More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2477 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  99.24 
 
 		 397 aa  812    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  90.66 
 
 		 397 aa  731    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  88.38 
 
 		 397 aa  721    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  88.66 
 
 		 397 aa  722    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  88.66 
 
 		 397 aa  723    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  88.16 
 
 		 397 aa  720    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  88.16 
 
 		 397 aa  717    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  100 
 
 		 397 aa  818    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  97.47 
 
 		 397 aa  781    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  74.55 
 
 		 394 aa  614  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  72.73 
 
 		 392 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  72.84 
 
 		 390 aa  599  1e-170  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  75.51 
 
 		 392 aa  600  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  74.55 
 
 		 391 aa  595  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  72.22 
 
 		 392 aa  586  1e-166  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2664  cystathionine gamma-synthase  72.34 
 
 		 393 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  65.46 
 
 		 413 aa  524  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  55.04 
 
 		 393 aa  443  1e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  52.82 
 
 		 392 aa  429  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  51.55 
 
 		 401 aa  427  1e-118  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  50.52 
 
 		 394 aa  420  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  50.39 
 
 		 390 aa  414  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  52.73 
 
 		 400 aa  409  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  50.9 
 
 		 399 aa  396  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  50.52 
 
 		 398 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  48.85 
 
 		 392 aa  392  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  50.52 
 
 		 398 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  49.11 
 
 		 392 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  49.36 
 
 		 392 aa  392  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  49.36 
 
 		 392 aa  392  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  48.85 
 
 		 391 aa  392  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  49.36 
 
 		 392 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  49.36 
 
 		 392 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  48.85 
 
 		 391 aa  389  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  49.62 
 
 		 391 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  49.62 
 
 		 391 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  49.61 
 
 		 396 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  50.13 
 
 		 396 aa  386  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  48.35 
 
 		 397 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  47.96 
 
 		 398 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  49.62 
 
 		 399 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  49.87 
 
 		 418 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  50 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.77 
 
 		 404 aa  371  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.77 
 
 		 404 aa  371  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  45.29 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  48.61 
 
 		 407 aa  367  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  45.67 
 
 		 399 aa  360  3e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  45.08 
 
 		 393 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  45.82 
 
 		 400 aa  352  5.9999999999999994e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  47.52 
 
 		 391 aa  351  1e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.96 
 
 		 393 aa  350  3e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  47.41 
 
 		 398 aa  350  3e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1243  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.04 
 
 		 406 aa  349  4e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0809  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.17 
 
 		 397 aa  346  5e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  41.24 
 
 		 392 aa  346  5e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.27 
 
 		 396 aa  345  1e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1797  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.09 
 
 		 397 aa  343  4e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697099  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1016  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.25 
 
 		 406 aa  342  5e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284664 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  45.62 
 
 		 398 aa  342  7e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1038  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.25 
 
 		 408 aa  339  5e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2665  cystathionine gamma-synthase  42.75 
 
 		 402 aa  339  5e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.6869  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0180  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.35 
 
 		 394 aa  338  9e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.921077 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1086  cystathionine gamma-synthase  43.77 
 
 		 401 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  39.65 
 
 		 397 aa  336  3.9999999999999995e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1198  cystathionine gamma-synthase  42.75 
 
 		 414 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.71 
 
 		 403 aa  335  7e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.09 
 
 		 393 aa  335  7e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0133  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.01 
 
 		 394 aa  335  7.999999999999999e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.765641  normal  0.668156 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1401  cystathionine gamma-synthase  42.09 
 
 		 392 aa  334  2e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.38 
 
 		 392 aa  333  3e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_004310  BR0305  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.77 
 
 		 398 aa  333  4e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.226958  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0318  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.77 
 
 		 401 aa  333  4e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  45.94 
 
 		 401 aa  332  8e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1929  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.68 
 
 		 396 aa  331  1e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0312  methionine gamma-lyase  44.47 
 
 		 386 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0317  Methionine gamma-lyase  44.99 
 
 		 386 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  43.52 
 
 		 377 aa  330  2e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0398  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.22 
 
 		 397 aa  330  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  46.67 
 
 		 426 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  43.93 
 
 		 379 aa  330  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  47.31 
 
 		 386 aa  331  2e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  43.52 
 
 		 377 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0190  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.75 
 
 		 394 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0949182  normal  0.567401 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  43.52 
 
 		 377 aa  330  4e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  42.23 
 
 		 379 aa  329  4e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4382  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.23 
 
 		 394 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258823  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  43.52 
 
 		 377 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  43.52 
 
 		 377 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  45.36 
 
 		 380 aa  329  7e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  43.26 
 
 		 377 aa  328  9e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  43.52 
 
 		 377 aa  328  9e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  43.52 
 
 		 377 aa  328  9e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  44.65 
 
 		 389 aa  328  9e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0316  methionine gamma-lyase  44.73 
 
 		 386 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.24 
 
 		 389 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  43.75 
 
 		 378 aa  327  3e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  44.78 
 
 		 392 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  43.26 
 
 		 377 aa  327  3e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1496  cystathionine gamma-lyase  40.1 
 
 		 390 aa  326  4.0000000000000003e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>