154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3263 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0918  aculeacin A acylase  95.79 
 
 		 855 aa  1707    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0760  peptidase S45, penicillin amidase  98.95 
 
 		 855 aa  1752    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3263  peptidase S45, penicillin amidase  100 
 
 		 855 aa  1767    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0771  peptidase S45, penicillin amidase  80.12 
 
 		 860 aa  1426    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  99.18 
 
 		 855 aa  1755    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.635154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2773  aculeacin A acylase  75.71 
 
 		 852 aa  1320    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00542255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0764  peptidase S45, penicillin amidase  93.08 
 
 		 854 aa  1664    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0860  peptidase S45, penicillin amidase  92.03 
 
 		 854 aa  1642    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01895  penicillin acylase-like protein  50.18 
 
 		 841 aa  795    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21085  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3553  peptidase S45 penicillin amidase  92.97 
 
 		 854 aa  1660    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0136  peptidase S45 penicillin amidase  33.86 
 
 		 793 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.122956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2825  peptidase S45 penicillin amidase  33.62 
 
 		 795 aa  402  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2419  peptidase S45 penicillin amidase  33.17 
 
 		 795 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2563  peptidase S45, penicillin amidase  32.6 
 
 		 778 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.387542  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2161  penicillin amidase family protein  33.71 
 
 		 773 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498223  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3685  peptidase S45 penicillin amidase  32.34 
 
 		 824 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3778  peptidase S45, penicillin amidase  34.41 
 
 		 779 aa  386  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2063  peptidase S45 penicillin amidase  34.5 
 
 		 779 aa  386  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.530766  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2876  acylase  32.89 
 
 		 760 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181315  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2901  penicillin amidase family protein  33 
 
 		 772 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.736989 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2790  peptidase S45, penicillin amidase  33 
 
 		 763 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.311234 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1971  peptidase S45, penicillin amidase  32.12 
 
 		 779 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33820  penicillin acylase-related protein  32.88 
 
 		 762 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00307751  normal  0.0883584 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2547  aculeacin A acylase transmembrane protein  33.25 
 
 		 795 aa  372  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4860  acyl-homoserine lactone acylase  32.2 
 
 		 804 aa  372  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357957  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2882  peptidase S45 penicillin amidase  33 
 
 		 769 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2403  peptidase S45 penicillin amidase  31.64 
 
 		 770 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.52163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25350  acyl-homoserine lactone acylase, PvdQ-like protein  31.16 
 
 		 737 aa  355  2.9999999999999997e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2448  peptidase S45, penicillin amidase  30.16 
 
 		 819 aa  342  2e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2441  peptidase S45 penicillin amidase  31.34 
 
 		 814 aa  334  4e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.708556  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1140  peptidase S45, penicillin amidase  31.99 
 
 		 805 aa  326  1e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  0.229861 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3480  peptidase S45 penicillin amidase  30.88 
 
 		 816 aa  322  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.996259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4390  peptidase S45, penicillin amidase  32.93 
 
 		 773 aa  320  7e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0446871  normal  0.0863607 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3883  peptidase S45 penicillin amidase  29.98 
 
 		 842 aa  313  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.513553  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1333  peptidase S45, penicillin amidase  30.22 
 
 		 799 aa  290  5.0000000000000004e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.222758  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3338  peptidase S45, penicillin amidase  29.65 
 
 		 789 aa  268  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378065  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0589  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  23.14 
 
 		 694 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2434  peptidase S45 penicillin amidase  23.49 
 
 		 674 aa  163  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3676  peptidase S45 penicillin amidase  23.23 
 
 		 708 aa  160  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5764  peptidase S45 penicillin amidase  24.19 
 
 		 725 aa  147  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2388  penicillin amidase  25.68 
 
 		 718 aa  135  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.159151 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3571  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  22.22 
 
 		 712 aa  134  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111745  normal  0.0870635 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0937  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  22.7 
 
 		 724 aa  115  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.844114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1171  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  21.59 
 
 		 701 aa  97.1  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.312808  normal  0.0841772 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  25.15 
 
 		 809 aa  94.7  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  25.79 
 
 		 809 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1089  penicillin amidase family protein  23.41 
 
 		 761 aa  91.3  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  24.17 
 
 		 769 aa  88.2  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  21.51 
 
 		 796 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  24.62 
 
 		 770 aa  86.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0920  peptidase S45, penicillin amidase  24.24 
 
 		 825 aa  84.3  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  23.13 
 
 		 821 aa  83.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  22.66 
 
 		 843 aa  83.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  25.78 
 
 		 779 aa  82  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  23.9 
 
 		 808 aa  82  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  23.05 
 
 		 796 aa  81.6  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  22.91 
 
 		 818 aa  81.6  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  20.98 
 
 		 796 aa  81.6  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  25.43 
 
 		 787 aa  81.6  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  20.98 
 
 		 796 aa  81.3  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  20.98 
 
 		 796 aa  81.3  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  21.9 
 
 		 796 aa  81.3  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  21.02 
 
 		 796 aa  81.3  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  25.2 
 
 		 810 aa  80.5  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  21.73 
 
 		 796 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  24.49 
 
 		 829 aa  79.7  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  22.76 
 
 		 857 aa  80.1  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  23.06 
 
 		 796 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  20.81 
 
 		 796 aa  79  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  22.56 
 
 		 855 aa  78.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  25 
 
 		 818 aa  78.2  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  24.33 
 
 		 827 aa  77.4  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  25.6 
 
 		 854 aa  76.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  24.13 
 
 		 854 aa  75.9  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  21.2 
 
 		 823 aa  75.9  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3142  penicillin amidase  24.53 
 
 		 812 aa  74.7  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  23.56 
 
 		 813 aa  73.2  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3360  peptidase S45 penicillin amidase  22.13 
 
 		 833 aa  72  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545108  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  21.86 
 
 		 819 aa  71.6  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  23.04 
 
 		 827 aa  71.2  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  20.85 
 
 		 804 aa  71.2  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  23.25 
 
 		 864 aa  70.5  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  23.6 
 
 		 821 aa  69.7  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  25.24 
 
 		 903 aa  70.1  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  24.43 
 
 		 782 aa  68.2  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0200  peptidase S45 penicillin amidase  23.25 
 
 		 742 aa  67.8  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  22.55 
 
 		 839 aa  67.8  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  21.83 
 
 		 817 aa  67.8  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  21.29 
 
 		 806 aa  67  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4469  peptidase S45 penicillin amidase  22.05 
 
 		 738 aa  67.4  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.767372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3892  penicillin amidase  24.63 
 
 		 947 aa  66.6  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  24.63 
 
 		 812 aa  66.6  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  23.09 
 
 		 809 aa  67  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4884  peptidase S45 penicillin amidase  26.9 
 
 		 906 aa  66.6  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4037  peptidase S45 penicillin amidase  25.5 
 
 		 947 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  23.09 
 
 		 809 aa  67  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3996  peptidase S45 penicillin amidase  23.14 
 
 		 947 aa  65.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  23.21 
 
 		 847 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  23.88 
 
 		 803 aa  66.2  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1397  penicillin amidase  21.29 
 
 		 762 aa  64.7  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>