More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1648 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1648  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.575498  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1685  MarR family transcriptional regulator  92.86 
 
 		 196 aa  364  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.402727  normal  0.628244 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2695  transcriptional regulator, MarR family  97.67 
 
 		 172 aa  340  8e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.21037  hitchhiker  0.0000565476 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1663  MarR family transcriptional regulator  98.48 
 
 		 132 aa  264  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2621  MarR family transcriptional regulator  67.41 
 
 		 154 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.276728  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1597  MarR family transcriptional regulator  59.24 
 
 		 160 aa  171  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3365  MarR family transcriptional regulator  57.5 
 
 		 161 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.559351  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2562  MarR family transcriptional regulator  62.77 
 
 		 156 aa  168  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1578  MarR family transcriptional regulator  56.72 
 
 		 141 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0267314 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1517  MarR family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 141 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  0.0147514 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1584  MarR family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 141 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119163  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 165 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 165 aa  129  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 165 aa  128  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  47.1 
 
 		 165 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 165 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  44.3 
 
 		 163 aa  125  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  40.85 
 
 		 143 aa  124  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  47.68 
 
 		 158 aa  124  6e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  40.56 
 
 		 152 aa  124  8.000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  40.71 
 
 		 154 aa  121  8e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 168 aa  121  8e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  46.21 
 
 		 150 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  41.3 
 
 		 154 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 161 aa  119  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 154 aa  119  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 152 aa  118  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  40.4 
 
 		 166 aa  117  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 144 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 178 aa  115  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 151 aa  115  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 147 aa  115  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  46.51 
 
 		 147 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 163 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 152 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  41.55 
 
 		 151 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  47.93 
 
 		 151 aa  112  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  44.19 
 
 		 155 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0374  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 140 aa  112  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00135193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  45.31 
 
 		 153 aa  112  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 151 aa  111  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 151 aa  111  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  38.67 
 
 		 157 aa  110  9e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  40 
 
 		 157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0840  transcriptional regulator, MarR family  40.3 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.779945  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  41.54 
 
 		 167 aa  108  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 185 aa  109  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  40.44 
 
 		 166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 146 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 144 aa  107  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 155 aa  107  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  45 
 
 		 147 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 158 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  45 
 
 		 147 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  42.03 
 
 		 161 aa  106  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  43.41 
 
 		 153 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 154 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 151 aa  106  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 153 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 149 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 151 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  44.35 
 
 		 151 aa  104  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  40.68 
 
 		 158 aa  104  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 166 aa  104  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  47.62 
 
 		 143 aa  103  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  38.81 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0421  MarR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 150 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0670441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 147 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  37.59 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 170 aa  102  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 159 aa  102  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 151 aa  101  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  46.85 
 
 		 153 aa  101  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  40.77 
 
 		 150 aa  101  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  43.93 
 
 		 159 aa  101  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  37.41 
 
 		 152 aa  101  7e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  38.67 
 
 		 162 aa  101  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  46.85 
 
 		 153 aa  101  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 171 aa  101  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  44.74 
 
 		 152 aa  101  7e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  41.6 
 
 		 156 aa  101  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 160 aa  101  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 149 aa  100  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  44.86 
 
 		 152 aa  100  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  43.41 
 
 		 146 aa  100  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0818  transcriptional regulator, MarR family  42.5 
 
 		 147 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 150 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 150 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 267 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 150 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  43.59 
 
 		 150 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 150 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 150 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>