More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_19010 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0995  ABC transporter related  64.45 
 
 		 550 aa  647    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0452  ABC transporter related  70.29 
 
 		 544 aa  705    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15449  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0923  ABC transporter related  67.7 
 
 		 553 aa  688    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19010  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  100 
 
 		 555 aa  1086    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0660652 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1055  ABC transporter related  68.17 
 
 		 542 aa  687    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5678  ABC transporter related  64.58 
 
 		 553 aa  648    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5299  ABC transporter related  64.58 
 
 		 553 aa  648    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121259  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2215  ABC transporter related  66 
 
 		 545 aa  686    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242507  normal  0.0157835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6901  ABC transporter, ATP-binding protein  65.64 
 
 		 545 aa  679    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0806  ABC transporter related  68.71 
 
 		 569 aa  697    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  66.07 
 
 		 550 aa  679    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5388  ABC transporter related  64.58 
 
 		 553 aa  648    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.378232 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5841  ABC transporter-related protein  65.35 
 
 		 548 aa  651    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.334221  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4164  ABC transporter related protein  67.99 
 
 		 544 aa  630  1e-179  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.226942  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0507  ABC transporter related protein  65.17 
 
 		 549 aa  616  1e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3420  ABC transporter related protein  63.35 
 
 		 554 aa  613  9.999999999999999e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.859354  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0053  ABC transporter related protein  66.91 
 
 		 548 aa  614  9.999999999999999e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00894848 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4909  ABC transporter related  55.38 
 
 		 551 aa  519  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00241613 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2670  ABC transporter related  55.76 
 
 		 537 aa  507  9.999999999999999e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.205252  normal  0.299253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0493  ABC transporter related  53.96 
 
 		 537 aa  485  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5697  ABC transporter related protein  42.59 
 
 		 543 aa  303  4.0000000000000003e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0453  ABC transporter related protein  33.03 
 
 		 552 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  36.29 
 
 		 564 aa  266  8e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  34.04 
 
 		 575 aa  261  3e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  35.23 
 
 		 668 aa  259  7e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  35.63 
 
 		 567 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  34.82 
 
 		 540 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  34.17 
 
 		 581 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  34.64 
 
 		 540 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  35.06 
 
 		 659 aa  253  5.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  33.57 
 
 		 545 aa  251  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  33.39 
 
 		 709 aa  249  1e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  31.23 
 
 		 659 aa  248  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  31.28 
 
 		 658 aa  248  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  33.51 
 
 		 544 aa  248  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  31.46 
 
 		 658 aa  248  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  31.1 
 
 		 644 aa  248  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  31.1 
 
 		 658 aa  248  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  31.1 
 
 		 644 aa  248  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  31.34 
 
 		 634 aa  247  3e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  33.33 
 
 		 543 aa  247  4e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  31.1 
 
 		 658 aa  247  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  30.73 
 
 		 544 aa  247  4.9999999999999997e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  31.1 
 
 		 662 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  31.1 
 
 		 658 aa  247  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  30.92 
 
 		 640 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  34.41 
 
 		 543 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  32.37 
 
 		 659 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  33.39 
 
 		 549 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  34.72 
 
 		 540 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  35.37 
 
 		 569 aa  244  3e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  35.36 
 
 		 548 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  34.94 
 
 		 632 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  34.32 
 
 		 540 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  32.16 
 
 		 644 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  34.68 
 
 		 564 aa  243  6e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  35.82 
 
 		 548 aa  243  7e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  32.72 
 
 		 672 aa  242  1e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0741  ABC transporter related  30.78 
 
 		 545 aa  241  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0595182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  34.74 
 
 		 560 aa  241  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  35.63 
 
 		 548 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  35.47 
 
 		 545 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  34.15 
 
 		 540 aa  240  5e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  33.02 
 
 		 767 aa  240  5.999999999999999e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  34.15 
 
 		 540 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02481  ABC transporter, ATP binding component  33.9 
 
 		 574 aa  239  8e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  38.32 
 
 		 535 aa  239  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50537  predicted protein  33.59 
 
 		 879 aa  238  2e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.437528  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  33.1 
 
 		 636 aa  238  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  31.27 
 
 		 630 aa  237  4e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01571  ABC transporter, ATP binding component  32.08 
 
 		 572 aa  237  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1455  ABC transporter ATP-binding protein  31.81 
 
 		 572 aa  236  6e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  33.51 
 
 		 690 aa  236  6e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1763  ABC transporter, ATP-binding protein  30.76 
 
 		 546 aa  236  8e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208486  normal  0.0362941 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  28.44 
 
 		 634 aa  236  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  34.69 
 
 		 540 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0996  ABC transporter related  32.77 
 
 		 536 aa  234  2.0000000000000002e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.99181  normal  0.725541 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  32.56 
 
 		 632 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  34.79 
 
 		 667 aa  234  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  31.91 
 
 		 666 aa  234  4.0000000000000004e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  31.03 
 
 		 646 aa  233  5e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  30.36 
 
 		 632 aa  233  5e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26480  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  35.75 
 
 		 539 aa  233  7.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.460594  normal  0.379064 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1233  ABC transporter related  34.58 
 
 		 659 aa  233  8.000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.632204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  36.04 
 
 		 541 aa  233  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  31.93 
 
 		 640 aa  232  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  33.52 
 
 		 641 aa  232  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  32.91 
 
 		 641 aa  232  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  31.43 
 
 		 630 aa  232  1e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3997  ABC transporter related  31.85 
 
 		 641 aa  232  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  31.82 
 
 		 639 aa  232  1e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  32.22 
 
 		 545 aa  231  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1093  ABC transporter related  32.46 
 
 		 634 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  28.18 
 
 		 536 aa  231  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  30.56 
 
 		 638 aa  230  4e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5108  ABC transporter, ATP-binding protein  31.09 
 
 		 517 aa  230  5e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  28.39 
 
 		 541 aa  230  5e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  32.21 
 
 		 542 aa  230  6e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  28.39 
 
 		 541 aa  229  7e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  31.75 
 
 		 636 aa  229  8e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>