More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_28190 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_28190  amidohydrolase  100 
 
 		 378 aa  780    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000108977  normal  0.832169 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2667  peptidase M20D, amidohydrolase  37.27 
 
 		 404 aa  232  9e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  35.68 
 
 		 405 aa  231  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  35.88 
 
 		 405 aa  229  9e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0678  amidohydrolase  37.07 
 
 		 394 aa  223  6e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000231632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  34.12 
 
 		 396 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  35.11 
 
 		 386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  34.37 
 
 		 397 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  33.86 
 
 		 396 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0719  peptidase M20D, amidohydrolase  35 
 
 		 387 aa  219  8.999999999999998e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.093275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  34.93 
 
 		 397 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  34.75 
 
 		 403 aa  218  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  35 
 
 		 388 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  37.13 
 
 		 393 aa  216  4e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  35.6 
 
 		 404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3289  peptidase M20D, amidohydrolase  34.74 
 
 		 387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  34.13 
 
 		 405 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  33.77 
 
 		 389 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  33.78 
 
 		 387 aa  213  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  34.42 
 
 		 388 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1675  amidohydrolase  34.56 
 
 		 390 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  34.68 
 
 		 387 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  34.95 
 
 		 388 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  34.95 
 
 		 388 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  33.59 
 
 		 396 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  34.74 
 
 		 390 aa  213  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  35.35 
 
 		 465 aa  212  7e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  34.15 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  33.25 
 
 		 403 aa  211  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  34.95 
 
 		 403 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  34.67 
 
 		 386 aa  210  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2260  putative amidohydrolase family protein  33.51 
 
 		 390 aa  210  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  33.96 
 
 		 387 aa  209  4e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  33.69 
 
 		 387 aa  209  5e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  33.69 
 
 		 384 aa  209  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  34.95 
 
 		 403 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  34.85 
 
 		 465 aa  209  6e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  31.2 
 
 		 387 aa  209  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  36.88 
 
 		 400 aa  209  7e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  34.2 
 
 		 390 aa  209  8e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  32.56 
 
 		 402 aa  208  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  34.51 
 
 		 388 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5073  amidohydrolase  33.7 
 
 		 387 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.546308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  33.69 
 
 		 387 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  35.51 
 
 		 408 aa  207  3e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  31.91 
 
 		 396 aa  206  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  30.67 
 
 		 387 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  35.6 
 
 		 415 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  35.6 
 
 		 415 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  35.6 
 
 		 396 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0069  peptidase M20D, amidohydrolase  34.4 
 
 		 384 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0718  peptidase M20D, amidohydrolase  32.63 
 
 		 390 aa  206  5e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.178083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  35.17 
 
 		 396 aa  206  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  33.69 
 
 		 387 aa  206  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  33.16 
 
 		 390 aa  206  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0245  amidohydrolase  34.48 
 
 		 388 aa  206  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0044  peptidase M20D, amidohydrolase  32.37 
 
 		 385 aa  206  8e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  35.15 
 
 		 379 aa  205  9e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  32.11 
 
 		 397 aa  205  9e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  33.58 
 
 		 466 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  31.73 
 
 		 387 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  35.17 
 
 		 399 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  32.98 
 
 		 390 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  33.33 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  33.16 
 
 		 395 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4873  amidohydrolase  32.97 
 
 		 389 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.458115 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3941  carboxypeptidase  34.41 
 
 		 470 aa  204  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  33.07 
 
 		 397 aa  203  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1488  amidohydrolase  32.35 
 
 		 383 aa  203  5e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0910625  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1459  amidohydrolase  32.35 
 
 		 383 aa  203  5e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  31.77 
 
 		 399 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  32.57 
 
 		 437 aa  202  8e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  34.38 
 
 		 405 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  32.89 
 
 		 389 aa  202  9e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5885  amidohydrolase  34.58 
 
 		 449 aa  202  9e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  31.13 
 
 		 404 aa  202  9e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5628  amidohydrolase  33.77 
 
 		 394 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509819  hitchhiker  0.00594833 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5231  peptidase M20D, amidohydrolase  33.77 
 
 		 394 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0968  amidohydrolase family protein  32.09 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3523  peptidase M20D, amidohydrolase  33.69 
 
 		 385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  30.57 
 
 		 397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  34.66 
 
 		 407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4601  amidohydrolase  33.42 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0856359  hitchhiker  0.00046008 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  30.85 
 
 		 398 aa  200  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  34.77 
 
 		 399 aa  200  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  31.88 
 
 		 406 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3241  peptidase M20D, amidohydrolase  35.19 
 
 		 391 aa  200  3.9999999999999996e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0177418  normal  0.343736 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  34.14 
 
 		 388 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  32.63 
 
 		 388 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  34.3 
 
 		 391 aa  199  5e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  32.36 
 
 		 389 aa  199  6e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1291  peptidase M20D, amidohydrolase  33.06 
 
 		 391 aa  199  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.214577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  33.16 
 
 		 390 aa  199  6e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  32.93 
 
 		 465 aa  199  7e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  34.44 
 
 		 471 aa  199  7e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  35.12 
 
 		 408 aa  199  7e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  33.68 
 
 		 408 aa  199  7e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  33.68 
 
 		 408 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  32.38 
 
 		 400 aa  199  7.999999999999999e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  33.25 
 
 		 382 aa  199  9e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>