 
 		 757 aa  966    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  56.6 
 
 		 764 aa  894    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  65.71 
 
 		 758 aa  1057    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  37.43 
 
 		 761 aa  454  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  38.61 
 
 		 748 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  42.11 
 
 		 641 aa  327  5e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  38.57 
 
 		 784 aa  281  4e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.77 
 
 		 600 aa  224  4.9999999999999996e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2340  hypothetical protein  34.28 
 
 		 763 aa  197  8.000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  26.87 
 
 		 457 aa  110  8.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  27.1 
 
 		 466 aa  106  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  26 
 
 		 435 aa  103  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  27.21 
 
 		 423 aa  100  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  24.53 
 
 		 464 aa  100  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1630  FAD dependent oxidoreductase  23.82 
 
 		 421 aa  92.8  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  27.05 
 
 		 448 aa  92.4  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  23.78 
 
 		 445 aa  93.2  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  37.68 
 
 		 475 aa  87.4  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  25.55 
 
 		 672 aa  87  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.3 
 
 		 472 aa  84  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0163  hypothetical protein  34.56 
 
 		 459 aa  80.1  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  33.77 
 
 		 432 aa  80.1  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4522  FAD dependent oxidoreductase  27.45 
 
 		 443 aa  79  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.682037  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  35.25 
 
 		 582 aa  78.6  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  25.55 
 
 		 624 aa  78.2  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3216  FAD dependent oxidoreductase  25.64 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000545422  normal  0.274054 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  33.33 
 
 		 606 aa  77.4  0.0000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  32.86 
 
 		 491 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  37.68 
 
 		 531 aa  75.1  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  37.84 
 
 		 457 aa  74.3  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  24.89 
 
 		 454 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  29.13 
 
 		 599 aa  73.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  22.29 
 
 		 459 aa  72.8  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3248  FAD dependent oxidoreductase  26.14 
 
 		 451 aa  70.9  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  35.16 
 
 		 453 aa  69.7  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8047  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 441 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  23.84 
 
 		 619 aa  68.6  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1475  hypothetical protein  27 
 
 		 478 aa  67.8  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  32.33 
 
 		 445 aa  67  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0949  FAD dependent oxidoreductase  24.04 
 
 		 457 aa  66.6  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000456449  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  33.05 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  31.3 
 
 		 600 aa  64.3  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  37.96 
 
 		 444 aa  63.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00733964  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0878  hypothetical protein  22.6 
 
 		 421 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2584  FAD dependent oxidoreductase  24.61 
 
 		 457 aa  63.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220749  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3652  hypothetical protein  30.07 
 
 		 440 aa  62  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  24.26 
 
 		 621 aa  62  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  25.67 
 
 		 549 aa  60.8  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0117  HI0933 family protein  31.64 
 
 		 483 aa  60.5  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.19867  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5110  FAD dependent oxidoreductase  34.96 
 
 		 454 aa  58.9  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0801597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3446  FAD dependent oxidoreductase  30.26 
 
 		 537 aa  59.3  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0712  FAD dependent oxidoreductase  32.17 
 
 		 460 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0113421  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6222  FAD dependent oxidoreductase  35.35 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1170  hypothetical protein  27.33 
 
 		 457 aa  57  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  25.83 
 
 		 584 aa  57.4  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  28.17 
 
 		 514 aa  57  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  25.83 
 
 		 584 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2295  glucose-inhibited division protein A  35.19 
 
 		 465 aa  56.6  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0287  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.3 
 
 		 461 aa  56.6  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1335  FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 		 446 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  23.98 
 
 		 456 aa  55.5  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6391  FAD dependent oxidoreductase  34.34 
 
 		 441 aa  55.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6624  FAD dependent oxidoreductase  34.34 
 
 		 411 aa  55.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.678133 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0108  hypothetical protein  28.87 
 
 		 668 aa  54.3  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0893554 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  25.21 
 
 		 595 aa  53.5  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0835  hypothetical protein  32.77 
 
 		 696 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3278  FAD dependent oxidoreductase  32.98 
 
 		 445 aa  53.9  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0393612  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  28.1 
 
 		 618 aa  53.5  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0863  hypothetical protein  32.48 
 
 		 696 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.656039 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3103  secreted protein  29.25 
 
 		 531 aa  52.4  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3311  FAD dependent oxidoreductase  26.21 
 
 		 468 aa  51.6  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1335  hypothetical protein  26.14 
 
 		 595 aa  50.8  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0432267 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14761  hypothetical protein  27.45 
 
 		 601 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.1592 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3971  hypothetical protein  28.35 
 
 		 595 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000911124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  42.11 
 
 		 598 aa  50.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3674  membrane protein  29.11 
 
 		 437 aa  50.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.912553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  25.81 
 
 		 530 aa  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0190  hypothetical protein  28.24 
 
 		 669 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.474919  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3078  hypothetical protein  29.46 
 
 		 691 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.46062 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1299  secreted protein  31.75 
 
 		 549 aa  50.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  43.86 
 
 		 598 aa  49.7  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0194  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 		 534 aa  49.3  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1809  putative secreted protein  27.33 
 
 		 527 aa  48.5  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4711  secreted protein-putative xanthan lyase related  29.85 
 
 		 547 aa  48.9  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0977  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  51.28 
 
 		 561 aa  47.8  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3972  hypothetical protein  26.57 
 
 		 595 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000648751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4473  hypothetical protein  25.33 
 
 		 568 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.302672 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2074  hypothetical protein  25.29 
 
 		 706 aa  47  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.838738  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  24.77 
 
 		 595 aa  46.2  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2084  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  51.11 
 
 		 1014 aa  46.6  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00141565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  34.67 
 
 		 556 aa  46.2  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  40.35 
 
 		 596 aa  46.2  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1447  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  51.16 
 
 		 1012 aa  46.6  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2807  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  51.16 
 
 		 1012 aa  46.6  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  29.31 
 
 		 680 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5943  putative xanthan lyase  25.56 
 
 		 543 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  40 
 
 		 519 aa  45.8  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>