207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_34810 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_34810  formate/nitrite transporter family protein  100 
 
 		 283 aa  561  1.0000000000000001e-159  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1449  formate/nitrite transporter  65.73 
 
 		 298 aa  382  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.748577  normal  0.576318 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0288  formate/nitrite transporter  35.93 
 
 		 281 aa  161  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0295  formate/nitrite transporter  35.93 
 
 		 281 aa  161  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1997  formate/nitrite transporter family protein  30.85 
 
 		 273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  32.17 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2427  formate/nitrite transporter  29.59 
 
 		 274 aa  112  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000401704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2475  formate/nitrite transporter  29.59 
 
 		 274 aa  112  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000187087  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3985  formate/nitrite transporter family protein  31.54 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1421  formate/nitrite transporter family protein  30.12 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1359  formate/nitrite transporter family protein  30.56 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1397  formate/nitrite transporter family protein  30.5 
 
 		 283 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1222  formate/nitrite transporter family protein  30.5 
 
 		 283 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109703  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1199  formate/nitrite transporter family protein  30.5 
 
 		 283 aa  106  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1201  formate/nitrite transporter family protein  30.5 
 
 		 283 aa  106  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161928  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1321  formate/nitrite transporter family protein  30.5 
 
 		 283 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1223  formate/nitrite transporter  29.74 
 
 		 283 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1461  formate/nitrite transporter family protein  29.73 
 
 		 283 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1035  formate/nitrite transporter  31.09 
 
 		 277 aa  102  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0716  formate/nitrite transporter  30.3 
 
 		 270 aa  97.8  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.653028  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1429  nitrite transporter  27.99 
 
 		 265 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198898  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1695  formate/nitrite transporter  27.99 
 
 		 265 aa  92  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0645091  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3240  formate/nitrite transporter  30.96 
 
 		 274 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.532711  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0182  formate/nitrite transporter  31.32 
 
 		 282 aa  89.7  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2227  formate/nitrite transporter  31.18 
 
 		 289 aa  89  7e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0089  formate/nitrite transporter family protein  28.69 
 
 		 252 aa  88.2  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2826  formate/nitrate transporter  32.2 
 
 		 269 aa  87.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.189736  hitchhiker  0.00104508 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0703  formate/nitrite transporter  29.35 
 
 		 270 aa  86.3  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3480  formate/nitrite transporter  32.1 
 
 		 288 aa  85.9  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3728  formate/nitrite transporter  29.79 
 
 		 270 aa  85.9  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.881486  hitchhiker  0.000165735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1243  formate/nitrite transporter  30.68 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1131  formate/nitrite transporter  30.68 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000071  nitrite transporter from formate/nitrite family  28.93 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0800  formate/nitrite transporter  25.58 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02558  Formate/nitrite transporter  31.48 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2846  formate/nitrite transporter  31.2 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0611  formate/nitrite transporter  26.42 
 
 		 275 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0546  formate/nitrite transporter  26.89 
 
 		 274 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0683482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0331  formate/nitrite transporter  31.62 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0784  formate/nitrite transporter  28.47 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1084  formate/nitrite transporter family protein  29.32 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.350742  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0819  formate/nitrite transporter  29.96 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225898  normal  0.0203602 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1110  formate/nitrite transporter  28.96 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3165  formate/nitrite transporter  28.79 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000339601  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1943  putativel formate transporter  29.63 
 
 		 281 aa  75.5  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.466004  normal  0.753963 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1373  formate/nitrite transporter  25.18 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0074  formate/nitrite transporter  28.7 
 
 		 285 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0581  formate/nitrite transporter  25.59 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  26.36 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2663  formate/nitrite transporter  26.43 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000134322  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0292  formate/nitrite transporter  25.94 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0248284  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  29.52 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0796  formate/nitrite transporter  28.44 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  24.68 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2756  formate/nitrite transporter  30.18 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  28.78 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0075  formate/nitrite transporter  28.83 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00341405  normal  0.480537 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7925  formate/nitrite transporter  30.14 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.295053  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  24.31 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  29.41 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  32.83 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1736  formate/nitrite transporter  29.96 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3614  formate/nitrite transporter  28.63 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.568549  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  31.02 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1054  formate/nitrate transporter  25.32 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000464668  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1862  formate/nitrite transporter  27.56 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33420  formate/nitrite transporter family protein  30.69 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.375482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  26.29 
 
 		 558 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3067  formate/nitrite transporter  29.43 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.962754  normal  0.623416 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4450  formate/nitrite transporter  28.7 
 
 		 285 aa  65.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2136  formate/nitrite transporter  30.77 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3185  formate/nitrite transporter  29.1 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0135134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3006  formate/nitrite transporter  30.2 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3748  nitrite transporter NirC  28.63 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.373246 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3674  nitrite transporter NirC  28.63 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2242  formate/nitrite transporter  27.27 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.57128  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1071  formate/nitrite transporter  27.03 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4597  nitrite transporter NirC  27.78 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2879  formate/nitrite transporter  29.5 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.583143  normal  0.245539 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3674  nitrite transporter NirC  28.23 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.721979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3845  nitrite transporter NirC  27.89 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3783  nitrite transporter NirC  27.89 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1956  putative formate transporter 1  24.15 
 
 		 286 aa  62  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2344  formate/nitrite transporter  26.82 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  25.28 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  26.29 
 
 		 483 aa  61.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1703  formate transporter  26.36 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.57542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  29.05 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3795  nitrite transporter NirC  26.59 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1691  formate/nitrite transporter  30.94 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.516822 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  26.91 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00908  formate transporter  26.41 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.839413  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1001  formate transporter  26.41 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.304412  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2739  formate/nitrite transporter  26.41 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.851182  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2217  formate transporter  26.41 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.594776 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2692  formate transporter  26.41 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00915  hypothetical protein  26.41 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656334  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0716  formate/nitrite transporter  29.55 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.991345  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1621  formate/nitrite transporter  26.6 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  25.21 
 
 		 537 aa  60.1  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>